SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000632_2.0
Identity
PromoterEukaryotic elongation factor (eEFsec)
SpeciesCiona intestinalis (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000632
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000567_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000632_2.0 # Promoter # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Sea Squirt (Ciona intestinalis) Full length # Forward
CCAGTAGTTTTGTAATGCTGGTAGCAAGTAAAAAAAAAATAAAACAAATATATTGCTTTA
AACTTTGAAGTGAAAGCAACTAAATGCATACGCAAATTGATTTAAAATGAAAGCTTTAAT
TTATATATTAAACCACAAATATGCAAAAAAAAAGGATTCTTAAAACTATGCCATGCTTAA
CCTAACCTATAAAAACAATATGTTTTGTTATCTTAACTATTTAATTTGAGAAATTTAGTA
TACAAATTAGGAAATTTGCAGACTAAAATGGAGCCTTTCACAAAAAAAGTAGCATGAACC
TGTACTGCACAGGATCCCTGCAAAGCTCCACACTCGGTCTGTACGTTCTGTGGTGCAGAC
GAGTTTGTGAGACTTGCATCGGAGCTTCTTTATCATTGATTGCATCCTTTAACATGGCTA
TGTTGTGCTCCTGGTTGCCAATCTCAATCAACACCTGGATAGTACAAGGGAATGTAAAAC
TTAGGCTACTTAGTAAACGTATTGCAAATAATTTAAGCCATTTATAGTGACATTTGTAAA
TATTACATTTTAGGGATGTTTATATGCAACTCGCACGTTTTTTTTATATGTGTGACATTT
ATAGGCTGTAAATAGTTGTGGAACTGTATGATGCACATTTGTTTTGTAGAGACAGTTTCT
GCCTTATAAACAGGAAGTAGTCCTAGTGGGACAAGTTGTCTTTATTTGGACATTTTTTTG
TCATTCATATAAAAATATCAAAAAGAATAAGAAACCAGAATCATCTTCCGAACAAGACAT
TAAATAAATATTTTACATAAAAAAGCAAAACATGAATAAATCACCTTCTGCAGATGGTTT
TCCAGTTTAATCTTCGCATCATTCATCTCTTCAACTCTCTTTGCGAACGCTTCATTCACC
GAGTTACATTGCTCTCTCAGATCATCTGATGTATCATGGAGAACGTTATCGATCAACGAA
CGAAGGTTGATGGATGCCATTCTCTCTCGCTCAGCACGAACGATGTTATCGTGCGTAAAC
TGCGCCCATGTCTCCGGTGTTGAGGAGCTGGTGAAATTTTGGGCTTTTTTAATGTTTTAA
AATTATTTATTATTTTTTATTATTCAATATTTTTAAATTGTTGAATATTTTTAAATTACT
AAATATTTTAAAATTATCAATATTCAAAATTATTTATTAGTAAAAAGTAAGCCTAGTATA
AAGTTTAAAAAAATTAGTTGAAGAGACTAAAAAATCGTTTTTTTTTTAACACACCAAATG
ACTTGTATATTACAGAAGCCAAGAGTAATGATAACTTTCTTACATAAAAAATACAGAACA
AAATGCTATGTTTTTTAAAATACACCTTCATATAGTAAAAATCTTAACGATACAGTTGTT
TTTGTTCCGCTGTAGATAACTTAAACACTATCACAGCACATTCACTGGCTCCATGACATA
GTGGTTAGCGAGTCTGCCTGTGATCCAGAGGTAATGAGTCCAAGGCTCATCGCTGCTACC
ATTGGGGGCGTATGTGTCCTTGGGCAAAACACTTAACAACAATTGCTCCAACCTAGTGGT
CACTTACAAAGTAACATACTTACTCGTAAGCTGACACAAAGTGTATAAAACCGAACACCC
ATTGACTGTTGTTTTCCAGCCATGCCAGAATAAGTAAGTTACATCCATTCACTTACTTGT
CCTCAAACTTAGCAGAGTTTGGATGATATTGAATGTCAGTTGATTGGTTGTTCAACCTTC
CACATTTATCATCAATGTTATGAGCATCTAGTTTATCGCTCCAATCCAACTCCAAGTTTT
GCTTGGCGTCTCTATTCATACTGTAATAGGAGATTTGCTAATGTGTCAAGATACTAACTG
GTTAATGCTGCATTTTTGTCTTTATATTAGAGTGTTTTATACTGATGTGTATAGTGGATT
TAAAGACTGTCATTTTGCTGTTGATTTTACTTTCTTCATTTTTAAAAAATTATGACTTTT
GCTATTGGTTACGAAAAGATAAATAAAAAATGATGATATGTTATAAGTGAAAAAAAAGAA
AGGAAATGTTCTATAAGCTATAACCAAGCATTTTTTGTCTTAAGCATACAAGTTAGTTGG
GTCTTGCATTTTTGCCAATGGGTGCATTTCAAACAACATGAGATTAAGAACCCTTAATCT
AGGTTTTGGAGAAGATATACCAAACAGTAATGTTTCAAACAAAATATTCATTTTTCTTAA
ATGCTGTTTGAATAACTTTATCCAATACATCACAATTAAGCTTACCGAATCTGGTTTTTA
