SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000896_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein W (SelW)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000896
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000831_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000896_2.0 # Promoter # Selenoprotein W (SelW) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
CACTGCCCGGTTCGGCCTCTCCGGGAGGGGGCGCTAAGGATACGGCCCCCGGTTCCCCGC
TCATCGTTGCCGGCTCCTCTGGGCTGCCGCTTCCGGGTGGGACCGACGCTATATCTTTTG
ATATCCGGGTACCATCAACTTTTTTCACCACATTTGCTTATGCACACATTTGTCTTCAGC
GACTGTATCGGGAAGGTGTGCATCATGGAATGACAATTTAATAGAACAACGTATTCCTGC
ATTGAGTAACTACTTGAGTGGAGGCCCAATGTCCATCTGCTGCCTTAATACTAAACCTAT
AACTATATGGATATAGATCTATTTCCTCACCATCCTATATAAATATATTTACATATGTAC
ATGCCTGTAATTAGACCTCTATAAATACCCTTTGTCACCTAGTTCTTTCCTCTATTTCCT
TTTATTTTCTTCTTGTCCCACAATCATGCTCAGCCTTTATTTGGGTTTCAGTAATTTCTC
TTGGCTACATTGCCCTTGCTGAATCCCTACCAGGCCTTTCACACCCTTCTTACCACTAAT
TTTGGATCACTTGTTGCTCCCCTGTCCCTGGGTTGGGTTGGTCAATACCACTTCCTTACT
CCTGCCTCCCCCTCTCCCATGCCCCCCCCCCCCCCCGTATCATTGGGCCCGGTGTTTTCT
CCTCCCGGAGATTTCTCTAGCCTATCCTATCTAGATAGATCTGTAGAGATAATAACATGG
ACCCAAAATCAAGGCATAGACAGACAGGTGACAAATGAGAACACAGCGATGACCACCAAA
AAGAAAATCCATGAGCCCTAAAAAGAATAAATTTATTTAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAA
AGTTCACGTCTCACTGGGGTACTCCAAAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCGGTGCGACACTGCACTCTAGCTGACTCAT
CCCTTCCTGTGAGCCTTCTGTGAGGGGGGTGTGCAATGCTCTTGATCATTTTTAAGAGCT
TTTGTGCAGCACATTTGCTTAGTGCAATTCGTTGTTTGGTTTCCTCGATGTTTCTTCCGT
GCGTGTTAGTGGTGGATATTTACAGACGTTTCTTCTCTTTGCGAGTTGTGTCCCCTCAGT
GAATGACGGTCGTGAAAGCCTTGCTCCACCCACATCATAAAGGTTAACTCTCCCTTGAAG
GGGCAGCTGTCCACTACCTTTGGGTTGAGGCCTCCCAACCCGAAGTGTCCATCTTCTGGC
GCTGTATCAGACACGGTTCTGCTGCTACTCAGCACATTTTCAGTGGCTAATCCCTTAGAC
ATGGATGGCCTGTTTCTCCTTCCTTGTCTGCACTCAGTCTGGAAGCTCCATGGAAGCCTG
TCACTATGAATGACCCTGCTGGTATTTGAAACACAAGTGGCACAGCTTCCAGCACCGCTG
TAATAGGCAAGCCACCAGAGACAAATGGGAACCGATTCTAGTGCTCACTATTTCTATCAT
TCTGAGAGTGTTTTATGGTTTCATTGAGGCTATACTTGGAGTATTAATTTAGTATTGATC
AATTCATATTAAATAACATTCATATATTTAAGTCTGCATATTCTTCTGGGGAAGGGGAGG
ACATTAGTTGGACTTGGACATTCTAGGTCCATGAAACTGAAATTTCCATACTCTTCTTCC
ATTTTAGGATTTCCTTTATCAATGACCAAATCATTTGCCATGCTGTGCCTCTCTCTAGCC
TCAAATCCTGAGTCTTTTCTCAACAGATTTTTTTTCTGAAAAATCTCCCACCTGGTTGGT
GACAAAGTAAATAAATCTGACAGGGAAGCTGTCGACCTCTTCAGAAAGTCCCAGCTTTTT
CACCTGTTTATCTACTTCTTGTGCTACTGCGTGTCCAAGCTGCCACCTGACACATGCCTA
TAACACATGGGTGAAAATAGAAGAATGCTAGCGCTGAGAAGTAGAGATGAAGAGATAGCT
GTCCACAGATAACCCTGAGCAGCGACCTTTCCAAAAGGCAGAAACTGTTCCTCTCACAAG
TTAATTCAGAGAGATGCAGCCTGCCTTCTTTCCTCCGCGATCTTCCTTAATAAACACTCC
TCTGTGTTGCCTTTGAGAGTCAGAGAAGGGGTCACACCCACAAAACACATGCCCGTCCAT
GCTTGCTTGAGCATCACCAGTATTTGATTAGTATTCTTTGAGCACAACTCTTAGTCTTCA
CCAAGAATAACGTTGCCATTAGTGCATGCTTAACCTCTGTCTTTCATTCTGGTGTGCACA
GGATCACGATGGGTTGGAAATGATGTGATGATACCTCACAAGAGCACTTTCTTGATGACT
GACTATTGGTTGCTGAATCAATGGGGAGTAGCAGCAGGGAGATTTGTGGTGGGAAGCCCA
GGGTCCTGGCATTCAAAATGCAAACATTGGTATAGCCAACTGAGAATTACAACTAATCTT
GAGGGAGGCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Chart Advanced