SelenoDB: selenoproteins database

SelenoDB
Release 2.0
Chart
Advanced
Promoter Report for SPR00001070_2.0
Promoter
Selenoprotein S (SelS)
Species
Gadus morhua (Cod)
Promoter ID
SPR00001070
Promoter release
2.0
External ID
None
Transcript
SPT00001005_2.0
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A)
[Report annotation error]
Orientation
Forward
Structure
Feature	Col Promoter	Col Coding exon	Col Non coding exon (UTR)	Col Intron	Col SECIS
Residue	Col Sec	Col Cys or Other
Toolbox
Sequence
>SPR00001070_2.0 # Promoter # Selenoprotein S (SelS) # Cod (Gadus morhua) Full length # Forward
GGCTACGATTATATTTGCAATAATTATGCATGTCATAGGTCATTGCTAGTGAGTTCTACA
AAAATCAACTCTTAGGTTTGAGTCGAAAGCCATGCCCTTGTTATATCCTTGGAGGAAATT
AGACAAAATCTGGAAGATTGGTCAAATATGACATTTAAACTGCTTTTACATTTAAATTCA
CTAGTTAATAGTCAACCACACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACA
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TTGTGGGACTTGGCTGCTACATTATTACTCATTGTGGGGGTTATTTCAGTCTCTCCAACC
TGCAGGTCGTGCGAAGAATCATGTGAATGGGAATATTCTATAAATGTCTTGATCATCTTT
CGTCTCAACAATTCTGCTGCAGCCGCTGTTGAAGCGTATGAGTCCTTTGAGACCCCCTTT
GTCAAAGTCGGACTATCGTGCTCTGGAACACGCTTCAATAGATTAACGTTCGTGCGCAGG
AGCACGCAATCACGTGATACCGGGTTGCAATAGTTGTGTGATTAAAATCAACATAAATGG
GCATTTCTTGAGTGCTGCAAATAGTTTTGGTGTTTTTGCACCAGCTAGTGGCAAACAAAC
CGTAAGACACTTGAAGAGCCTCTATCGCCTTACAAAACAAATAACTGTCCTAAATGGAAT
CAAGTATGCATCGTTAGAATAATATACATATACCGCTTTTATTTATTAAGTCATTAGATA
AGCTTATCATGAATTCACAACATAGATTTATGTGATGAACATTATCTGTTCATATAATAT
TTTTTAAAGCGCACTTTTAAAATATGCGCGACAGAAACGCAACACCTCCACGTCACGTCT
GCTACGTCAGCCCATGCGTCAGCCACGTCGAGTCAAACATGGCCTCCGCCGACCGAAAGA
TGCGGAGGTAAATAGACAGCACCGATCCCTTTCCTTCTTTCCGTAAGAGAAAACAAGCAC
ATCACTATTCATCCATCATCAATTTCAAAATGGGAACACAAATGGACGACGTGCAGATCA
TCGATGTGAACGAGGACGGC
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