SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001045_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001045
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000980_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001045_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
TCGATGGAGAAGGTCTGTCTGCGGACTGAAGATAAACGTTACGCCCCCCTCTACACGTTA
CGCCCCGTTCTACACGTTACGCACCCTTATTTCTTATGGTTCGTTTCTGACAATGACCTA
TTCTGATGGTGTGTCCCGGATTCTTCGGGAGCCAACTTACCGAGTTGCACCTTTGACGTA
ATTTCCGGTCTCGGAGCATTTTTAGCGTTCCAGTGCAACTTTGTTATTGTGTCATGAAAT
TTCTCCTTTATAAAGAAGATAAATATCCATTAATAGCACAATCACACAGCTAAGTTACTG
GCTTTTGCAGTGTTTACCTACCTGTGGGCTTTAACAATAAATATACTGCACTTAATGAAT
AAATGTTCAATTAGTCCATGTCAATATTGGCAATATTTAAACCATATAACAAGTATGCTC
TTCCTGGTATGTTGTCAAAATTCTGCAGAAAAGCTCAGAAGGTGTAAAACCGAGAATAAC
AGATCCAAGAGAACCCTTTAGCTTCAAATTAGAGGAACAGGACTGCCAAATAACTGTAGT
TCAAACAGTTTGAGTTAAAACATTAACTTGAACCAATAATTTCCTCTCTGTCCAAATCCC
CTGTAGCCTTTACAGTCTGTGTAAAGACACACAATCTAATGGGAGATCCGATACAGGGTA
GGTCGTCCTAAAATCTCCCCACACCTTATGACAAAACAACAGAACGGTTTATGTGTAAAA
CATACATTCAGGTTATTATTATTATTTATGGGAAATTTTCTTGCAGCACTTCTACCTTGA
AGCCACACACACACACACATTTATTTAATTATAACCGTCAATTAAATTCATGGTGTAATG
CGATTACCATTTGATATAGATGGTAATTAATGTGTGAAGAATCATAGCATGAAGGTACAA
CTTTGAGGCCTCTGTATTTAAATAATTCCTGGGGCCTCATTTATGAACCGTGCGTAGAAA
AGGCTCTCATTCTTTCTTACAAATTAAATTTAGGATGTGCTTAAGTAAAGAAAAATCTGT
ATTTATCAAATGCTCGCAAGGCAATCGTACTCACAACAGCAAGTCAACTATCTTGATAAA
TCCCACCTGTTCCATGTACCATGCTGGTGCGAGCTCAGCCTATTGCATTCAGAAACGCTT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTGATGCAATGCCCAATTAA
AACAAATAATTACTGTGACATAATTCAATGATCACAGTGTAAAGATTTAGAGTTAATCAC
AGAATATTGGCATAAATAAATAAGCTTATGACACACATTTTCGTTCAACTTCTTTTGATT
GTGTCTCAAACAGCTTGTGTGTCTTTTAACCGGCGCTGGCTCTTTATATTTGGGAAACAC
ATTTATCAAAAACGGCTGAATCCGAATACTCATACTTGACTACTATATAGTATGCATTTT
GCAGTACGCCAAAAAATATAGCGCGTCGGAATCCTTTATTATGTCCATGGTGCTACCGCC
AAAGTAAACCACGGAGTTCACTACGCTATCCCACAATGCAACCGGAGTCTGGAACGAACG
ATGAAGAGATGGCTGACCCGACACCAACAGAAAGACGTCGTAGAAAGCGGCTCAAACCAA
TGTTGCAGGCATTGAGAAATGAGCTGGAGTAAATTATCAAGATCTTTATTGTTCCTGATA
AGTAGTTCTTAGAAATTCAAAAAATCACAACCTTTCGGTCAAGGTTCAGAGGGACTGAAG
CGTTGTGATATTTTTTCTAATTAGTGATACTTAGCAAGTGTGCAGGAAGTTTTATTGTCT
GCTCGAGTCCCGCTGGCTGTACTGTTGTTGAGCCGTGTTTACATGTTTCGATGGACGGGA
CGGCCTTGAGTAGCCTATAAAGCTGTTTTGTCTAACATTCTTCCTTTCAAGGGACTATGT
GTTTAGTTTAGTGTGTTTCTTGTGTTATATTGCCATAAAGAGATGGCATGTTTAAAAATA
ATAATAATTAGTAAAGCTGTTTAAATGAATACTTGAAATGACCATGGAAATGTTATGAAT
GTTCAGCATTCAGCTTAGTAAATAATGTGGCGACTCCTACCCCCGGGGAGTCTGGGTATT
CATAATGTTTGGGGAAAAGGGGTTTTATTGTCTTTGTATAACTTGTTGTGTTATTAGGTT
AAGTGGGGTTAACGGGTTTGGGTTCTTTATTGTTTGTGTGTTAATTGTGATGTGTAGTGT
GATCGGGACCATTAGTGAGAGTGTTGTGTGTGTTGGTCAGTAGTGCCGTGTTTTCTGTTT
TGTGTTTGTGTTTGAATATAGGCAGCTCTCGTCGTGCGGTGCACTAAGGCACGAGAGTTG
CGCCGCCATTTAAACCTGGGCTCCCGTCTCGTCCTTCCCGCGCTGCTCGCCACAGTAAAT
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Chart Advanced