SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000636_2.0
Identity
PromoterIodothyronine deiodinase (DI)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000636
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000571_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000636_2.0 # Promoter # Iodothyronine deiodinase  (DI) # Sea Squirt (Ciona savignyi) Full length # Reverse
CAGTGACCGCTATTCGATGGAAATTTCGAATAAATCCGTCCACAATATGCCAGATGGCGG
GCGTCTAGGGTTAAAATAAATGCTATTTGAATAAGGCGCGGCGTGGCTGAACGTTCGTGT
GGTCGGATGGTTAATGCGACCGATGCATATACCGACTCTTATACAAAAAAACGATCCTAG
TGACGAGCCCATCCTGGGTTCGAAACTTGGCTTGGTAAAAAAGTAGGGTATCGTGGTGTA
CGGTCGTGTGGGCAAATGGTTAACGCGGCCGATTCATATAGGCCTACCATGCAATTCCAT
AAATTAAAAACCGTCTGAGTGACGACCTCATCTTGGGATCGAAACTGAGGCAGGTAAAAA
AATAAAAAAATAAGGCGGCGTGGCAGAATGGTTAAAGCAACTGATACATATACCGATATG
CAGAAATGGTTTAAGGACCAGCTTATCATTGGTCCCACCTTGGTCTTATGGGTTCGCACT
TTGGCGGGAGGCAGAAAAAGAAGGCGGATGTACTGTACGAACATGTGGCCGAATTGTTAA
CTCGGCCCATATATATATACTGGATTATATAAAAAAAACATTCATTTTTCAAGTGTATCT
GGAATTCGGTACGTATCATTTATCAAGGTCGTTCCTTAAACATCCCGGCTAAGAGAAGAT
ATGCAGAAAAGGATAGGTTTGTCTGACCAATCTTTAAAGATAAACTAAAACTGCAGTAAA
GTTACATTGTCGTAATATTATTTGCTAATACACAGTGAACACATTTCAATAATGACAAAC
ATTGTCTAAACCCAGTGTATTAATGGGATAAATGTACAATATAACAGGCATAGATAATGT
AACCTTAGAAGTAAATACCTGAAACACATTGATTTCCATCATAGATAGGAACTTGCTGTC
CGGATAAAATTGCATCAGAAGTCGTTTGAAGCCTGGAATCTGTCTTACCAGGGTAAAGAG
GCCAAGAGAGAGATATATTACCAATCCCGCCGTAAAAGCTCGAATTTTTACAAGCATTTT
AACAGGCCAGCCCATGCTTCAACCTTTGTTTTTATGTCTGCAATGCAGGTGGAAAATTGA
AACTGAAATGTTAATTCCATATAGATCGCTTTCAGTCGTCCGACGGGTTAGTCTGGTGGT
TTAGTGCGTCGCCTTTGAGCCGAAGGGTTGTAGGTACGAAACTAATCACTAGCTAGTCAG
TTGTCTCCTTGGGCACTTAACGGACATTGCCTGAACCCTGCTTTTCTAGTAAAGTGAAAG
AACGTGTGAATCATACACAACACACTGCAATAGCTCCGGTAACCCGACGATGGGCTTGAG
GTGATCTGACGATTGCCCGTGTGTTAACCCACTTGGTTTTCCCATTTACGGGGATAAACA
TGAATAACCCATCCTACAGCAGAATTCTTTAGTAAAAAAACGGGAATATTCTTTTAGTTT
ATTTATTTTTCCCTAGTATTAAATAAAGGCAAATAAAACAAATCACAACACAGGAACAGG
CAAAACGAACAGAAGTTAAAACACATTATTATATCAAAAATATAGCAGACGCAGCATCCA
AACCTAAGCGTAGCCTACATTTACATTAATTTGAAATATTTATTTGAGCGATCGATTAGC
ATAATCCTGCATAATCAACTTGGTCAATGCACTAAGCCGTCTTGCCTGAACCCAATATAA
TAATAAATTCTTCTAAAACTGAGGAAATGTCTCAATCTTATACAACATACTGCATTAGCC
CTGGTAAACTGACAATTAGCCATATGATAACTAATTTACCTAACCTGGTCGCTAGCTAGT
CTTGTGTCCTTGGCCAAGGCACTTAACGGACATTGACTGAACCCAACGGATTATTGTGTT
TAACTAAATTAACGCAGCGTGTGAATCAATACACAACACAGTGCAATAGCTTTGGTAACC
AGACAATGGACGCGAGGTGATCTAACGATTGCCCGTGTGATAACCCACTTGGTTTTCCCA
TTCACGGGATAAACATGAATATCCTATCCTATCCTATCCTAACCTATGAAGGGTTTGAAC
ATGGCCTGTTAAATAAAATACTGTTTTTCTATTCACGAAGATATCTGCCTGTTAGCACGT
CTTAAAGAACATAGCTGTACTTCCATTTATATAAATTGACCAATCTTATATCTGACAATT
TTCGGAATAAAAAGCGAAATAAAAATTGGTTATCCATTTTAACTAGCTGAACCTACAGGC
TACTGTTATGGTTCTGATAATCGACAAATCCATGTCCGCATAAAAAAAACATACTGTAGT
TATATTATTTTCAGTTACCGTTCCGTGAAAAATAACTAAATAATATTTTTCTAAGATCTA
