SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000661_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000661
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000596_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000661_2.0 # Promoter # Selenoprotein U2 (SelU2) # Sea Squirt (Ciona savignyi) Full length # Forward
TCCTTCATCTCCCCATCTTCCCCTTCCTCCTCCACCCCCTTGATGTAGAGGATGTTGTTG
CATCGGATCAGCACCTCCCCCAGATGACCCGACAACGCTCCTTCCACGAACTCCTCTGTG
TTCGCGAGTTGCATGTTCATGTAGCCATCCACCGACACCAGGTATCCCTTGTACTCCATT
CCCCACTTCAGCTTCACAAGCACTGGTTTCCCTGTGAGTCCATTTAAGAATGGCTTCGGG
TTCATCGGTAAAGTCGACATTTTGGATGATTTGTTCAAAACTGTGAAATTCTTAGAGTTG
AAAACCGCTTGTTCTCCACGCTTGTAATGAGTATCAGAATCGGACTTAAACGAAACGATT
TGGGGAATTCCCAGAACCATAGAAGTATATATAGCGACAAAATATTTGACAAACCTTTTA
AAATTATACTAAAAATGAAATAAAATACTAATTTCATGACACTGAATAAATCATTTTTAA
ATATATTTTTAGGAAATTTGTAAAAGATTAGTCAAGCGCAAAATTTTACAGTAATTTTTC
CATAAACCGTATTTTCAAGTTCGACAGAAGAAAGCCAACTTTAACTGACACTGTCAGAGA
AACCAATCCAAGCGATCACGGTTTGTTTCCCGCAGTTTATAGAGGAGGAGGGACATTGGA
TAATGGAATGCTATTGCTCTGGTGCTTGCTGCATGATTGTAATATGTATCATGCAACTGG
TAAGTTTAATGACGTTACTTTAATTTATTCTGGTGTTTTTAGTTGTAAATATTTCAGTTT
AATGTTAATCTGTGTCTCCATATTAATTGTGTGATAATTATTCATACTATCATCATACAC
TAGTGTGTCAAACTGCCAAGTCGTCAGTCTAAAGGTTGTGGGATTGAAACCAGACACTGG
TAAATTGTTTCTGTCGTTAACTGGTATTGTCAGATCACCTCACGCCCACAGTTGGGTTAC
CGGAGCTATTACAGAGTGTTGTGTATGATTTAGATGTTCCTTTATTTTATTAGAACCCAT
TAATCCGCTGGGTTCGGGCAATGTCCGTAAAGTGCCTTGCCCATGGACACAACTGACTAG
CTAGCGACCAGTTTCGAACATTTTGATTGAATGGCGTCGTACTAAACCACTAGACTAACT
AGTCAAACATAAGTGGATTAATGGGGTTAAATTTAAACTGTAGAAAAGTGTCAAACTTAC
CTATTGGTCTGGTAAAACCAACTGACAAGTCAGGTAATCTTATGATTGCCTGTATTATAT
ACCAGTGTATGGCAGATTTCACCCAGAAATAAAGCTAAGTCAATCGAAGGAAAGTGCAAT
GACACATCCATATAGTGGCATTGTTGTGCAACCCTCCTTTAAATATATGAATATCCTGTC
CTATAAAAAAAATTTAGAGCCTAGTCATCAAAGCCAGGTTTCACATCCATTTACTTTTCA
GCTGACAATTTCCGCTCGGCAAGCATTTGATTTCCTTGGTTTCCAGTGGGCTGCGATTGT
TGTCAATTTCTGCCAGATTGGAGCCGTCATACTTGGACTCGCTGGAGCGTACAGGCAGAA
ACGCAGACTAATTGCAGTTGTAAGTGACTCAGCTCTTTTTATCGCGGCTTAATGGCTATG
TAGTTTTGTGCTTGATCTATTAACCAAAGGGTTGTTCGATCGAAACTGGTTGACAACTAG
TCATTTGTGTCCTTGGGCACTTGGCGGAAAATAGTAGACAAACCCAGCGGATTATTAGGT
TCCACCAAATTAGATTTGAATCATCACAACACACTGCAATAGCTCCGGTAACCCGACAGT
GGGCGCGAGGTGATCTGACAATTGATAACTTTTTCTGCGTTTTCCCAATCCCAGGGATAA
ACCAGGAATAACCAGGCTTTTCTAATAACTATTAGTTCAATCCATGCCAACCTGAGGTTG
CTGTTGCATTATATCCTGGATGAGCTTGGTTTATCTTTATAGCTAAATGAGATGACATAA
CAATGATTGCTTGCAGTACGCCACGTGGTCTCTCATATGGTTGGGATGGAACTCATACAT
TGTATTTCTCTACCTGGGCATTGGGGATTTGAAACTGGTAAGTTTGAGATATTCTTATCA
TGGCAACCGAACCACTGATATCTTTCGACCTTAATCTTCTGTTTTGAAACGCTTATTGAA
GCAAAAGTAACCACCCAAAGATTTATTTGCTTTCTTATTGTATGCAGCATGTTGTACCTA
CTCTTATGTAAATCTGTTATACAGGGCCAATATTCTCGTGAGCTCCCACATGGATTCTTA
CTCGCCTGAAATTTAATGGATTTTGGACCCTGGATATTTTAGGACCAACTTTATATTTTG
