SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000391_2.0
Identity
PromoterSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Promoter IDSPR00000391
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000326_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000391_2.0 # Promoter # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Marmoset (Callithrix jacchus) Full length # Forward
GAAAAGCGTGGTAATTTCTATCTAAATAACTTGTTGGTAGATTTACTTACTCTGTAAATC
TGAAAGAAAAGGTACAAAAGCACTATATTTCTCTTTGAGAATAATCAATATAGAAGATAG
AAATAAGATAACAGATTTATTTGTAGAGCTTTAAAAGTTAGATGTTAAAGCAGCATTTCA
AGAATGTGGGTGATAACTGGTAAGAACTACTAAAAGTCACCATATAGTTCACTGGAATTG
GTAAAAACTGTACAAATTATGGTAGTAACCTATGACTTGGTGGCTTTAAGGCAATCGAAC
AACATAATAGAATTTTTCTGAGGCCCACTTTGCCCTGCAAATAAATTGGTACTTAAATAA
CCAGCCACAGACTAAATTTAAGTTGATGATGGCTTGGTGCTTATAATGGGTTAGGCATTC
AGTTTACTGTGTCTGAATGTGACCATATTGCACCTCATTCATTGCTAGCCAGCTGACTCA
GACAGATATCTTAACACTGGTAAAAAATTTGGGCTCGTGGTTATAAAGTATAAAACAGTT
AAAAACTGTTACTACTTCTGGAGATGGTCGATATGGGGCCGAGAATTGTGACTTTATTTA
TAAAGTCCTTTTTAATGATAATTGAGTAAAAATTCTTATTCAATTTGAAAAGATTCATTT
GGCAAATCTTTGACAAAATGCTGTGGGATGCTATTAACAATGATTTGTTTTTGAGAATTT
CATAAGGCTACAATTGTACATATTGATGGTTTAACTTTGAAGGTTATTCCATGCTTGCCT
AAGAAACTGAACAATGTAAATTTTGGATATAAGTCAGTAAGTTAACTGGAAAACTGAGGT
TGCAAACAATGTGTATGTGCAGTTAGTGGTTTTCTGTTTTTAATATTGTATAAAGCAACT
TCTGGAGCATACAAGGACTAGTAGCTACTACAAAGCTATGTTGAGTAAGAGGAAACCCAA
ATTAACTGTAACAGACTTTTTCCTTACATAAAAATCTAATAATGTGGGGCAGGGATAACA
GCTCTACAGCCAGGGACTAGGCTGGATCCTTACCTCGTTGCTTTACCATTCTCAATTTAC
AGTGGCTTCTATGGTCCTGGATTCCTGCTCTGGCTCCCTTATCATATTAATGTGCATTCA
ACAAGAAGGAAAAAGAGTTCAGCATGTTCTTTACCTTTGAGAACACTTTCCACATAAGTT
AAATATTTTCTTACATCTTGTTGGCTTATGACTTGGCGGCTGGTAACCATATGCTCAGCT
TATATTTTGAGGTTCTATTCCTGAAGATTAAGGAAACTAGTAAGCATTCTGTTAAGAGAA
AATAATTAATCCTAAGGAAAATGCCTTCTGCTTTTGAATTGTGCACTCTTAGCTCCCTAA
TTTGAACACAGGCCATCACAAATTAGAATTATAGGTAGTAGAGTGTAGTTCTCAATATTA
AAGCAACATAGAGTTGCTAAAGGTACATGTATAAAGAGACAATTGTAGACAAGGAACTGG
ACTAATACTTGACTATATCTTTTAACAGGCATGTTATGTTACCCAGAGAACTTTCCAAAC
AAGTACCTAAAACTCATCTGATGTCTGAAGAGGAGTGGAGGAGACTTGGTGTCCAACAGA
GTCTAGGCTGGGTTCATTACATGATTCATGAGCCAGGTAAGCTTTGCTATATTATAGTAA
AAGCACTAATTGTTGAAATATTGGTATGGCTATCAGAATTTTTAAAATATTGACGTTGAA
TGATACCTCAAAGTAACTCTTCTGATTGATGGTTCTTTGGGTTTATTTTTATTTTTATTT
TTTTGAGACGGAGTCTTGTTCTGTCTCCGAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTC
ACTGTAATCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTGTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGTAG
CTGGGACTATAGGTAAGTGCTGCCACGCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTT
TAGTAGAGATGGGATTTTACTGTGTTGACCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCTTGAT
CTGTCCACTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGTTACAGGCATGAGCCCTGGCACGCAGCCTT
GACTGTTTTTTAACTGACTAATTTCTTGACGCTGGAGAGAGTTCCAATTTTCTGGTAAAT
AAAATACCACAGGAGTGAAAGTAATGCATTATTCTACTTGAAAAATCATGTAAAAAGTAA
