SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000856_2.0
Identity
PromoterSelenophosphate synthetase (SPS)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000856
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000791_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000856_2.0 # Promoter # Selenophosphate synthetase (SPS) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
TTTCCAATGCCCAGCGTGGGCATCACTGCCCCCAGAAGCTGTTCATCTTCTTGGAAGTGG
CTCTCTTGTAAGGATACCAGGACTTTCTGCAAGACATCTTGGGGCACTTTGCAGCCTGTG
CCCTTCAGTTCCATGAATTTGGTGAGCCAATTGTCCAATTCGTAACTTTCTGGGCTAAAG
GACTCCCGCATAGACATGGTCTGGGGTGCACACGCCTCCCAGCTTAGCTTCTTCCCCTCC
TCTCAAGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTTTCTGATATTTGTTCAGCATGAGATATAAGAAATGTGTGACATCACACAGCACTAGCA
TCCATCTTTCCTGATTTTAAATCACACACTGCTCCCTTGTTCTGTCCAAATGGCTGTTTC
TTATTTTTCCTGCCCCCTCTGCATTGCTGCTGCTGTTGGGCGCCACAATGTCAGTCCTGA
ACCCAAGCAACCTTACGCACAAGCGAACAAAGCATTGCCGCATTGCCGCTCCTGCAATGT
CCTCCGATTGTTCTTCTGCAGGAGTCCATTGTAGAAGCCCTCTGTCAATTTATATCCACA
CTAGTACCAGGCAATATTCTTGAATGTCCTTTATGCACAGTGGTATCCATATTTATTATG
CTCCACAAAGTGAAACTTGGTACTACAGTTGATCTTCACCCATCACGAATGGAAGAAAAG
ATGGTGTAAGAATGTTGAACAGAAATTGTCAAAGAGCAGTTCGAGAAAGCACCATGAAGT
ATTCTAGTAAGAAGTTCAAAGACAAAAAGGAGTAGCATGCTCAGCCAACCTCAAGATGAA
AGAATTGAAGAAAAATGTCAAGTCTCCAGTTGCTATATTAAAAGGTTATATGGAAAAATC
ATTGAATGATGCAGGAAATGCCAACATAAGAGAGAAGAAATATACAAAATTGCTAGAACA
AAAAAGAACTAGTGAACATTCAACCAGTTGAAGAAGGAGGGAGGGAGGCAGGGATTCATC
CATGCAAATGAAGAGTTATCCCAAATCAAGGGCAGCAAGTCATGGACAAGGGAAAGGCAG
ATCTGTGAAGGACATACTTTACCCTGACCTAAGTGTTGAGTGTATGTGTTTAATTAAGGA
CATTGATTTAATTTTGGTGAAGAAGCATACGTTCCAGTTCTAAGATATTCCATAGCATAG
ATCCTAGAATTAAAGAATGATTCTTTGATTTCCTGGAGGCCTGATTGCACCTTCGTTAAG
CATTTGACAACTAAGCGGTCTGCAGTTCTAACTCATCAGCCACTTTCCAGGAGAAAGATG
TGACAGTCTGCTTCCTTAATGAGTGCATTTCAAAGACTTGATAATTCCTTAAAGAAATTG
TATGAGGCTGTTTAACTCTGTTATGTAGAGTGGCTATGAGTCAGAATGGACCCTATAACT
ATGGGTTATGGTAACTGAGCTTCAATTGCTATAGGGAGCTCTCATTGGATAAATCCCTAA
ACTGCCTACTCGTGAGACCTAAATAAATCTCAGGGACTAATTATCTAAGAAAGACAAAAT
TAGAAGCAGTAGAAAATTCTTCAAAAAGAGTAACCGAGTCAAGGTCCCCAGGCTGACAAT
TGAATAATTCAAAACTTTTGGACTCTAACCCAAATCAATTTATTTTACAAAAGCCATAAG
CCTTGTTTAAACTTAGTGTTTATAATTTGAACAATATGGAATTTCTCATATTTTTGATCT
CCAAAAATAGCAATTGCATGAGGCTAAATTAAGTTAATATTGTAAATAATGGAGAATAAA
TAAGCCAGGCCCCTCTGTGTACATTGTCTATATCTAACTTGTCTGCTTTTACAACATATT
ACATACCTCATGGTAAGTTGCTATCACTTCACCATCTGATAGTGTGTCTTCTCCTGGAGA
GAGAGAAAGGTGTTTATAGAAAAAGGACATTATACTTCATTAATCATTCTTTTATTTGAC
TATTTCTTGATCCTCTATTAGGTTCCAGACATTGTGCTAAAACTGTGCCAATATTAAAAA
AAAGTAGACGTGGGTAGGAGAAAATATGTTTAATGAATAAATATATAGTTCTTTCATGAT
AAGTGATGAGTTATGAAGCATGACCACTGTAAGAGGAAATAGGAGGAAAAACTATATTTA
GCCCTCTTTCACGAGGAGTAGCTCTGTATGAACTAAGTAGAGTGTGGTAAAGAGAAAANN
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