SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000413_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein K (SelK)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Promoter IDSPR00000413
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000348_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000413_2.0 # Promoter # Selenoprotein K (SelK) # Marmoset (Callithrix jacchus) Full length # Reverse
TCTTGCCCCACTTCCCTGCTTCGGAGCGGTGTAGAATTGCGCACAATTCAGGAGCTGGCA
AGCAAAGACACACTCAGAGCATTTCTCTTTGCATCCTTGCCCTCTGAGTTGTTCACTAAG
TAGTGAAGAACGCAAAGCTACCTGCAGTATTTATTTCAGATCTGCTCTTGCTCTCTAATT
TAAAAGCAAGACAAGAACATTAAATTTGTCAGTTTAAACTGGTGAAGGTAGACCTCTATC
AGACACAAGTGCTTCTTGACTTACGATGGGTTTATTGGGAAGAGAAAACATCATAAATCA
AGTGCCTTTAATACACCTAACCTACTGAACATCAGAGCTTAGCCGAGCCTACCTTAAACA
TACGCAGAACACTTACATTAGCATACAGTCGGGCAAAACCATCTAACACAAATCCTGTTT
TATTATAAAGTGTGGAATAGCTCATATAATTTATGGGAACAACATCCAGATCGTGAAAGA
CAGAATAGTTGTATCAGGACTTGAAGTACGGTTTCTACTGAATGTGCATCGCCTTTAGAA
CCATCATAAAGTTGAAAAATGTTAAGTCAAAGCATCATAAGCCCCAGACTGTCTGTATAT
GAAAAACACTCCCTTGGGTGCACTATGCCAGATACCATGGCTAAGTGTTTTCTAACTTTC
TGTAGTACATTCAAAAGGAGCGTTTTCATAAAGACGTTACTGGAATCGTGAAGATCAGTC
CTTCTTTCTTTTGCAGCTAACTGGGTTTTTGAGAGAAGCTCTAAACCACAGGCATATTCC
AGCAGCTGTCTGTTCTTCCACGTATGAGCTACTTCCTCCCTCTGCCACCATCACTCGTTT
TCTAGTTTGAGAAAACATTAAGAAGCATGGTAAATCAGTCTATTTTCAGAAATTGCTTAG
TCCTTGAATTAATGTATTTTATAAATCAGGTTGGCTTTAGCTCCTTAAGATTCGGCTACT
TAGAATAAAATCTTCCCAATTTGTAGCCAATTTGCATATATGCATAAATGCCTGAATTTT
AAAAACACCTTTACAATTAAGAGAGTTTTGGTGTCTGTATTTACATAATTTAAAGCTGAT
TACTTAGGCGAGTTTTAGAGCAATTTTAACAATAGTAATGAGACAAGAGTCTTAAGATAA
TATATTCTTGCCAGGCGAGGTGGCACATGCCTGCAATCTCAGGACTTTGGGAGGCCAAGA
CGGGGGTTATCACTTGAGGTCAGGAGCTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACGCT
GCCTCTACTAAAAATAACAGAAATTAGCGGGGCATGGTGGTAAGTGCCTGTAATCCCAGC
TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGACAATTCCTCAAACCTGGGAACTGAAGGTTGCAGTGAGC
TGAGACTGCAGACTGCACTCTAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCTTCTAAAAAGAAAA
AAAGATAATACATTCTTTAGAACCACATGTGTAAATGGCCAAAGGATGCTTTGAACAACA
CGGTCCCAACTGTGGAGGTATCACCATCTTTCAAAGCTACCTGCAAAAAAGGGACAATGT
TATCACCAGCTAGTGAAAACTTAGGAAAATTTAAGGAATTCTCAGCAAATGTCTTATCTG
TTAAAATACCAATGGTCATCCGACTACGAGAGTAAATGCACCTCTCTTTTCTGAAAACAA
AGCAAAACCAAAACAAAACTCTACAGAAAGATATTATAAAATCAAGGATTAAATTTCTGT
TGATTAATAAGTGATCGAGGTTATAGGTAATACCACCTCCAGGATTTTTTTTTTTGATGG
AGTCTTGCCCTGTCACCCAGGCAGCTCACTGCAACCCCCACCTTCTGGGTTCAAGCGATT
CTCCTGCCTCATCCTCCAGGGTAGCTGTGATTACAGGTGCCTGCCACTGTGCCCAGCTAA
TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGAGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCC
TGACCTCAACTCGGCTTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCATAAGCAATCGTGCCCGGCC
AGGATTTTAATTTTAATTAATTAATTTTTAGTTTAATTGTTGGAGTGCAATGGTGCAATC
TCAGCTCACTGCAACCTCCACCTACTGGGTTCTCCTGCCTCAAACTCCCAAGTAGCTGGG
ACTACAGGTGCCTGCCCTCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT
TACCATGTTGGCCAAGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTTGCCTCGGCTTCTCCAAGTGCTG
