SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000873_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein R (SelR)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000873
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000808_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000873_2.0 # Promoter # Selenoprotein R  (SelR) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
TAGTGACACCAGGTTCCCGTCCCGCTCTCACACTCCGACAGCTCTGAGTGCACCAACCCC
ACCGAACATATCTTATTTTGAAGAAAAAAACCAAAACGGGCAAAAACACCCGGCGGGCCA
GATAAACGTCCTCGGCAGGCCCGCATGTGGCCAGGGGCTGTAGTTTGAGGATCCCTGATC
CAACTCCTGGTACCAATTGTGGTAGGCTGAGTGGTTCTAGAGAGGTAAGACCAGGAGACT
TATGATTATATATTTGTGAAAGGATATGTGTATATAGCAAAGAGGAATATAGTAGCAAAT
GAGTCCACAGGGCAATACAGAGAGCTCAGTCCTACTCATTTTCCTGGGACAGTTAATATA
TTGAAGGTCCTTTCAACTCATGTTGTCATCATGTTGTCACTAGCTCAAGGCCAAGGAAGC
AGACAGTAGGAAGATTACCTGGTGAGTTGTAGCACTGGCTAATTGTGCAATGTAGTGAAG
CAGGTTGCAGTGGAGCCTCACGTGTAGCGATGCAAAGTGGCTAGTGGGCGTGGTGGCTGG
AGTGGTGGCAAGACAAGTGGAGTCGGTCCACAGGCAGCAGACACAGCAAGGTGGGGTGGC
ACCCCAGCATAACAACTCAGCACAGCAATGCGGTCCACCAGGGTCCATGGGTTAGCTCAG
CGCGCAAGCAGAACAGCACACGTATTGAGGCAGGGCAGCTAAATCAGACAGTGCACTGGT
CTGACCACCAGTGAGAGGGAGAGAGGGGCTGGTCTCCAGAGAGCCATTTATCTGGTCACA
CATTCAAAGGAGGTCATCAAGCTACAACCTGATTGACAGGCTGAACTCCACCCATATCTT
CTTATGGGCACACAAAAAACCCCTCATATCACAGAAGTGCTCCCTCTATTAGTGGGTAAT
GATGGATAATTTAACTTACCTGAATTTATTTTTTGTTGTTGTTTTTTGGATTTTGTTTTT
CTTACCCTGAATTTAAATGTCTTCATCTTTACCTTATTAGTATTCTGGGTAATTAAATAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACATGGAGACCCTGCCAGCGCTGAGATGCTTCTACCGCCA
AAGACTTTCTACCCACTGCCTGTGATCTTCTGCAATCAGCATCATTGCATGTGTTTCTGA
GTCTGAAGAGGACTTATAGATTGCTGTCAGACATATGGGTTAACATTGGATGTATGTTCA
ATTGCTCTTGTACATAAACCTCTTCCTTATATACATATGCGTGTTTATGAATTTGTTTCT
CCAGTCTACGCAGACTAACACACCAGTTCTTTCTGAAGTGACAGGGAACCATGTCCAAGA
TTTTTGTTAAGTGAAAAAACAGAAAAGTGCTTTTTTAAAAAGTTAGAAAAAAACATTTAG
CTTTGTATATGTATGACGTAAGTGGGAAGTGTGTATAGGACATTAATAACAGAGGTTGAC
TTCATGGAGAGGAAGCCAATGTCAGCTACTCCAGGTGAGTGAAGGCTTTCTCGGCCTGGT
TTTGGCATTGTGTTTGATCTGGGTGTGCACCAGCAACTTGAAATCAGTGATGTGTTTGGA
AAAGTAGCTATACAGTTAAGATTTCACTAAAAAGAGTCACGTACATCACAGCCAAGGGAT
GTGGCCTTGGCTTCTACAAAATGACCTAGCACTTGTACAAAAGTCACATAGACCAGTGAA
ACTGAGAATTGACAACCCAGAAATAGATTCATCCACCCACAGACAGCTAAATTTTGACAA
ACGGTTCAAATATATTAAATGGGGAAGAGAGAGTCGCATCAACAAATGGTAGTACAAAAC
TGATTTCCATTTGCAGAAGAATTAAACAGGACTCACTCTATATACAACAAAAACTTGTCA
TGGATTACAAACCTAAATGTAAACCCTAGACTATCAAGTTCACCAATGAAAAATTAGGGG
GCCGGGTTTATGGCATAAACACACTACCAAACATAATGAAAAATACACGGCAGAAGACAA
ACAAGACAACTGAGACCCTCAAAAACAAGACACGTGCATCAAAAGACTTCTTCCCAAGAG
TATAAAAAGAGTTCATAGACCAGGGAAATGTTGTTTACAATGACATAAAAAAGAGACAAA
TCTCTAGAATCTATTAAGAAGAAAAGCACCATGTATGATGAGGATCATTTTACTTTGGAA
ACACTTCCATAATAAAGATAAGTATTAAAGAAAAAAAGGAAAGGAAAGCACCTTGGACAC
CTCGCCAAGGAAAAGACAAACCACTTTACAAATGGTCAGAAACACAGATCACTGAAGAAG
ACATTCAGGCTGCCAACAAACATATGAAGACAGACTTGTGGTCACTAGCCATTTGAGAGA
TACAAATCAAAGCAAACATGACACCACTTCACCCAGACACTGATAGCTAAGTTAAAAAAT
AATAATAATAAAGTAACCAATGCTATACAGGATTCGGAAAGATAAGAGCCCACGTAGACT
GCTAGTGGGATGGGGTTGTACAAAAGTATACCCACTGTGGGAAGCATAATAGCTCTTCCA
CAAATTATGAGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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Chart Advanced