SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000611_2.0
Identity
PromoterGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesCiona intestinalis (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000611
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000546_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000611_2.0 # Promoter # Glutathione peroxidase (GPx) # Sea Squirt (Ciona intestinalis) Full length # Reverse
CTTTTCCAGCCATGCTAGAAGTTTCTTTGCCAGGGAGCAAGAAATAAGTGAGAATGCAAC
TGAGCAGTAATATGAATAGACTATGTTTACACTTAGGCATCCAACATCCTGAAACAATTC
AGGTTATTGCGTAATAAGACAGCATTATTAGTCTATTATCACATTAATAGCAGAACATAA
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CATTTTGTGACAAACAAAGAATATTTACGTAACTATATAAACCCATCCGCACGATTGTAT
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TGCCAAACACCTCTCCTAAATCCTTGTGTTTTATCCCGCTGTCTACAATGCACCAATGTT
CACACTTACCATTTCGACCGCTTGCTTTGAATAAAGTCACAACATTACGTTTCGTACAAA
CCTGTTGTCCCATGAGTAAACATGGCAGCCAATCAACGGAACATGATTTACCAAGTCAAT
TATTGCTATGTAGGTTACTACTTACTTGTGTAAGGTGTCACTATCGTTGCACACATGTTG
TATTCATACACCATATGCTCACTGTCGAGTTATAACATGGGTGTCTTCTTATACACCAGA
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TCTTATACAACAGACACACATGGTGTATTCATACATCTCATGCTCACTGTTGAGTTATAA
CATGGGTGTCTTCTTATACACCAGACACACATGGTGTATTCATACACCTCATGCTCACTG
TTAACTTAAAATATCAAAGAACTAAAGTTTTAAGAAAATTTGATTCGAATTTATTGAATT
ATCCGAAGGTGGGTTAAGGCAACTAAGGGTTAAACTATTTCCGCGCTCTCTAGCTCTCCC
TGGTGGCTGGGGTATTTCTCCAAGTCCTCCTGGAAGACAATGATCTCTGTGAATTCATCA
TCATCATTGTTCTCACTCTTTTTTCTCTTCTTCCTCTTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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