SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000802_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein W (SelW)
SpeciesDipodomys ordii (Kangaroo rat)
Promoter IDSPR00000802
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000737_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000802_2.0 # Promoter # Selenoprotein W (SelW) # Kangaroo rat (Dipodomys ordii) Full length # Reverse
TGCATGAATGAATGCACCTCTCCACCTCCATACTCATCTGTAGTTCCTTAAGCCATCCTC
CAACCACGGTGAGCTCAGCGGTGGACGTCCCTCCCCTCCAAACCCACACTAGAGAGGGTC
TCGGCTTCAAGCCTCAGGATGGTGAGGGGGTGCGGCTCCCCTGTATTGGTCGGGCATTTT
TTACTCGGTGCCGGATACAGCTGGCACTTCAAGAACAGCAGCCAGGGTGAGGGTTAGACA
GTAAGAGGGCTCTGGTTTGGAGCACAGAACTGAGTCAGCAGGTGTCCTGAAGGACCTCAC
CTGTCCCTCCCAGGCGCGACTCAATCTCGATGCCCGGATACTGCTCCTTCACGGCGCTCG
CCAGCTCCAGGTAGGTCGCCTCGAAGCCGCAGGGTTCACTGCGGAGAAGAGGTGGAGCGG
GTGGGGGTGGGCTGGGGTTCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCTCCCGAGGACCTACCTCCGGC
CCGCCCGCCCGCCCGGGGAGCGCAGGGGCGCCCCCAGCTCCAGCAGCTCACCAGTACTCC
ACCACGATGCGGACCCCACTGCCCGGCTCGGCCTCCCCGGGAGGGGGCGCTAGGGACACC
TCCCCCGGCTCCCCACTCATTGCTGCCAGCTCCGCTCCGGCCGCCGCTTCCGGGTGCGAC
GCGGCGCCGCGGACACGTGACGGGGCGGGGCCGCGCGTGGCGCTCGGGCTCCCCCTGCAG
GCGGCGTCTAGTAGTACGGCGCTTGAGCGTTTCAGGCTGGGCTGGGTGAACCGGTTCACA
CCTCTGGGGCTGTGAGTGCCAACTTTGCCCCTGTCCCTTCGTGTTTGTAGAACTTTGTGT
CTTTTCTTGATCTGATGAACTGTCTTCGATTGCAAAGTCCTTGCCAAAACCAAGAAGAAA
TGGTCAGGCAAGCACCACTGGGGACGGGGAAGAGGATGGGAATGGGGTGGCTGATGACAG
GAAATAGTTGCCATTTCTTGCTAACATGGTGGTGGCATATTTGTTTATTTATTTACTTAT
TTGGTATCCATACTGGGGCTTGAACTCAGGTCCTGGGCACTCTACCACTTGAGCAACATT
TCCACTTCCAGCTTTTTGGTGGTTAATTGGAGATAACAATCCCTCAGATTTGTATGCCAG
CACTGGCGTCGAACTAGGACACTTAGATCTCAGCTTCCAGAGTCCAGCTTAGATTTATTT
ATTTTTGCCAGTCCTGGGGCTTGAACTCAGGGCCTGGGCACTGACCCTGAGCTCCTTTTT
GCTCAAGGCTATCAGTGCCACTTCCAGTTTTCTGGGGGTTAACTGTAGATAAGAGTCTCA
CAGGCAGGGCGCCAATGGGTCACACCTGTAATCCTAGCTACTCAGGAGGCATGAGATCTG
AGGATCGCAGTTCAAAGCCAGCTCGAAAGTCCATGAGACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AGGATCTTTCCAAGTGCAAACCTGCCCACTGCTTGGTGCCTCTGCTTCATGGCCCAAATG
GAATCTGCAGGGTCTGGTCTGCCCACTGCTCCTGCCAGTCTGGACAAACAGGATGGGTGG
CTCTCATACCTGGTTTGTAGAAGTCACCTGAGGGCTTGTCAATACCTTACATTCCTGTGT
CTCTGAAGCTGAGGAGTAGCCCAAAGATCTGTTTTTCTCCTCAGCTAAGAGACTGAGGTT
GTGGTTCCCAGGCCCTCTTTGAGAAGCACAATAGCTTTTCTCGTACCTGTTGCTCATGCC
CAGGCGTCCCTGGGAGTGGTCTTTCCCCTCCCTCCCCACTCTCTGTCTCTGTATTCCAGG
TCTCCGCCTACCTGGGGTTTTGGCACTCTCTCCCTAGTCATCTCCTTCCTAGTGCAGCCG
GCTTCCTCGGCTCAATCCTCACTTCTGCAGAGAGGTGACTCCCTAGCTCCTCGTGTGAGT
CACCCTCCCGCCATAATTGCCACAAGTCATTTCATATTTGTGTGAATCTCTGATTCAGGT
CAGTCTCTCAGACTGGGTTGCAGGAGGGTAAGGGCGGGTCTGTTATTGTTGCTTACCTCT
GCATCCCTAGAACCAAGCAAGAGACGGACATATGCTAGGTCCTTAAAACAGTTGAACACC
AGAAGGAGTGGATTGCCTTCTCTGCCTTTGCCCTAAGCCTTTCCTTGACCCAGGCGACCT
TGCCCCGCCCCCCGCATTCCCCCCCCCCCCCCCGCCCCTTTGCTTGGCCTACTGGTTTTT
CTAGGAAAACTGTTTGGAGAAAGTTGGGGTGGAGGCCACTCCTCCGAGCTCCCCGGGAGC
AGACCTCTCACCCCATGGATTGTTTATTTTCCCAACTGTCACCCTCATCTAGCTTGGAGG
TGGCCCGTGTCTTTGCCTTTGATCTTGGCCTCCCTGCCCCTCTTCCGGATCCCCGGTGTT
GTTTACCCCGAAAGCTAGCGTTAATTGCTCGAACTGGACTCCCCGGCACCTGGCCTCCAG
TTTTCCCCAGATCGCTGTGACTCCTCCCGTTGGGAACCCGGTTTTAAACCCCTGCGATTT
GAGAAGTGGAAAGCGAGAACACCAGGCCTTGCTCAGAAGGGAGAGGAAAAAACACAAGAC
TCTGGGTGCCTCTGGAGGAG
Chart Advanced