TGTTTTTGGGTTAATATTAAGCAATATGTTTTACATTTGAAGTAAATATACAAACTCGTC
AAATCGTGCACGGTACAATCTAGCAAAACTTAACAAAATCTTAAAATGATCAACGTTTCC
TAGCAAGGCACGAAGTAAGTCAAGTGCTCTTGTGTTTTCAGGTAACCTTGATCAAACACA
GAATGTGTGTCAAAGTCTGCAGACCAAATGATCATTTGTTTACGAGCAAACTTCGGCAGC
AAAGAGGAAATCCAACTGAGGGTCCAAAGTTCGTTTTTGCAATGGACTTAAATGAAAGAT
CAGAAATTAGAATATTCATGATTATCCCGTGAATGGGAAAACCAAGTGGGTTAGCACACG
GTCAATCGTCAGATCGCCTCACGCCCACCGTCGGATTACTGGAACTATTGCAGTGTGTTG
TATATAATAAACACGTTCCTTCAATTTGGTAGAACCCATTAATCCTCTGGGATCAGGCAA
TGTTCGTAAAGTGCCTTGCCCAAGTACAAAACCGACTAGCTAGCGACCAGTTTCCTTTCG
ATTGAAAGGCGACGCACTTAACCGCCAGACTAACCGACCCGACATATTTTAATCTGGTCA
TTCGACAGAAAACAAAAAAATGAACCAATGGTGATTATCTACTTTATTTAGTAATATTTA
AGATCTTTTTCATTAAATGTGGTCGAAATAGAAGCAACCTTCAAGCGTTGTGCTCAAAAA
AAGCTAAATGTTTAAAAAAACATCCGTTTTAAGAAGCAAAAAATACTGACTGAACACATT
TATTGAGGTAAGATTTCTTTTTTAAGTAAATCACTTTTCAACTCATAGAGATCGTATATA
CATCACTTTTCCACTCATAAAGGTCGTATGTACATCAATTTTCTACTCTTAGAGATCGTA
TATATATCGAATTTTAACTTATAGGAGATCGTATATACAATTTCAACTCCTAAAAATCGT
ATATATATATATCCATTTTCAACTCGGTAAAGATCTCATATCTTTCAATTTTCAACTCAT
AGAGATCGTATATACATCAATTTTTAACTCATAGAGATCGTATATATATCAATTTTCATC
TCATAAAGATCGTATTTATAACAATTATCAACTCGTAGAGGTCGTATGTATATCAATTTT
TAACTCATAGAGATCGTATAAACATCAATTTTTCTACTCATAGAGATTGTATATACAACA
ATTTCAACTATTAACGATCTTATATCTATCAATTTTTAACTCATAACGATCGTGTATACA
TCAATTTCAACTCAAAAAGATCGTATATATATTAAAATATCGAACTTTTACTCATAGAGT
GTTGATAGCACGAGTATATTCAGGTAACAACCCGAGTTGATTTGTTAATTCTCAGGTACC
TAACCTAAGCACGAGAATTAAATTATAATAGTGAAGTTTAAATGCGCGAAAAGCTACCGA
TGTAACACAACCAGCTCAGAAGCATCGAGAGAAAAGTTTTTGTCATTGATGTCGTGTGAT
TTCCATTTAATACCAGTTTTGAAGCGCTGGAATGTAAGAAGTATGATTAGGGGATGTTTC
AATTATACACAACGCACTGCTATAGCTTGTGATCTGACAGTGGGCGCGAGGTAATCTGAC
GATTGCATGTTTGTTAACGTAACTTGCGTTTTTCCATCTACGGGGATAAACATGAATATG
TCCGACCGGTTAGTCTGGCGGTTTAGTGTAAAGTCTTTTAACCGAAAGGTTGCAGATTCG
ACACTGGTCGCCAGGTAGTCGGTTGTGTCCTTGGGCAAGGCATTTAGTGCCTGAATCCTG
CGGATTGATGGGTTCTACCAAATTTAAGAAACGTGTGAATCATACGCAAAACACTGCAAT
AGCTCCGGTAACCCGACGGTGGGCGCGAGGTGATTGCCCGTGTGTTAACCGCTTGGTTTC
CCATTCACAGGGATAGACATGAATATCCTATCCTAGAATTCTATCCTATCCTTTTTACCA
GTTTTACAATCAAACACATAGGTATAGCAAAACACAGCTTACCTCTATAAGAGAGCCATC
TCCCACGATCATGACGTAGAGAGCCACGCCTGGGATCCATAATATAGAAGCAAGGGATAG
CACCCAACCTACTCCATTCGCCCACGTTGGATAAACGTAATCACCCACTTTCAACGGGAC
CCACTTTGCACAGTAGAATACGAAGATTGCCTTTGCGTTATGAAAACGTTTGTTAGTTGT
TTACAAATTAAAAAAGTCTTTTGTATGGTGAAAATGATGTATTCAGCATTAAAGATAGCC
TATTTATGTTTATTCATGTGGTTGTTCGCACCGGGTTACTGGAGATATTGCAGTGTGTTG
TGTATGACGCTTATTAAATTTTAATGGATCCAGTAATCTACTAGGTTCATATCATGTCCT
CTAAGTGCGTTCTGCATAGAGTAATCATCTAAAGACAGTTGGTTTCGATCCCACAACCTT
TGAGCTGACCACTGACGACGATTAAGGCAACCAGACGGACGAACTGATACAGACTATTAC
TATATGCATTCAAATGTTTAGAGATATGTTAGGATGAAATATTCATGTCTATCCTCGTGA
ATGGAAAAACCAAAGGGGTAAACACAACACCTAAAAACACCTCTATCATAAATTGTAATT
CAAAATGCGACCTAAACACA
Chart Advanced