SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001049_2.0
Identity
PromoterSelenophosphate synthetase 2 (SPS2)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Promoter IDSPR00001049
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00000984_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001049_2.0 # Promoter # Selenophosphate synthetase 2 (SPS2) # Cod (Gadus morhua) Full length # Reverse
TGTGTGAGCCGTAATCTGTGGTCACTGAAGCCTCTGCTCAGCCCTGATTTGCAAAATATG
AATGGCGCGACCACTACTGTCGCTTGACTCCGCCGCCAGCCCCACAGGAAGGATCTTTGG
ACGGTGACGTCATTGCTCCAAACCGTAAGGTGTACCCTACTACGAAAAATATATTTAAAT
CAAACAGAAACCTTAAACATGCTGTTACTCAGTTGAACACGTTATTAAGCCATACAATAA
GTATTTTAAACGTTATATGATTCAATATTCGACTTCAAACGGAACAAGTATAATGGATTG
AGCGATTCACACCCCCATAACCAGGAGTGGAATGGTATATTCCGTAGTAGAGCGCTCTCT
ATCGCCCCGGTCGGATCTGAACGGTATTCGCTTGCTCACCATGACTCGGCTTGAGGTCCG
AGGCAGCGGTCTAAAGTCTATTCGACTTCGGACTCCGGACTGTGTTAAAGGACGTTAGGT
GGCAGTCATGATAGAACTGTTCAAAATAAATGATCATAAGGAAAGGTGTGTGGGAAATAA
GTTATTAATTATTATGGCTTGTTTCCTGTTTTATGAAGTTTCTAGAAGGAGATTCCATTA
CGGGCATTTCTACACGGTGCTGTTTTAATGTTTTACAGAACCTATTTTTCATCTAAGTAA
CACTATTGGCGAAAATGAAATTTAGAATTTGTGTCAATTCAGTTAAAATGAATAGTGTGG
ACAATAAACAAAAGAGTAGATGGCTGAACCTTCTGGGGCGCTACCCATGCCTGGATTGGT
TTGGTTCAAGAATACATGTCGCTCCCTCTCCTCCCTGACCTTTGACTCCTGTCCATCAAA
GCCCCAAAAAGGCCATCAAATATGAAAAATAAATCCCCTACTGCAATTATCCTCTTGAAT
ATTATTTATTTGACAGTCTCCAATTATACATTGTTGATGTTCTTTTCATGATAATAATCT
ATAATTACTGACACTATTCACACAATAAAGGATGAAACCATAAGGTGTAAGTTATCAACT
TTTCTTTCAAAATTATTGGAGTGAACAGCCCATAGAATGTTACCAACCATCATGTTGTAT
GGCCCAGTGCAGCACTCAAACTTCAAACTCATAGAAATATATTAAACCAAATCTGCTCTT
AACTTTGGCACTTTTTTTTAATCATGATATCCAGATAAATTCAATCATTATGAGCCTATC
AATTATATTGTTGTTATGTTTTTAAGTCAGAATTAGCTATTTTCTAAATAATAGGAAAAG
CCTCAGACTCATTATAGAACAAGGAATCTATTTGGGTAAAATAAATAAAAAACGAATAAC
TATAATCATTTATGGGTGAACATTCTCAAAGATAAAACTATGTAACAGCTATACAAAACA
AGGACAGGCACAGTTAAATCTTTGTTGGATCGAGGGTATAATTAAGGATTAAAAATAAAA
TAAATCTGGTACACAGGCACAGAACACTGAATGGATACTTTGATTAGCATTTAGAGAGTA
TACCAAACTCTAATCCATAATACATCAGACGCATTGAGAGGGGCCAAATGAACAACGACA
CATGAAGCCTCATCTGTCCTCCTAATAAACAAACACTATATTATTCACATTGTATTACTG
TGTACGAGATGGTTCCAGTGTTGTCTGGAGACCTTTAAAAAGAGCCTTGCACGTGGCCTT
CAGCCTCATCCGAGGTGGATGATTGGGTTCCACCTCTGTGCTCTGCCCTCTGGTATTAAA
ACACATCATTACACCTGCGCTGCTACAGCAGGAGGACAGTGTGAACCCGGGGGGGGGGGG
GACGATAGAAAGTCAATCTACATCAGGGTTTGAATACGCATATCAGACTTGAACAGCGAT
GATATTACGCTCATCACTGGCTACGGTTCTTCTGCTGCTCTCCGACCACTTCACACCAGC
CTTCCTTTGATCCTGACGGGGCTTTGTTCCCGTTATTCGCCTTAGACCAAAGCACTGTGT
CCATTGGGAGGGGGTTGGGTGGACCTCTTCCTTGCGTGTAAGCCAGAAGGGGTTACTGTA
TGCAGTCCATGACGTGTATTTGCAGCGTGTCCATGTCCGGGGCCTGGTACTGGCACTTAG
GACAGCGATAGTCTGGCAGCTCCTCGGCGCCAGGGCCGGCTCCGGGGCCCGCACCCACTT
GTGGGAGGCCCTGGCTGCGGAACGACTGGGGCGGTGGAGCGGTGTTGAAGGCTGAGCGGG
GGGAGCACCAGGCAGCAGGGAGAGGCAGAGCCACACGAAGAGAGGAGAGAGGGAGACAGA
