SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00000898_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase (TR)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Promoter IDSPR00000898
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000833_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00000898_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase (TR) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) Full length # Reverse
CCTGTATTTACAGAGATCAAAAACAAACTATCATTAGGAATGAGAGAGAGAGAGCACAGT
TCCTACAGGCATTAAAGGGATACTGACAAAGGAACACAAATCATGTATTCTAAGTAATTT
AATATTTAAAATGAAATAGATGAATTTGTGAAAGACACAACTTACCATTGTACACAGACG
CAAAATCTATGTAACTCCACATCCATTAAAGAAACTCTAATTACAATTTGCAGTCCCTGG
GAGCACAAACCGTTAACTCATTTGGCCAACTTAGCTGAAAGTTGGTTCAGTGTGGAGTCT
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GTTGACTTGACAGCAATTTCTTTTACTCACAATTTGCAAATGTCTCATGAATTACATTCC
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CTCTGTTACGCATTGTATCTATCCATCCATCTCTTTGAAGGCCTTCCTCTTTTCGCTGCC
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CCAAGACAGATCTGTTTGTTCCTTTGGCAGCCCCATGATACTTTCCAATAGTCTTCACCA
GCACCACAACTCAAACGCTTCGGTCCCTCCTTCGGTCTTCCTAGTCAACGTCCAACATGT
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GTCGTGTGCACTCTTGTCTGTAGCTACCATGAGCATTGATTGCAGATCCAAGCAAGATGA
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GGACACACAGAAAGCACGTCTACTGGAGAGGAAGGCGCAAACCTTTCCCGATATAACTCT
GCAGTGATTATAAGAAGCTACCAGAACTAGTAAGTGCATTTAACAAAGCTGCACTGGAAA
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GTTAATTTTGTTCTTTTCTTCTTTTTCCACATGTGCATGTATTGCTCTAAACTGCCCCCA
TGCACCGTTTATGATTGTCCCAAGAGTCCCCCAAAGGTTTCTGCCAGTCTAGAGGGTGAC
TAGGGGCCCAGTGGCCACTTGATAATCCAAGTTCTGTTTGCCAGAAGAGGCAGAAAACAC
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AAATGGCAGACAAAGAGTGCTTAGCAAGATCAATGAACACTAAATCAATACACAAAAACA
AACAGGTTTTCTATACACCAGTATCAACTAAAGATTATGATACCTTTTTAAAAAACCACT
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TACAGAGACATTTATTAAACTTTCTTGACAATCATTGAGACTATCTAAATCAGCGGTTCT
CAACCTGTGGGTCACGACCCCTTTGGGGGTTGAACAACCCTTTCACAGGGGTCGCCCGAT
TTATAACAGTAGCAAAATTACAGTGATGAAATAAAAACAAAAATAATTTACGGTTGGGGG
GTCACCACAACCTGAGAAACTGTATTAAAGGGTCACAACATTAGGAAGGCTGAGAACCAC
TGCTCTAAATGAATGTTAAAAGATGTTAAGAACATGTTAAAAGATCTAATCAAAATCTCA
ACAGGATTGTTTTTTTTTAGTTTTAGTTTTACCTTAGCTTTGTTGATTCTCTTTTAATTA
TGCTTATTTTTAAATAATTGACAGTTATATATATGAAAGAGTATATAAAATGTAAGCTTG
TGTGTAAGTCAAAAATTACATTTTATCAAATAATTGTTGTCATTCAAATACTAGTAATTA
AAACACTGTTCCTATCCAAAATAGGCCATGAATTATTTGTTTTGTCAGAGATATTTTATA
TTTTTTTCAAAATTAAAAAAACCTTTATTGGTGTTTTGATTATATAAAATAGTCACTGTT
TAGCTGTCCTTACAAAGGGGGCTTCAAAAAGTTTGTGAAAAATTCCATTATCCATTAATT
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Chart Advanced