SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000504_2.0
Identity
PromoterSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Promoter IDSPR00000504
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000439_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000504_2.0 # Promoter # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Guinea Pig (Cavia porcellus) Full length # Forward
TGGCTGACTGCAAAAATTGGGCTTTCATAAAAAATTTTTATGGTAATGGGTAGGACTGCA
GTTTTATTTTTCAGACTACCACAGTTTAATGTACAGTTATACATAATTGCCATGATTTGA
CCTTGCTATTATATGTGTGCTTAAATTGAAAAAAGGATATGCCAGTAACTTACTAGAAAA
CAAGATGAGTATGAAGTTGCAAAAACACTTGCCATTGGTATTTTTTTATGGAAGTATCAA
AACAACTGCTTAGAGTGAGCATGTAAGACTTGCACCTGCTACGGATGCACTGATAAGGAA
ACACAAGTCATCTGCATCTGAAATTACATACTACATTGTTTACTTTGTGGAAAAGTCTAG
TCTGGGGCCAGGCTGACAACAACTCCACAGTTGGGGGTAAATTCCTTACATTTTTGGCTT
TGCCATCCATCTTCCATATGCAGTTTGTTCTGTGGTATTAGATTGCTACTGTAACTTCCT
GATCAAATGTCTGAATAGAACAGGAAAAAGAAAAAGTTTGGCTATTCTCTCTTTTGAGGA
TATTTTTCATCTTGCATATTCTATTTATATTCTGTGGTCAAGATTTGGCTACATGAACAA
AGCTAACCACAGGATAGCTTGGGATGTGTGACCATGTATCTAGTTTAGATTCTGGTGTTC
TGTTCATGGAGATTTACAAGCAAGATTCTCTTTTAGAAAAAATAACAGTAAAGATAGACA
GCATATTCTAGATTCCTGAGTTTGAGTATAGCCTCTCAAAACCCAGAAAAAGGTAGTAGA
GAATGCTGGAGTTTGGCACCAATGGTGTTTGCTTTAGACTTTTGATGTTCACATTTTTAG
TATATGTATGAAGTGCTCATAAGAACACATGAAGCATTAATACTTGGCTGTACCTTTTAC
CAGGCATGTGATGCTACCCAGAGAACTGTCCAAACAAGTACCCAAAACTCATCTGATGTC
CGAAGAGGAGTGGAGACGACTTGGTGTCCAACAGAGTCTAGGCTGGGTTCATTATATGAT
TCATGAACCAGGTACATTTTGTTGTAAAGTGTGTGTATAATGAATGATACTTGAAGGAAT
TCAAAAAATTTTTTTATGACTGATTCATTCCTTAGCTCCCTGGAGTGTTCTGTTTTAAAT
AAAATGCCACAGAAATGAATATGATATATTCTACCTGCAAGAATAACTTGTCAAGAAATA
GCTATCCTATTGTATTATAAAATTTCTTCTTATATTAAAGTATCTGAAAAGTATACCAAG
GATTTCATTGTCCCATCTCTGAAAACTAAGTACTTCAAGACAATATAGATGTCTGTTAGT
GCTGTTACAGAAATTGGTGCAATTAGTGATTTTCCTTTAATCCCCAGAAAGGATGTTCAT
CTACCTAAGATTAAATGAGATAATGTGTGGATTCAGCTGTGTTACACAGCTTGGCTAGAT
TTGAGTGTCATATGCTCTTGTAGTACTAACCAGAAGGTTTTCTCGTTAAATAGTAAACTA
GGTTGTAGCTTTTTTTGAGACAGGGTCTCCTATGCAGTTCAGGCTGGCCTTGAGCTCACT
TTGTAGCCCAGGCTTGGTCCTCAGCCTCCCGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCA
CGCCAGGCAACTAGGTTGTAGCTTTGTGGGGTGGAATTCTTATTTTTGTATTATTGATAA
ATTTAACTTACAGAATTTACAATGCTTGGAACAAAATCTGAAACTACATAAAGTAGAACT
AAAGCTATCTTTATCCTTCTATTGAGTAAAAACATTGAAAACCAAAATATCAGGAATGTT
CTCTTTGTCAGATCATTTTCTGTTTATTGTATCTTTGAAGCAAAATTGACTTGAAGCCAG
ATAATAATAGTTGATTCATTTATTCTGGTTGAATTGAATTATTTACATTTTCTTTCCACA
GAACCGCATATTCTTCTGTTTAGACGACCTCTTCCAAAAGAACAACAAAAATGAAGTATA
TTTGGGATCAACAGTTAAATCTTTTTCAAACTTAATGTATATGTGTATATAAGGTAGTAT
TCAGTGAATACTTGAAAAATGTACAAATCATACATCCATACCTGTGCATGAGCTGTATTC
TTCACAGCAACAGAGCTCAGTTAAATGCAACTACAAGTAGGTTGTTGTAAGGTGTTTAAG
ACATTTCTTCTAGACAGTTTTTCGATTAATATAAGTGCCTGTTTGGTGTTATCTGTTACT
TCTGTTAAATAAAGTTTGTATGTTGCATTTATTCCTGTTTGAAGTTACTGAGGTATATTT