GGGAAGACCGCTGTGGGTTAGCTTCAGCATGTCTAGATCAATACAGCAAGTGGTTTAAGA
TGAGGTCATCAAGAAAAGAACAATCCTCTTTTGAGCTTGGGGACATAAGCAAAGTTCAGA
GACTGACATTTCTTAATCCAAAGTGACATTATCATTTTTGAATTCATCTGAGTAAGTTAT
CATTAACTATTTGGATAATATGTCCAAGCAGGAAAAGACAATGAACCTCAAAAATGGAAC
AGGCAACTATTGAATACTGAAGCCCTGATAGAGTGTGCTGCACCTTGTGGTGCTAGGTTT
GTGGGCCGCTGGGCTCTGAAGTCGTCCAGGTGTCTCTGCTGCATCTCTTCAATGCGAGCG
CTGAAAGAAGAGAGGACCACTCGTTACGGTCACGATAGCCTTCACTCACGATGGGTCGAG
CCTTACACTTCAGCATCAACCAAAGCTATTGCACATGAGGGAAAAGTAGCACCGGGGAGA
CAGAAGCTCTGGAGGTAGAGCGGGGTTGACTGGTAACCAGAAGGTTGCTGGTTTGATCCC
CGGCTCCTCCTAGTGGAGTGTCGAGCTGTCGCTGAGCAAGACGCCTCACCCTGGCTGCTC
CTGACGAGCTGGCTGTCGCCCTGCGTGGTTGACTCTGCCGTCGGTGTGTGAATGGTTGTA
TGTCGCTTTGGATAAAATCATCAGCTCCCTAATGAGCCGTTGGTCCTAAACCGAGTAATG
CTGTCCTACCGCGAGGCTCCCTCCTGTTTGAGTCGGTCGATCTCGGCCATCGCCTGGGTC
AGCTGATCCTGTAGCTCCTCCTTCCTCTGGTTCAGCTTCTCCCGGGCCTCGCGCTCCGCC
AGGAAGTCGGCCTTGTAGATCTCTGCCTGGACGCGCACACAGAGGAGCGCACAAACACAG
GAGGAAGGCCGAGGATGAGAGGTGGGATGCAACAGAGGCATCAACAAACGCAGTCAGAAG
GATTTTTGGAGCCCATGCCTTGTTCTGCTATTTAGATGTTGGCAGAAGGGGTTGTTGTCT
GGGAGGGAGGGGAGGGTGTAGGACACTTAAATGTGAAAGGCAGGGGGAGGGGTTATTGTC
GTTATATATTTATTAATATCTCGTACTGTATTCTATTTATTCTTTATTTATTTATTTTAA
AAAAGCACTGAACAAGATCTGCACCTTAATTTCGTTGTGTAAACACTGTATTTAACCCAA
TGACAAATAAAGATTCTATTTCTATCTATTTCTATTTTTTTCTATTTCCTGTGGGGCAAT
AACGTGACAACATCTTGATTGGAGCATTTAATAATTTATTACACACGAGAAAAAATTTAG
GCTCAGTAAACAGGTTTATTTTTAACACAAAAGGGCAATACCAAAAAGGTATCTTGTGGT
CTCCTATCATGTTAGATAATTATGCTACAAACTATGGCGCAGCTGTAGGGATAGTTTGCT
GGTTCACAAGCACAGCGACGATCAGTTTTTAGGAGAAAGGCATTTAGCGAATGATCCAGC
AATTCAAATTGGACAATCTTGTCCTAGAATGACCGAGCTCATGAAGTAGACCTAAGCTTG
TAGTCTGCAGCTTGCCTCAATCTACCTTTGTACCAGAGTTAGTTTGCAATTTGAGAAGGT
GTCTTTGCCTATTACATAATGTATGACCATCAACACTACAGGGTGACTTATTCACTCAAA
TGACTGCACTTAAAGGACCATGGAATCTGGTGGTGAACCCATCGCAGCCGTCAACCCTGG
CTTCACGAAAATATCCATTTCATGGAGTTGATTTGCGACTCAAAGCGCTTCTGAAGAGGT
GTGTAGGTACATTAGGCTGGAGGTGGATTCAGCATTGCATATAGGACATTCAGGACTGGT
GACAGCTATAACTCGAAGCTGCCATAGTGTAGCCTTAGTTATGGGCCTCGTGTGGCCAAA
GGCACTTGGGTAGATGTACTTTTCTTTAATTTTCACGGAAAGTCAGGGAATCCCCTCCTT
AGTTCCTGTTTGCGTGACCTGAAAGAAGCATTAGGTCCGTCTGCCAGGCGCTGCATGTTG
AACGTTCCCAGTAAGTGAGTCCATTGGGGGGGTTGTTCCGTGTGCTACCTGCCCTTTAAG
TTTCTTCCATGGGGAGTGGGGCTCTGGACGCGGGGGTTGCCCTGTACATCTCCCTCACAT
TGATCACTTTGCTCCAGAGACACTTAGCGCTAAGGTAAGCGGTGGATGCCTCATGTTTTG
AATTACTCTTGCTAGCCAGGGTCTGTTTCTTTTCATCTCTAGTAGTAGGTTTGTTTTGTT
AAGTTGCTTTCCTTGGATTCACCATCGATCCCCTTACCCTTCCCTTTGTGTTTCCCCTTA
ATAAATGCATTACCTATCCGGTGTGTCTCTTCAATGCTTTCCCCCACTGGTTGGTATGTT
AGTTACTAATCAGACCACTTAAAGGAACGCAACAGGAGGTATACTCTGCTTCACACCCTG
GGACTCAAATTGGGGATAAAAACATAAAGCGCTTTATTGCCAGTTGATGCCTGACAATGT
TGATATTTTTATTTCTGAAAAATAACTTGATGATGGTAGAGAAGCAGCAATGAGCCAAGG
ATCTATCTGACAGGGGCTGTAATCACGCTACAGCACTACCTTCATTGTGAACTTTATGGT
GTAATTGTGGCAAAAGTGGAATTTGTATTAATGTTTATTGTACAAGAGAACTAGATTTGA
TCCTTCTTCATTTGAACTTT
Chart Advanced