SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000659_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000659
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000594_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000659_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Sea Squirt (Ciona savignyi) Full length # Reverse
GTGGAAAGTATTGTTGGTGGAATATTTACCTAATCTTTAAAAGAGTCAGATATCTGCAGG
TAGCAGAAGGGATAAAAGATTGAAACCAGCCATTGGACAGTTGTATTCTTGGGCAAGGCA
CTTATCACACAGCACGTGACTGAAAACTGAAACGTCGCAATCATACATATGGTACAACAC
ACTCTGGGACCCAAACAGTGGGTGTAGTACTCCAACAATTTTCTATGGAAATACCTCTTT
TTTCATTGACAAGGGTAAAATATGAATATTCTCTCCATGGTTGTTTTTTTTTTGGATATA
TAATTTAATAGTAAATATAATGCAGAAGTGGCAAAACACAGAGGAAAGTATTACCACGAC
AGGTATTCATTCCATTACATAATCTACCTCGGCTGATTATGACACACTGCAATAATTGCA
GTGTAACCAGACCGTGAAAATATGTATTCTAAGTTCTGACCATGTTCGTGCATATTGTTT
AGGTGGCAGGCCTAAACAAATACCAGTATCCATTTATATACATCAGCTTATGTAAAAAAG
TTAATACAGAAAGGTATTGATTTTTGGTTATTTTAAGAATTCATGACTTACACTATGACA
CTGTATATATTATTTAAATTGGGGTGCCTCTTATTACTGCAGGATCGCTTGGAACCCTAA
CCCTTCAATTAATCCAAGGCCTCCAAGCGATCCTGTAACAATTAGAGGTACCCATTCCCG
TATGGAAAGTACGTCAATTTTCGCCGAGATCTCGAGTGTGCACACGCCAAATATTTAAGT
GTGCCGTGTGCAAACGTCCAAGAGTGCACACTTCAAGTGTGCACAAAATCTTTTTGTATT
ACTATTTTGTAAAAATCTTTAACAAACATATCATTCTATTCTAAATCTATCGTTTCCATC
AGCTAACATATCTATCTACGTTACAAAAAACGTACTGACAGTAAATTACCCGAGGTCCAG
AGGTAGGTTTACAGGTTTGTTGAAAATTACGATGTTTATACTGCCAGCTCACGAGCATGT
GTAAAATTACCCAAGTGTGCAAGGACGCAGGGAAACAAAAAAACTCGAGTGTGCAGCTGC
CGTACTTTCCATACTGGTACCCATTGAATTGTATAGACTACCTGGCCTCCATTCACTTTG
GTCAATGAATTTTTTGCAATTTTTTGAATGATGTGAGACATTTTGTTGACGTGATTACCA
CTCACAGAATAAAATACCTGATTTTTTATTGCTTTAAGTTTTTTGTTTACTATAAAATAA
AGAGGGCTAATTATAACAATTACTACCGAAACAGTATAAAGAGGTTACACAACCAAATGA
GGTAAAACCACAGACATTTCAATATACTACTTATACTAAAACTATTTATTATACCAAATT
GACGGACGAGTGATTATCATGACGATTAGTAAATAAGAACAAATACTGGTTACGCCTTGC
GCAATCTGGTTAATAATGACAAAGCAAAATCAAAATACAGCAGGTTCTTTCAAAGGGAAA
TAACCTAAATAAATACTGCAAGGTAAACTGCTCAAACAGGAGGATATAAAACATCTAGTC
AAGCTTAAATTTTTTATAAGAATTGAAAAGGACACTAAATTTATCCCTACATTAACACAT
TGCCGTTATAACATTTAAATCGTTAAAGATTACCACGTACCGGGCGTTTTATAGATTAGA
TTTTTTACCGCGCGCCCAACTTCGGGTTACCGGATCTGAAGCATAGTGTTGTGTATCATT
CACACGTTCATTTAATTTGTTAGAAGCTAAATAATTGCAGATTCGAAACTGGTCGCTAGC
TAGTCGGTTGTATCCTTAGGCAAGGCACTTAACGGACATTGCCTGGACCCAGTGGATTAA
TTGGTTCTACTTAATTGAACCGTGTGAATCATACACAACACACTGCAATAGCCCGGTTAC
ACGACGGTGGGCGAGAGGTTATCTGACGATTTCCCGAGTGTTAACCTCCTTGGTTTTCCC
ATTTACATGCATAAATATCCTATGATAAAGTGTTAGCTTTTATCAGACCATAAAACCACT
ACGTGGTATATATAGGAGACATGCGCTCAACGCTTTGTCCACACAATGGACTACCTGATG
GCTGGTTTTACTCTCAAGGTATGATCAAGGGGGGCGTAATTACACAGGCAATCATAAGAT
CACCTTCCGAACACCGCTGGTTACCTTAGCTATTGCGTGTGGTCAAAATGCCCAAGACGT
TTCTTCAATCTTAGAACAAATTTATCTAATCAATTTACCGGTTTTATGCGATAAGCCAAG
TGCTTTCCCCAAGGACACCCGTTTCGACGGCGGCTGGTTTTGAAGCAACAACCTTTCTGC
