SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000885_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein R (SelR)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000885
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000820_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00000885_2.0 # Promoter # Selenoprotein R  (SelR) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Forward
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CTGAGTCTGAGACTGGCCCTGCTATCCCCACAGCGGTCCAGGCTTACCACCCGAGTCTCC
CGCCCTTACAGCCTGCATGTTCTGCCAGCGCCACCTCTCTCAGCCTGCGCCATGGAAGGG
CACAATGTAGTTTGGTGCTGGTCTGTGACATGTACAGAAATCGAGCCGAGGTTTAGGTGT
TTGTAATAGCAGTGCGACAGAGCGGTTTTGTCTGTTGGAACCTATTATTTCAAAGAGGTA
TATACGTTTTGTTTTCTCATTCTACTTTTCCAGAAGTTCATGGAACTGTATGCTATACAA
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GGCACAGTAACCCTGTGGGGCAGTTCTGCCCGTAGCGAAGTCACAATTACTGCCAGCAAG
GGGTGCTAAGATTCCCCATGGACTGGGAGTAGTGGGTGGGGGTGCTGGGTCCTCATGGTC
ATTAGTAGAGCACTGGCCTAAGTTTCTCTAGAGCCGGTCCGTCAGTGTCTCCCCTTGTTG
GCCCCCACTGCTGGATCCTACCTGCCTCACCCCTAGCCTGAGGCCCCTGGGGTGGGCTAG
CTGTTCAGGCCACCTTCCCCATATCCGCTCTGCACAACATGTGGGCCCGAGGCCAGGCTG
CTTTAGCAGCACTTCCCTGCTGCTCTGAGGGCAGCTCCTTACTTCTGGGAACACATGGGA
GCCTCATGTCTAAGCCTTGCGCGTGCTGCCCTCCACCTAGAACCATCTTTCCCCATCCAC
ACTCGATGACTCAGATTGTTCTTTGGGCTGTTGCTCTGACGTCACTTTCTCCCAGAAGCC
CTTTGTGCACTGCTCAGTTTGGCTAAGAGCCCTTTCCTGGGGGTTAAATTTGGCCCCAGT
TCCAGCACTCCTCGTGCTGTCCTGCAAGCTATACTCCCACCAAAATGCTGTGTCACTTAA
GGGGGAAGACCCGCTCCCGGCTGGCTCCCAGGGGAGACTACTGTAAGGGCATCCTGTTCC
CGTCCCGTCCATGACCCACGGTGTGCCCACCTCCTTCCCTCTGCACAGGGGCTCTTAGTG
GGAGAGGTTGGCTCTCTAGCTGCCCTGTGACTTCCAGCTGTCAGGCATGTTTGGGTGGGG
GCCATCAGGACCACCGGCCACGTGCACCGTGAGGAGCACATGCGGGCCCTCTCCCGGGAA
GAGCCCCTACATTCGAGCCAAGAGCTAGGCCTGATTCAGGGCCAAGGATCTGCCGCAGAG
GCCACTTCGCCCCCTCCTTTACTCCTCTGTGCAGCAAGCCGAGAGGGGAGAGCCTTTCCA
GAAAGCAGCCGGGGGCAGGCGTTGCCTGGGGTTAATGTTGCTAGAACCAGGTCTTTCTCT
ACCACCGTTAAGGTTGGGCACAAACAAGACAAACGCTTACCTGCTTTCAGGAAGAACCGG
CTGCCCTTTCTGGTGTCGACGAAATGGGGTCCGAGTGCTTTGAACGGCAGGGAAGTTCTG
CTTGCAATCCTGGGCAGCCTGTACTGTGTCCCCCTCCTCTGGCTCAGCGGTCCTCCCTCC
TCACGCCCATCACAGCACTGTCACTAGCCCCTCCTCCTCCACTCCCCTGCCGCCCCCCAA
ACCCTGTGGGTGCTGTACCTTCAAGCAGGCTGGGTTTAGTTCAGAACTCCAGGAGGCTAC
TGCCCAGCCGGCAGGTGGGCTGCTGTTTACTGGGCTGCTGCTAAGCCCGGGACAAAAGTC
CAGGCCGGGAAGATTGGGAGGCCACTCAGAGGCCCGGAGGCCAAACTGAAAATCAATACG
GTGCAGACCGGGCAAACGGGACATTGGTCCCAGCAGGTCATCTGCTGCTCATGGGAGTGT
GTGTGTGTATGCTTGGTGTGTGTGTGTGTGTACTCCGTTCTCTGCTTCATTAACTGTTTC
CATTGAGCCCCTTTTAAGTTCCTGAAAGGCAGCAGCAACCTGTACTTCTTTCTAGCATTC
TCGGGCCTGCCAGGCCCCCAGGCAGGGGATCCACTCTCAGGGGTAGCAGTGGTCGGTCAG
GTCCCACCGTGCACTTCACTGTGTGTGTGAGGTGGTGGCTGCAGGCTGATTTGGCATCTT
CCCTGCCCCCCAGCAAGTTCCCACAAAGTGGTCCAATTAAGGGCTGTACCCTGGAGAGCA
GGCAAGCATCTGGAGCTTGAAGCAAGATGAGGATGTTGACCAGGAGCAGGAAGCTCTGCA
GGGGGATGGACCTGGACTCTCTAGCTTTCACCTGACCCCTCCTGCATCCAGGGTCTGGGA
AGAGATGAGAAATCAAGATGGACGAGATCCGCGGCGAGAATCTCAGGTTCAAAGTTCAGC
ATGCAGGTAGTTGACGATGTCACTCACAGGTTCCCCCCATGGCTCTCCCTCCTCCCTCCA
CAGCAGATGCGCAGTTTACCTGTCAGGACTGCGGAGGAGGGCTACGTCACGGAGTGGAGC
AGAGTGGCGACACGCAGGCCTTGGGGGAGCCTACTTCTGAATCTGTTTCCCACTTACTAG
CGGTGACCCGACATCACGTCCCTGTGAGGGGGCCTCAGACACGCCTACAGAGCACCTGGA
ACAGTGCCTGGGACACAGAGTGTAGTCCCTGCGAGTTTTCTTCTCTCTTCTTCTCGTGCG
CAATGGAATGCTGTGGGAGGCAGAGCAGGGGTCAAAGGGTTTTGGACAAGACCAGAGCGA
TTACAACAGCCCAGGTAGAGATGAAATGAGTGCCGGCATGCATGTGGACGGACAGACGGG
AGCAGGTCCTGTGAAGAATCAATAGGGCTTGGCAGCTGATCGAATGAGGCAAGGAGAAAT
GTCAGGCTTGAAACGGGACAAAGCAGAGAGCTGATCTGACCCCCACAAGGAGTACCGGGA
TGGGTGGCTTAGGCAAGACTCACAGCCACCTCACAGGATAGGGTAGAAATGTCCCCCAAG
CTTGAGACTGTCGCCCTCTCTCCAGGAGCAGCTGCTGGGACCATGAGAATGTGTGCGGCC
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CAGTCTCAGGGGACAGCGGGTCAGTTGGCATTACATAGTTCACAAAGACAATGGTCTACA
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AAATAAGATATGTGCGGTGGGGTCAGTGCACTGGGAGCTGTCGGAGTGTGAGAGCGGGTC
GGGAACCTGGTAGCACTGTT
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