GAATAAAAATAAAAGTTCCAACAATTGTACTAAATATTCTTCTAACAGGAGGAACACATG
ATAAGTTTGAACCTCGGATTGAATGACAATTATTCCTGGTTTAAACTCCATCCATTCGGT
TGTGCAGCCAACCCCAACCTACCAAGCGGGGAGTTTTGTATTTATCGATTCCAATATATC
GAAATCTACCAATCCAGTGTCCAACTGTTACTTGGTGTGAGTACATGTTATTGTATAACT
GTTACGCACTGAAATTATGTATGTTTTAAAAAGGTGATTTATCTTAGTTTTGTCAATTTT
GCCTCGAGTCTAAGTAACTTTGTTATGTAATTTCCGTCAACATAGCATAGGGGTGCAAAT
GCTGATGCAAATTGGGTTGGGAGGGGTTACAAACGCAAATATAATTGAATCGCCTTCGCA
GGTGATCGGTTTCAGCTTCGCGTGCTACACCGTTGGAATCATGAAGGAGGACGAACGAAA
TTGTGAGTTTGCGCTTCTTCCCTCCAATTTCGATGTTTAAGTCGTTTAAGTGCTGTATTG
GGTCGTATAGGAGGACATTTGTGTAAATACCCACTGATTAGCTGTACAAGAGAGGAGTGG
GATTGAAACTGGTCGTTAGCTAGTCGGTTTAGTCCTTGGGCAAGGCACTTAACAGACATT
GCCTGAACACAGTAAATTAATGGTAAATTTAATAAACTACTGAATTTAAGAAACTTGAAT
CACAACACATTGCAATAGCTTGGGTAACCCGACGGTGGACGTAAGGTGATCCGACAATTG
CTTGTGTGATAATTTTCATTTTCCCATTCATGGGGACAAAGAAGAGTATCCTATACCATA
ATACATAATTAGTTTTTATTATATTTTGTATTTGTGAATTATAGTACTAATATATTAATG
TGTTAAGGTAGTAATATTAACTGTTGTATTTAGCTTTCTTCTTACATCATTAGTTATATG
ACATTCAAACAGACGCATGTTATAATTATAAAAGAAAATGGCAAAACGACAACGGTTATA
GCACATTCATATTACGAAACAATTGATTATAAAAATTGAGAATAATCTTTTTATGCCACT
TACCATTTTGACAGTTGATTTACAAATGGGCTACCACGGAAGTATTGGGAGCCATAAGGT
TGGAGAGGATGTTAATGATAATGGAAGGAGTGTTCAACCTCTCGTCGGGTGAGTGTTTTG
CCTTGTACTGAATATACCAAGTGATATGCTGACAGGAATGCAATCCTATTATGAAAAGAA
AAAATTTGGAAAATTTATTTAAAAAATATCCTTTCAAATATGTGTTTCCAAATACCATAA
AAATTGTAAAAAAATCAATGCAAAATAGTCATATCCAAGGCTATAATAACTCGATGTAAC
AATTAGGTTCACGTTCCTCGATTATACAGTACAACATAGGAATGAAAAGGTAACAAAAAT
GCTCTTCTGGTCCAAGCCTCTAAATACGTGGCAATTACATAAACTCATAGAAATACAATA
AAAATTAGGATTTCGTTCAACACTAATAATTACTAAAAAATATGCGGAACAACCTAATTC
CCGCAGCTACAATAAGCAATTAACTTCGAAATGCTGGAATCAAAAATAATTTCAACTCAT
TTCTTGGTTCTGAAATCTTGGTTCTGAAATGAACGTTAATGAACCCTAAATATTTCATAC
CTCAACCATGCTTGGCTACAGATCCACCCTACACACCTCATCCACTGTCTGAGTGAAACT
ATGAATTGCCCATCCATGCTACACAACTTCAAATACACACCACCACTAACCAAGCTGCAG
TTACATAGTTCGTACCCTGCCATTTGAACACAAGCATGATATGCAGTCACCTATTTGCCC
CTTCAATTCCTGTTTCAAGTGAAAATGTAGACATTGTGAGATTCCACACAACTTGGATAT
CGTTGTTGTTTATATTGGTTGAATATAATACCTGTTACATGTGCCTTGACATTGATCAAT
GAATATTATGGAAATGTTGTATTGCTGCATAGTTTCTATGTATAATCGTGTTGAAATTAA
GTTTATTTTCATTTGTTACCTATTTTAAGTATTATGTTACGTTTTTCTAATCACATACAT
TAGTGAAAAATATTTTAATTTTTTAATTATTTGCTGTAATCTTGTTATTTTGCATTCCAT
TATATTTTAAGTTGATCAAATTGGTACTTTTGTTACAGAATGTAGGTTTTTTTAACTTTG
TCGATAAATTAAATATCTAATGGAGCTTCCTCAAGAACTAGAAATCGAAAGATTCCCGGA
GAAATTATTCGATTTGGATGAAGTGGACGAATGTGTTCTGCGCGACCGGAACGGGAATCC
GGTGTCGTTTAAATCGATCCGAGAAGACGCAACTTGTATTTTCGTATTTGTGAGGGTAAG
ATGTGGGATTTGTTATGTGGCAATGGGGCGGCATTAAGCCAAAAGGTTTTGGCATTGAAA
CTGGTCGCTGGCTGGATGAATAAGCAGACATCGTTCTAACCCAGTGGGTTCTACTAAAAT
AAAAAAAATGTCCTAATTATACAACTCATTGCAATATGATTTCATGATTGTCTCGGTGAT
TACATCTCATTTTGTTTTTCCCATTCACATGGCTAATGTATTGCCCTTCAAAAATGTGAT
ACACCAACCAATATATTCCT
Chart Advanced