TGGTGGGAAAAGCACAAACTCAACAATCAGACAAGATTGTATTGCCGTGTTATTTATGAT
GACGACGTACCTTCATTCTTAGCAGAGTTCACTGATCTTCAGGGTTCAGACGATGTTCAT
TTTTAAGCAGCAAAAATAAAAAAAAAACTTAAAACAATTTTTGTTGTAACAAAACGGTAT
GTTATAATGCTTTTTTATTAGGACATGAAAACAGTCAATAACGAATGTATTTTCCAAAAA
AAGTCACACATTTTAACATCCTGGCCACACAAACCGACTGCAAAACTAATACAAAATCTA
ATATTATACATGCGACACTACTTGTACGGTACTCCGTAGTGCAATTTATGAAAAAAATAA
CAAATACGTTACAGGAAAAGTACCTATTATAATAATAATAATGCTTCTTTAGCAAATTAC
ATACATAACAGAAATTGTATAAACATAAGTTTACAAACATATTACTTTAAAATGCTATTT
AGATTAAAATAAGTCAATAAGGTCTGCTAAAAACCGAACAATAGAACATTTGAAGTACAA
TGTATTAAAGTGACTTGACTGCATAATTTTTTATTAGTTTAAACAATGCATGTAAGGTGT
AGATACCAATGTAGATATACAATCTGTATGGTAATTTTAGGCTCACATTTGTATTGCAAT
TTTTGAAGTTTGTTTTTAGTTCGGAAATCTTAGAAAGTTGGAATACTATCAAAATTTGAT
GAATTACACAATTTCTCTTACAAAAATCTTACATTACAACTTAAGATCGACATGAAAAAT
AAACAATAGCAATAACCAAGTCTTCATATTGTAACTATATATATATAAATTAGTGCACAT
TTTTTTACAATACTTGGTACGGTAATGGATTTTTGTTTACCATGATTAAACAGAAACGAA
TAAAACAATTAAATCAGTTCGACCAAAGTAAAAGAAATAGAACATTTGATATTAGGAATA
TACAACATAAAAAAACGAGACTGAACAAGAAGTCTATGAAATAATGTCCATGAGTATATT
ACATATATATATATAATCAACGTATTGCTAATTAACTTTTCCTGATTTAATTGTAAGTTA
TATGCAAAAAAAATAATTTTTCGTTAAATATTAATAGGTTATTATATACTTGTATATACC
AATAAAGAATTGTAGTAATATTGTAAAAAAATTAGAAAAACTGTTGTTGACTAAGATGGT
CTTTTACTATTTTCCTTTTGAATGATACAGTGCAACAGTGTATAATTCTTAAATGTTTGT
TCCACATTCTCTGACAAACAGGAGTGAGCTTTTCGAAGAAATCATGACGATCTTACCCAA
CTTGAAACAATTCACATGTTGAAGAAGGCCCGTCTGAGGTAACCCCTCCAACGACATAAA
ATTTTCCTTGGTGCACGATAGATGCACATGTGCTGTGCTCCCGCGGTAGGTCGGGTAACC
TCTTCCACTTTTTGGTTTCTGGGTCGAAGAGCTCGACAGAGCTTAAAGGCTTGCCGTTGT
TTCCAAGACCGCCGGCCACAAGGACCTGGTTATCAAGGACTTGAGCTGCTAAAATCCCCA
CGTTTGGTTGGAATCCGACATGCGTTTGGTTTGAATCACCATTCGTCCCTTTTCGTTCTG
CTCTGTTGAAAAGATCTCGCACGTGTCACAAAAGCCTTGCTGAGCAGTTTGCCGTAACCC
GCCAAGGGAAACGATGTGTTTGTCTGTGATTGCATAGCACGGGAAAACCCGTGTTTGTTG
GTAAGTTCAGGGTACGGGACGACCCGAGTTGTTCGAGCATCAAAGTACATAAACCAGTAG
AAAGCAGCACACTCGGAAGCTTGCCCTGTCTACCTCCCAAAACATAGGCCTGTGTTGTTT
CTATAACATAGGCCATGTGGCTGCTATAGCGCGCATGGTCCGCATTGCGCGGTAAAAGCA
TTGCCACTTTTCACCACCGGCACTGGCTCCAACTACCAAACACTTAAAATGGTCACGAGG
ATTCGTATCCATACCCATGCCACCAAAAATGTGGATTTTGTCATCCTTTAAAAAGTGTGC
CATTCCCATTAGCGGTTCCGAAAGTGGCGAGAGTTTTCTCCATTTGTTTTCTACCACAGA
ATACACCTCTACTGCGTCTGCCGGTGCCTGGGAGAGACCTACACCACCGATAGCGATAAT
ACGGCCATCGACGGCTGATACAATAGGTGCTGCTCGTTTTGTCGGCATAGATTTCAACCT
GGTCCAAGTGTTTTCCGCAGTTGAATACACTTCCACGAAATTAACGGGCTTTCCCATTTC
ATCACATCCTCCCACAATGTATAGCAATCCATCACAAACCACCAAGGACATATAGACACG
CGGACCATTCAAGGACGCAATGCTCGACCACGTGCCAGATGTCAAAGTCGACATTTTTAC
ATTAATTCTGCAAAAGTTTAAAAGTTTTATTAGTTGATTGCTTTAAAAAAAAAGTATATC
GGTTATTTAATGAAAATTATAAATGTGAAAGTGGTCTAGTAGATAATCAAAATAACCTAA
TTTAGCAAGAAACAAAAATCATATCTTTTGGCCAGCAATGCCCAAATGCATTGAAATGTC
TGGAAGATTGTTGAGTAGCCCTGTATTTCCATTCTCTAATATTAAATGTAAATCAAGATC
AGAAAATTGTAAAAAAAATG
Chart Advanced