TATAATTTTATGTTTGAGAAAGTAAACCTGAAAGAGAACGGAAATTAAAATAGCATGGTA
TACTGAGAACCCAGGGATATGTTAAAACTAGCACCAAACAATTTTAAAGCCATCATTTGT
CCAAATTCTAGACAAATGTAGGATCTTCCAAGCGAACAGGAAAACCCAACTTAATACTCC
TTGGGTTGCCTCCACTTAATCCAAAAACTCCCTGTCATCCACCTAACCCTGTTTATCTTT
TCCTCCGTTTGCCAAGTAAAGATAATGTTTCCTATTAAAGACATCAGCTACTGGAAGGTT
TTCAGTAAAGTAACTTAATGGTGTAATGTATTTTTTCATCTGTTTTGATTGCCTTCTTAG
TTGTTAAGGAAGTATTTTAGAGTTAAATGGAAGCATTCATTGCTGTGCCAGAAAGACATT
TTGAATGAGTTGCCAGTAAACGCAGGACCCTTTTGAGCACAGTGTACTAGCTGAAGAGGG
AGCCTGACAGCCATCCTTACACCTCACCGATTCAGTAGTAATAAACCTGCGGACCCACCT
GAACAAGAACTTAAGCTCCCTGTGCTTTTTTCGGTACCAGGTGTGCAAATCTATGCACAA
GGCAGAAAATCTAGTTTGTCTTTACTCATTTGGCAGGTGGCCTCCATTGAGCCACAGGCT
TTCTGAAGCAGCCAGTCCCTTTCCGAAGTGCAGGTGCTGTCATTTGAAATACAGTCTGCA
GGCTTTCCTCTAAACTTTTGTTCTTGAAATAGTAATTTCTCAATATGATAGCATCTGCCC
TTGTGTAATTTATTTCCCAGCTTAACACTGTTTGTGTCCAACATATGTTAAATTTTGGAG
TTCCTTCATGTGATGAATCCCAAACCAATGGAAGTTTCAGTAAGCATAAGATGCCAGTAA
GTCGTGCTTCCAGGATTCTTGTCGGGTGTGCAAATGCCCCCTGGAGTATCGACAACTCTG
AGGGGATCAGGAAATGCACGAGGGAAGGGACAGTGCTTTGCAGGGGACGCTGTCTAAGAA
GCCCTTCCGCATTCCTGAGACCCACGGGGGCCCAGGCTGCCTGAGAACCCTCTGCTCACG
GCAGGTCTGTAAGGCCCTGCCGCCCTAGCCAGAATTGCGTCGGATAACCCAGAGTGCCAC
AGATCATAGGCGACTCCTGTTCTGGGTTCCCCCACCCTAGTAGGGGACTATCCATTGCAA
CCTGATGCAGCCGCTGCTAGTGAGCACCAATGCCCGGCTCAGGCCTACATCCGACGTGCT
TTGCGCTAGGAAAAGGGGCGGGGTAGTCGCGTCTTAATGACGGGCTTCCTGGCGCCCGTT
CCAAAAGCGGAAACGCAAGTGGTCCGCTGGCCCAGCGGCGGGCCTTCACGGGCGCGGGCT
CCTTCGGCCTTCCTGCCTGCTATGGCGTCTGGGGGACCGTGGGGGCCTGAAGGCACGGTA
AGGGCCGCAGGGGGCTGGTGTGGCCTCTTGGCGGCCTCAGCCCGTCAGCCTGACTTGTCC
CGGTGTTTCAGTCGGGTGGTAACAAGACTGGTTGGTTAATGTAGGCAGGAACCGGTGTCC
TCAAGCGGCCTAGAACCCACGTCCCGCCCCGAGCTCGCCTCGGGGTGGTGGCCGGGTGCC
CAGGCTCCGCCTACGGCTGGCCCCGTAGGTACTGTGATGCCATAAACGCTGTTGACAGCC
TCCCTGTTCCTTGCTGGCGGCCCAGTTGGGCTATTCTGTGAACTTGGCGCTTCCAGCGAA
GAAGCAGCACTGAAAAGCGCTTTTACGCTTTTAAAATTTCTGTCTTCGCTGTACACTTTG
TAATTGCTAGAAGCTAGATGGAGATCGACAGTCAAATAAATTAGCTTCACGCTAACTAAA
AGCTGTAGTTACAAGTAAATTACTACTCTAAACAAAAGACATTTTTACATATACGTACTA
ATTCCAAACAAGACTTGTAAACATTATGTACTGCAAAATTGTACAAAATAAAAAGGAAGG
GGAGCCGGGGGATGTAGCTTAGCAGCACAGTGCCTGTCTGGCAAGCGCAAGGTCGTGAGT
TCAATTCCCGATACCAAAAAATAAGAAGAGATGGGTGGAAAGGCAGGGGTAGCCAAAAGG
GGAAAGAAAAAGGAATTAAGATGTGCTATGTACATGTGTCACCTTCCCACAAAGGTTGTA
AATAGTATGTCATACACACATGAACTAGTAACATTTTTAAATTTGAAGGGCTTATTGGCG
ATAAAAGATTTTCTTACTATGAAATTCTCCTTTCTGTAAAATAGCTCTTCGTAGTTAACA
CAGTAAAAAACAGACATTTTGTAACTTTTTGAGAGATATAGAGGAAATACATGCAGTGTG
TTCTGGGTGCTGCTGGTAAACGTTTCCCAGGTATATTTGACTGCAGTAGGGATAGGGTTT
TTAGTTACTGTGGACCTAGTTAAACCTCAGGGGAAAAATACCCATTTCCAAGTTTAAAAC
TACAGATATGTTACTTGTCCTTTTATACATGAGCTAGGTTAAATTTTAATTCCACTTTAA
TTGGTTGCCATTATTTTTCACTTCTAATGTTTGAAAGACTGTTCTAACTAAAAAAGCATT
AGGAAGAAATTTTTAGCAAAGTGAATTGTCTTCACTAGGCAGACATTTTTAAGTAGCAGC
ATTGGGGACTGTTAGAATGGAGTGCCTCTCTGGGTTTTGTTTACATTGGGTTGATTTCAG
ATTGTATATAGCCAACACCT
Chart Advanced