SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000860_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein K (SelK)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000860
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000795_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000860_2.0 # Promoter # Selenoprotein K (SelK) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
TCGTGGCCTCCGTCTCCCCCCTCGGCGCCCCGCCCCCTTAGGTGCTAATTCTAAGGGACC
GCTTTCTCTGTTGACTCAGGAGGTCCTTGCAAGCTTTCCAGCTTCCGTTTCCTGGTTCCT
TGAGGTCTCGTGGACACGACATCTGTCTTCCCTCAACTGTTCTTTAATTCTTCTCCTCTT
TCAGATCTCAAAAGAGATTGGCTTAAGACATGCCCTACAGGGGTGTGAACTCACTAAGGT
AACAAAGGAAACCCATCCCAAATGGACTGTAACTCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGATTAGGATTTACAGCACATACTTTG
AGAGCTACAATTTGATTGATAACAGTGCCCATAACTGAGAGTCCAGCAATAGAGAAGGCT
TCGTGTAGAGAGTGCTAGGCCGTGTTGGCTAGAGAAACAAATACAGAGATACTCATATAT
GTGTAAGAGAGAGCTGTATATCAACAAGTAAATGATGTATCAATGAAACATCCCAGCCTA
GTCCAATTCAAGTCCATAAGTCCGATACTAGTCCATAATCCCTCTTCAGACTCATGCAAC
CACAAGCAATGATGCAAAATGCAGGAAACCCACTGGCTGGTGGATGCAAAGTCTTGTGGC
TCCAATGATGGTGGACGCACCTCCAGGGCTCTGGCAGGGCTCTGAGTGACTCGATGGCAA
GAAGATGAAGGTAGAGAGAAAGAGGAAGTTCCCAAGGTCCTTTTTATGAGATGGCCACAC
CGCCATGTTTCTATGGGAGCCAAGTTGGCACAGAAAATCTCACTAGCACATGGAGTATGA
GTCAGACCTTCCTCTGTGGATCCCCACCCTCCTGCTTTGTCCTAAGTCCAGATTCCCTCC
TGGAGGTGAGAAGAGCAGCCTATTGGCTGAGCCTGGACTTTGGAGCCAGACAGCCTGCAC
TCTGAGAGCCTCAGTATCTTCATCAGGAACCTGGGGATGATCAGACAACCTCACGGCGGT
GCTCTCAGAACCAACGTTGCACCAACATCACACTGCCCTCCCCAACCCAGTGAATATTAA
TCCTGCAGAGAATATTAATCCCAGAGCAAGAGGGCCCTGCCCACCTTCCAGCTCTTTAAC
AGAGGTCTTGCTTGTGCTCTGACTGCACCTGCTTAGGTGTGAATCATCCCTGGATTCGAC
CTGACGACCAAGGGCTTTGTGGCATGAATGGCTCAGGTTCTTGGGGCTGATCCGGATGGC
CCTGTCTCGGCTTTCACAAAGGGAGGCCACCGGTTGCCCCCGTGGTCCTTATGGGATGAG
AAGACGTGGAGCATCCCAGAAAAGGAGAAAGCACAGCACTGGAGCTGTGCAGTGCACAGC
CCGCATCACTGGGTTCTGTGACCTTGGCCATGACACTGAGCACCTCCAAGGAACCTCAGT
GGCGAAGCCACAGCAAGGGCTGAACACGTGATGGGGCTGGGAGAGGAGATTGGATCACTT
CCAAAGCTTTCAGCTGTCCGGGTAATTGGTTTAACAAACTTGAAGAACTCAGGTTCTCTC
TCTGTCTCTTTGACTGCGTGTATGTGTGTGTTGGGGGTGGGGGGGGGGGGCGGTGCAGGG
AGTGAGGATGAGGAGTTAAAGTCAGGCAGAAATAGTCGAAATATCAGCCAATCTTGTTGA
CGGTTACTCTGTGATCCAGCCTTATGTCATGGTATACGTACTGTGAAAAGTAAACATGAA
TTACATATCTAAATACCCTTCCTGTATCCTCCACATCCTTTCAATGGCTCTTGTCCAGAC
AGCAGGGTTTGTTTTTTTTAAAACTTTATCAGTTATTCAATTACGTTCTTTGCAAGAAAT
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