GTTTGCTCAATTGTCCTTTTCAGCAAATCCTGAACAGATTTCAGCAAATCAACTTCCTGT
ATAAACAACAAAACATAAACTCCCAATTTCTTAACTTTTCATCCCAAACTTACCCTCAGT
AGTTGTATTTCCACATTATCCTTCACCAGATCAGGACCTTGTCTTCTGAATCTACATTCC
AAGTTATCCGTAGCAATTTGCATCGGTATTTCTGTTGCATCGAGCGCTTTTTCCAATCTC
ACCTGTGAAAGGGTGCATCGTATTGAATGTAACTCACTTTAACCGTGCGTGGTCCAAAAA
TTAGTCAATATAACACTGGTGTTCATAAACCAAGTGCCAGGTGACGAGTTACCATGTATG
TTTTTTGTGGGTGAATATTTTTTATGTATGGTTGATAATTTGGATAACCTATTAGTGAGA
GCTGGGTTGGAGCAATTGCTGTTAAGTATCTTGTCCACCTCAGCTGTCATTAATGGGTAA
AAAAAACTCCAAAATAATCACCCATAAAAAAAAAAAAAAAACAACCTCCAAAATAAACAC
TCACAATAAAGATATATAAGGGCAACTAACTAAATCTCATTTTTGTAAGAGAATTTTTTT
AAATTTTTTTAAAAAAATAAATATTTATTACTTTTTGCTGAAACAGAAGTTCAGTTCCAG
CGATAAGATCATCAATCTCACGCTGAAGTTCAAACTTCCAGAAGTCGATATCGTGAATTC
TTTCACCCAACTTCTTTGTCACATCAGCTTGAGTTCTAAATACAAAGATTTGCTTACAAT
TTTTTTTTCACGATCTTCGGTATACAATTTGATAGGAATAGAGTGTTACTTTAGCAACTA
GAAAACAGGTTTTAAAAAAAATCTTTGTTTTATACAAATTAAGGAGACAGAGGCATTATA
CTGATTATGTGAAGGGCAGGTTTACAAAGAGAATTCTAACTTTAAAAAGTAGTATTTCCA
AAATACTGTGAAAAATATTTAATAATGAAAACTAGTTAAAGAAAACTAGTTAACCAAGAA
AATAAACAAAAAGTAAACACAACGGGTATATAATAAAGCTAGTTAAGCACTCTTAGAGTA
TTGAAGTTTCATGCTGTTTTAAATTTAGAATTCAAATATTTCAATGGTAAGTCATTCTTT
AAAAAAATATTAGTCCTGTAACTCATTCCCACTTTTCCATATACAATTACCAAAACTTCA
CATGTTAGTCTTATTTTTCCGATGGAATATACAATTATCAAAAATAATAAAATCACCTGT
TAGTAATAGCGAGAGTCTCGTTAGCGAGTTTCTTTGACTCATGTTGGATTCTCTCGGCAT
TGTCTCGATCCGAGAATGACTGGTAGAACTTGGAGTAGTTGTTCTGGTGCCATTCATCGG
GTGTGTACTTGGAGCTCCGGAATCCAGCAGTGGCGAGTCCATGGGAGGTATAGGAGCCAG
TGTTGATGGGGATGCAGTGCTCCTTTTTCCCAAGAGCATCCACAGGGATAGATTGAGGCG
CTGGCTCAGTTTTCAAGAGAACTTCTGCTGCTGCCATTTTGAAGATCTGCGTTAACGATA
TAATGTTAATTGTTAATAAATTAATCTTCCTGGTTAATAAATTATTGTTTATTTCAAAAA
TCAGTGTTAATAAACAAATATTTATTATTTAATTTAGTTAGTTTATCCTCATGTCATATG
CCAGAGCAACTATGAGTGGGAACATAATATGTTAGGGTGAGATGACGGGACACCTTTAGC
ATTTAATATCCAAATATCCTGATCGTGTTTCAAACAATTAACAACAGTCTATGGGAGGCG
TGAGTATACGGTTTTATAACTTTTGTCCTTTGTTTACTACCGATTAGAATGAGAAAATAG
AATGAAAGAGTGTCCCATCTTCCCCACCCTACTAAATGGTAAGAGTTTACAGCAGCTACA
ACTTTACAAGTTGTAGTGAATATAGTGATGCATATTATTGTGCATTTGCTGATTCCTAAT
TTGCATAAGCAACATATAATCCAAGTTTCTACATTCTTAAGCAACTGTTATTTGTCATAA
AAACAATAAATAAAATTTCTTACACATCAAAGTCATTAAATTTTAAATTCAAAGTTAAAA
TTTCCTAAAATTACTGTAACGTATTCCTTGAAGATTACCCTCCGCATCACCCATTAGCTT
ACCGTTAGTTTCTATGCTGTCAACAGCTTAAAAATGTCGCGCACACCGAATGCCAACTCC
GCGGAATGAATCTCTTGTCAACGTTTCCGTGGCAACGGCGTCTAGGTAACAAATAATTAA
AGGGAGACCTTCATAGTTAACTGTATCTTTTAAAGGTGAAACTTTTTAAATAATTGTTGC
TGTTTTGACGAAATGATTGTTTTTTGAATAAAATAACGCAAATATTAAAAATAAGATATG
ACATCTAAACACAAAAAAAAACACGAAGAAAAATAGGTTTATTGTACCAACAACGAGTTT
AAAACGTAATTTGTTCCAAAAACTTTGGTATTGCATTGAGCGCTTTAAATTAAATATACT
TATTTATTTTCTTCTAACAATAAATTTCTTGTTTGCAATTATCAATTTCGCATCGTAATT
TTTCTTTGCAATGAATATTGCTGAAGGTGTTTCCCCCACAATGAGACACGTACAATTCTT
GAAACGTGAAGTGGATGATTAAGCAGATTTTTGCTGAAGTTTATTTGTGTTACAATCTGT
GTTTATTGTTGACATACACC
Chart Advanced