ATTTTGAAAAATATATATGTTTTAAAATCTGTATCATCGTTGATAGTAAGTATCCCGAAG
CATTTTACTATAAATACATCCTAAGACAAGTGTTCTTTTCTATGTGTGGATATCGATTTA
ATTTAAAGTGAGTCACTCTTCAGCCCTCTTAAAGGATAGTTATCTACCACATAAAGTTTA
AATGAGGTAATAGCATATTAACTCAAATGTGCTTATGGGTACCTTATGCTATTATGTGGT
ATTTACCAAAAGTTTTTCACATATTAAATAGTAAACGATACTAAAACAGTGTGGATTAAA
TTCTATTTTTGGATTATCAGTAAATCTAACTCTGAAGACCTACTATAGAAGCTGAAGTAG
GTAGAACTAAAACTATCTTGCTTTCTACTCTGCTGTTAAAGAAAAACATTGCATCAAAAA
CTAAAAGGACTGTCACTTTCTTGGGATTGGAGTATGTGAAACAGAATTTGCAGGGATTAC
CCATTAGTATGAGATCTTGTAAGGTGATTGAAAGAGGTGTTTTCCCCTATAAAGAGGTGA
TCTTACTTTTGTTTACTGTAGACAGTAACTTTGAAGTAAAATTCATTTTAGATACCTCAA
ACCAGTTAATAGTGGACTTAGTTTATTTTATTCTGGTTTAGTTGAGAATGCATTTGAATT
TCTGTTGAGTATATGGAAACCATATTAAAATGATACAAAACATTTTCTTTCCACAGAACC
ACATATTCTTCTGTTTAGACGACCTCTTCCAAAAGATCAACAAAAATGAAGTTTACCTGG
GGAATGTCAAATCTTTTTCAAATTTAATGTTTATGTGTATATAAGGTAGTATTCAGTGAA
TACTTGAGAAATGTACAAATCTTTCATCCATACCTGTGCATGAGCTGTATTCTTCACAGC
AACAGAGCTCAGTTAAATGCAACTGCAACTAGGTTACTGTTAAGATGTTTAAAAGTTCTT
CCAGTTTTTCTCTTAATATTAAGTGACTGTTCGACTTTACCTGTTACTTTTGTTCAATAA
AGTTTGTATGTTGCATTTATCACAGTTTCACATTTCTGAGGTATATTTTCTTACAGTTAA
TTTGTGACTATTGAGATTGATTTCAGTGTTACAGTTTTAGCTCTGAGGAAGTTACCTTAA
AGATAATGTTAAATGAGTTTAAAATAGCATGATATGATAGGGATACCATTTAACTAACTC
ACTTAATGAAGAAATTAAGAACCAGGGATATGTTTAACGCCAAAGTAGATTTTACCAAAT
TTTCACAGTAGTTTTACATGTTATCACCGTATTTTTAGAAGTTCAAAAGCACTGTAAAAC
ACGTTTGCCTTTTTAGCTCCTACGAAATGTTTGAGTTAAATGCAGACGTAGGCTGTTCAT
CCTAATGACTATGCTATAGAAACATCTTAAATGAGCAGCCAGCATACACAAGGTCCCTTG
GTTAAGAAAGTGTATCTTTATACATGAGAGCAGTAAATTTTGAAGGTTGTGATTAGCAAC
ATTCCTAAAATCTACTTCCCCCACATCACTGCCACCACCACAGGACAGTTTGTTAGTGTC
CAGGGTAACTAACAAACATGACAAAATTAAGTAAACTTCATTACATCTTGGACCCAATAG
TGCTGAAAGGAAGGTGACAGTCACCACTCCCAGCATAAATTCCTGCCAGACCAGACCCTA
AGGTTCACTTTTGTTAGAGGGTGTGTAGCAAACTGGGACATACTTGGACAGAAATCTGGA
AAAACTGGAGCTGCGCCTGCCTTACTTGCTTGAAATCCTTGGTATTCAATGGTAGAGTTA
GTCTGTGCAAGGGACGGAGGAAACCTACAATTTGCCTCAACCTAATAAATTTCCCATTCC
TCAAAAGGCTTGCCTTATTAGGTTGAGGCAAACTATAACATTTACTGTTTCTTAAATCCC
CTTGCACTTTCCTCTAAACCTTTGAGCGAGAAGTTCCTCTTCCACCTATTGAAGTCTGCA
TTCTTTCCTGTACCTTTGGTCAACCTCCAATCCCCGCCTCGCCTTACATGTTTAAGACAA
AAGTTATTTTAACTAATTTGCTGTGTGTAGAGCTTTTTTCCCTCGTGAAAATTAAACTAC
GCTTCCATCTCTTGCCATGTCTTAGCACTTTTTTTAATTTTCGAAAGAAACAAGCGAGTT
TTAAGTTTTCTGTGCCTACTTCCAAACTCAGCGTTTCTGGAAATTTACAGGAGTTTGGAG
GCTTTCCAGATTTGTAAGAAAGGGTATGCAATTCCTGTAAGTCACCAATCTTGAGGAAAC
TTTAGGGAAATGCAGTGGTGGGGGTGGGAATAATCTCGGCTTCCTTATTAGTAAACCTCC
TTCCACTTCTGGTGACTTCTCAAAGGTCACCTCAGCGAAAGGCCTTTCCGGGCTATCTGC
CGCCCTAACGCTAGACTCGTGAGGTTCAGGGGACCAGAGTAAATCACGGCCTCTCGCTGC
TGCCTTGATGGAGACTATCTCGGCTATCCCAGCACTAAAGGGCACATCTGAGGCTCCCGT
AAGCTACGGTGAGTACCCAGCCCAAAGGATTCCTGGGGTCTGGACCTCCCTCACGGTCCC
CACTGCTCTCCACGTGCGGCCCGCGCAGGTCCAGTGCCACCGCCGCCGCGTACTTCCGGC
CGGAAGGAAGGGCGGGCTCTGCCGCTTTTCTATGACGTACTTCCTGGCGTCGCCTGCGAG
GGCGGAAACGCTTTGTCTTTCAGGCCAGCCGACGGCCGGTTCCTGGCCACCCCGGCGCGG
CCTCCTCCACGCCTCGCACC
Chart Advanced