SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000667_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesCiona savignyi (Sea Squirt)
Promoter IDSPR00000667
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000602_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000667_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Sea Squirt (Ciona savignyi) Full length # Reverse
TCGTACAACCGTTTGCAATAATCCGAAGTTTTTTTCAACAGTAATCTTGTATACCGAAAC
TTAACAATAATTACAGAAATATCCTATTGATTTAAGCAGATATTTTAACCAGGGCCTTAG
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TCCAATTACCTCGTGCCCACTGTCGGATTACCAGAGCTATTAAACTGTATTGTGTATGAT
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TCTTGCCCACCGACCCAATCGACTACCAACTAATTTCGACGTACAACCCTTCAGCCTGAG
GGGCGACGCACTAACCCACCAAGCTAATCGGTATTAAGATTTTTACTAAAAAGCAATAAA
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CTTAAAAGTATCAGCTATCATCCCTTAAATAACTCTTTTAAATATGATGTTACATGTCCC
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TGATTTGTTTTCTTTTACTATGTTAAAAGAAAAAAAAATTCGATCGAGTTGAAAGACATG
TAATCTGTTTTCTTTGTGGTTTTTGTTTCCTAACATAAATGGTTAGGTTCTTTCACAGAA
CATCTATATCAAGTTTGGAT
Chart Advanced