SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001038_2.0
Identity
PromoterGlutathione peroxidase 3 (GPx3)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001038
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000973_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001038_2.0 # Promoter # Glutathione peroxidase 3 (GPx3) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
ACCTGCTGGTTACAAATAATTGTGTTCATCTTATCAGGTCAATGACAACAAAGTCGTGTG
TTATCTGGTTTGGTTGAATCACCAAACATCTTATTTCAACAGGTCAAAAACATCTATCAC
GATCTAATTTCCTTCAGTGTTTGGTTTTCCTACATTGTATTATGTAAGGCAAAATGTATT
GATAACAAACAGAAGTAACAAAGTTAATTGGCTTGACATGTAGGACACTAAAGTTAGTAC
ATTTAGAATTTGTGCTTAGTCTTTACGGTTAGAAACACCAAATTGTGTCTGCATCTAGAG
AAGTGATGCTCTTGGTCCAGTGTTTTACAACCTTTGTCTTTAGGTATTACACCTGATTGT
CAACAAGACCTTTCGCCGACCACCTCGTATGCAAAGAAAAAAAGGATAACTATAACACAG
TGTGGCCGAGCAGAGTGCCAGCCCCTTTTACAAGACCGTGGCCTGAGCAGTGAAAAGAGA
ACCCTCAGTAACGCTGTTGAGTTTATCTAGCCTACACAAATAATGACGAAACATCAAAAG
AAAACATTACAATATTAAAGATATGAAGGAATCCACATAGCGACACTATTTTAGAAAAAA
AATGGTAGGCTATTTACTGAACATTTCACTACCTACCTAACTTTTTTATGTATTTATTTT
CAATGATCTATTATTTTATATTGTTGTCAATGTCTATTTCAAGAATAAAAAACACTGTTC
TAGTCGATGTCCTGAGGCAAGGTCCTTAAACGTTTCTGCTTTGATATTAACTTAACAATT
AATATGAATGACCAACAACGCATTATTTGACGTTAGCACTTAACAAGGTAGGCTACTATA
ATTAATTGATTGTCCTATGCTAAATAGGCCTATGTGCTTTGATTTTACCTTCAGGGTGAA
AAGATAAGTCAGAACTACCCCATACTCTTTGATACACGGATATTCTTAAATCCATTATAG
GTCATGCTTGACCGCAGTAGGCTATATGTAGCCTAGTCTAAACCAATTTTATGATCAGAA
AAAAAGTGATCCATGACCAATAACAATATGAAGATATTTTTACGCGGGAGTGTGTTCCCG
CGGATGTAGGCCACGTACCTGGGTCCATGGAAACACTGTGCCCATGCTGGGTCGGAGAAC
ACCCAGCAGAACCAAAGGTAAAATCCGTATCCTCTCCATCCCCGGCGTCTCGAACGTCTG
AACCCTCTGTAGGCTTACCTAAATTACCGACTCGGTCGCTGCCTGCGGCCAAGTCTGTTT
TTTGTAATTTCGCAGGTTGGGGTTAATTTTATACCTACATGCTGCACTGAACAAACTGAC
GCGCACCCGTCTGAACCAATAGGGATTAGTGATCGTGGGCTCATCTTGGAGTTTCCCTTG
ACTCTTGGCCCTTGGCCTCCCTTCCCCCTGTCATCGCATCATCACACAAGCTATATGTGT
GCATTTCAGTAGAATATATAGACATAGCCTAGATAGACAACGGCCCGGGGTGCAAAACCA
ATCAGCAGACAAACAATCCTAACAGTAAACAGACACACATAGTAAACAGGGTTTCTGAAT
GTTTCCACAAGTTTAATTATAGACTTTTTAAGAACATTTTGAATGGAAATTTAAGAACCG
TGAAGGATATGAAGGAAAATTTAAGACAGAATTAGTTGCAAAGTAATTAAATGTATTCAC
ATTCAACAGTAAATGACTAAAGGAACTGTGTGTATGTAAAAGAGTTGCAATAGTATAATA
TGTGATGCTTCGTTCAACCAAAACGTATGGATCCCACTAAAGACATTGTAGACGACCTAA
CATGACATAACAACAATTTCTGCAGTTAGTGATTAATCTAACTCTTATAGTCGGCCACTG
TAGGTTCTAGACTGTGAGAGAAAGTCTAAGACGTTTGGAAAACAGGTAACCAGATGTCCT
AAACCAGCCAGCCAAAAGGTTGCCCACAATAGTAATGTGGGTTATTAGCTTATTGTTCTT
ACTCGACCCAGGTGTAAGATCTGTTTTCTTTGATTATACGTGGCTATTTTACTCAAGACT
GAAGTAAACTACCTCACGCCAGTGATGGTTGGCAGACAATTTAATCTCCTAAGCACATGT
GGTTTGTTGTCTGTTTTATATATATGTGTATAATTAAAAAGTTGACGAGCGTAGGCCTAT
TCCAATCACAGAGTTCCTCACTGCTTTATATCTGATATAACTTTAGACGAACATGCATTC
CCATAAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
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