GAATTACAGGCATGAGCCATCTCGCCCAGCCAGGATTTTAATTTTAATTTAATTAATTAT
TATTTTTTTAAGAGACAGAGTCTCACTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATC
CCAGCTCACCGCAACATCCACCTCTCAGGTTCTAGCAATTCTCCTGCCTCAGCGTCCTGA
GTTGCTGGGACTACAGGCACATGCCACTACACCCAGCTAGTTGTTTGTATTTTAGTAGAG
ACGGGGCTTCACCCGTCTCGAACTCCTGAGCTCAGGCAATCCACCTGCCTCAGCCTCCCA
AGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGACCAGCCTTTATTTATTTATTTATTTTTT
GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGAGATCTCAGTTAATGC
AACCTCCACCCACCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGGACT
ACAGGTGCCTGCCATCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCAC
TATGCTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCTGCTTTGGCCTCC
CAAGGTGCTGCAATTACAGACGTGAGCCACCATGCCTGGCCTACCTCCAAGGTTTTTAAT
TTCTCGGCAGGGATAATCTGACATTAAAAACAAGCTTATATTTTATTAATAAGGAGAAGA
TTTATTCACAACCAATTTCTGCTTCAAAACACTTCCAAGCATGTAACATATGCCATCCTT
TAAAGAAGGATTTCCTATTTAATCATCTCAACTCAAATATGGATGGTCTTTTCATTTTAG
ATCACAAGCCCTTTGTTTGCTTGTTTTTGTACAGGAATTATCTTGGAATCTGATAATTCT
GAGACTCACCTGATGGCTAAGCACTGCGTATCTTCATTACGTGCCCATTTCCATTCACTG
CTACACACAAAATAGGTAGACCATGTATATTAACATATTATAATTATAATACATTCATCA
TATAATGAGAATACACAAAAGCATGATGAAATGACCACCTGTGATCCTGACATCCAACTT
GAGGAACAGAATGATAAGTGTAGAGGTCCCTATGACCCTCCTCAATCACCCTGTTATGTT
GATCATTCTTGTGCTTTTCTTTATAGTTTATCACATTTATAGCTAAGAAAGTATATTCAA
AATTTGGCTTTTGATTTTTACAAAATACTATTATATTACATGCATTCTGCTGCAACTTAC
TTTTTCACTCAGCATTGTTTCTGAAATTCATCTCTGATGATGTGTATAGCTCTATTTCAA
TCATTTTCACTTCCATATAGTGCTCCACTGCATGGATATACCACAATTTATTATCAGTTC
TCCAGGTGTTGGGCACATTCTCCCCTGATTTGCACTGTTTTGATCATTTCTGTACTTGTT
TCCCAGCCCTTATCTGCAAGGTTTTTTTTGGTAGTGTTTCCCAGGAACAGGACTGATTGT
ACACAAATTATGTAACTACATACATAAATATATAATACATACACATAATTATGTATATAT
TCATAAATATACTTGTTTAATATGAATATGAAAAATGTTATATAATTACATATCATAGAG
ACTATATATTATATTATAGAGAATATATATATTCTCCAAAATATATATATACTCTATAAT
ATATATTCTATATATATTCTCTATAATATGTAATTATATGTAATAATTACATGTGAATAC
TGATTTTCCCCATGCAAGAATATTTTTCAGTTGCCGTATTTTTTAAAACAATGTAACACT
TATACCAGCCAAATCAAATGTAATAATCAACACAACATATACAAACTAGTAAAATTATTT
TATTTAGTTGTAATATCCATCTCTAATTGTTTGAAATAAAATTTCCATGGTCTTAATTGA
ATTGTACGTTAGTTTCTTTTAGAATGTCCTGTTTTTCATTAAAGTAATTTCTAAACCACT
CTATGTGCTCAACCTTCTGTTTAACACTAAGATACGGGTTTTTGGAAAGGCCACAAGTCA
CCAGCTCCATGAAGTGGCGAATTGGTCCTTGTTTTGGAAAGCCCTCCAGGTGTTTCTCCA
GAAATATATGCTCATGAAATTCTGAACCATCATCATCAAAACCTAGGAAATGAGAAAAAA
TACATTAAATTATAATTTTAAATACAAAAATCTACATCATAAAAATAATATTAACAAAGT
AACATATTACATTTTAAGGCATGTGCTTTAGAGTTAAACCTAGGGTTTTTTTTTTCTTTT
TTCTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGTTGGAACGCAATGGCATGATCTCAG
CTCACTGCAACCTCTGCCTCTCAGGTTCATGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCTGAGTAG
CTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCTTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCCA
GGCTGGTCTTGAACTCTTGACTTCTGCCTGTCCCAGCCTTCCAAAGTTCTGGGATTACAG
GCGTGAGCCACCTCACCTAGCCCAGAGTTAGACCTAGGTTTGCCCACCAATTTTTTCAGG
AGGCTGAGGCAGAAGAACTGCCTAGACCTGGGAGGTGGAGATTGCAGGGAGCCAAGATTG
CACCATTGCATTCCAGCCTAAGTGACAAGAGTGAAAAATTTCATTTAAAATGCCTAGCAT
GCTATAAGTGTTAAAAATGT
Chart Advanced