SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001139_2.0
Identity
PromoterGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Promoter IDSPR00001139
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001074_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001139_2.0 # Promoter # Glutathione peroxidase (GPx) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) Full length # Reverse
TTCTCGCCATGCTTGATAGCTGCTCCTTTTGTTGAGTCACAATGATCGCTTTATTTCGGT
GCCACTATACTTTCTTGAGCAAGCCTTCAAATAGAGTCAAAGATCTTGTGTTTAGCTCGC
AAGATGGTTCCCCACCATCAGCCTAAAGGTCGGGTCACGAACTTCCCCCCACACATTGTC
ACGTCTGAATCAGCTTTATTCCCCATGTGTGCTTATGCATACATGTAATTAACATGTGTT
CTCTATTACAAAACACAGTACATACAAAAACAAGGAATATACAAAATATATTGTTATTGA
ATATAGAAATTCAAGATGAAAAAACAATAGAATGAGGAATTGACTGCGCTGTAGGAAACC
CAAGTCAAGCGATGAAGGAGGCAGTTTGCAGTGAAAGCTCTTGATGTAGAGCACACTCTT
TGATAACGTTGCGCAGGTACCGCGCTTTGGAGTTTTGCGTGTTTCTTCAGACGGCGCATC
CGATCTCATTGGATGTGAGAAATACCCCAAATACGTTAAGTAGTCACGGGTCACTTAAAT
CCTTTAAGTAGTCACGGGTCATTATCTCGACAGATTTCTCACCCGCCCATCAACGGACAA
CAGGACTATCTAAAACATGCAGCCTAATGCTCAAACATTAGAGACCGTACACAATATGTT
GTGCCCTTAGTAGTATTGAACAACGGACCACTTTTAAAAGCACAACATATACTCCAGTCA
ACAGACTAAGTTATAAAGAAGGTAACGTTATGTTCGCAATATATAGTCACTTTTTTAGAC
AATATAAGTGAAGGCGCATGATATACAGCACACTCGTTGACAGCGTTGCGCAGGTACCGC
GCTTTGGGGTTTCGCATGTTTCTTTAGACGGCGCATCCCGATAAAAGTAGTCACGGGTCA
TTATCTCGACAGATTTCTCACTCCGCCCATCAACGGACAACAGGACTATGTAAAACATGC
AGCCTACTGCTCAAACATTAGAGACCGTACACAATATGTTGTGGCCCTAGTAGCATTGAA
CAACGGACCACTTTTTCAAAGCACAACATATACTTCAGTCAACAGACTAAGTTATAAAGT
AACTAAAGTTACTTTCGCAATAAATAGTCGTTTTTTTAGACAGTATAATATCTTCATAGC
CGTTGCCCTCTTTTCGCAAACTCCATGAAAATGGTCATGGAGGTTAGATGATCCCTAACT
GGTTTGTGACGCACACAACGCATTTGGCGCGGAAGTTTGTTTTGTAACGTGTGTGTCTTT
GGCTGTACGTGTATAATCTTCGCCTGGGTTATCCTATTTCTACCAAACGTACGTCTCGCG
GCACGCAACATAACTTAACTAGCGTTAGTTGTGTTTTACTGCATTAGCTATTAGCGTAGC
CACATCATAATGGTTGCTATGTAACGTCAACTGTCACGTCTCCCCAAGTGACGCTCACTT
CTTATAACGACACCGTAGCTTGTTGTTAACTGTTGATGCTAGCCTGGTGTAACGTTGACG
TTAGCTGTTGAAAACCTGTTGTCCTTCATGTTTCATTAGATGATGCGTAAAAAGCGGCGC
AATTCTGCGGGTAAAGGAGATGGAGCCACATCGACCAGTAGTAAGTGTTGTATAACATCT
CAACAGTGTAAGACCGACCTATGTGTTCCCCAGTGAAGGCAGTAAAGATATCTAAATTCA
CTCTTGCCTTTCCTTATTTACAATGCATCCTACTCCCTTTACATACAAGGTTTATTTTGC
TCTCTCCATAGAGGCAAAGAAGAGTCGCACCACTGCTCCCAAGCCAAAGGAGCCAGCTCC
AGAGGAAACCAATGAAAGTGTATTTGGTGTCTTTCTTCGGGAGGCAGGTGTCACCTTGAA
ACAAGCTGGAACATCCAATGAGATCGGTAAAACACACTCATTCCAACGTCAAAAACACAC
AGAGCCACCAAATGGGATGAGTTTGACCACTTCTTGTTCTTATCTTTTCCCTCCAGCTGT
CGATCAAATCGTTTTCCAAAAAAGGTTGCTGAAACAACTTCAGAAGAGTCCCAGGTTCCC
AGGGGTAAGTAAAAAACAACAACAACGTTGCACCATCTCTACACAAGGTCGCGGTATTCA
ACGTGAGGCTGTTGTGTTTCACGGACACTTCTTTGCTCAGATTGTGCAGGAATTCACTGC
TGGGCTGGAGTCTCATATTGAGGACCCTGAGCGGTTTAGGAACTGCCTTCTTCCATGTGT
CCCACAATTGTCTGATGGAGACTCCGGGTGAGTCTCATGTGGTAATGGAGGCCACTCGGG
CAGACACACATGTGGTGTTTGACCTACTGACGTGTTTTGTTCTGTGTTGCAGTAACGTCA
GCTCTTTTCAGGAAAGTTTGCTACGCATGCTGTTGGGGATTGAGATGCTGCAGGTCAGAT
TATTTTTACCAAGAATCACCCCTTCACGAAGGATCTCACGCAGAAAAAACTAAAGTTGAA
ATTTTTCTCCCTGTCAGGCATTTACAGTAAATGTGAATTGCGCATGTGCACATAATCTAC
TTTTCATTTTCATGCAGACCGTGATCATCAACACTTTGCTCGAGAAGCTCCCTGAATTTA
TGTTTGACGGGTCCGTATTTTGTTTCTTAGAGCATTTGAACCATTTCACAGTCTCGGTTT
TGCCGCTGTGTTATTTAGCTAAATGTGACCTTGTTCTGTCCCTCACAGTGCTGGAGATGG
AGGACTCAACATTCCTCACACAATTATCAACCAGTTTAAATGGCTGGACCGAGTTGTGGA
CAGCAAGGTAGTCATTTATTTGATGATAGGTTGCATATGAGAGGCGGTCACAGCCATTAA
AATGTTAATACCCGTGCTTTTATCCAGCAGACCTGCAATCATGCGTTTCTTCTTCACACC
AGTAATCAGTATCAGTCTAGAAGGGCATGTCTTCATTTCAGCCCTTTTTGTGGCCTGTTA
TTTGCAGCAGTTGGCAGCGAAGCTCATGGAGCTGGTGTCAGTAGCACCAGTGGAGGTTCA
GCGTGACATCATCAGCAGTTTGCCAGAGATACTGGAAGACTCCCAGCACAATGACATCGC
TAAAGAGCTCAAGTATGTGCAGTACATCTCCACCACAGGTCGGCGCCTCTTGGGCCGTAT
GTGTCGTTTCAGTCATTAATCCTACTGGCTGTCCTGTTCTCTGCAGCTCTTTACTCCAGG
AGAACACTCAGTTGACTGTGCCCATCCTGGATGCCCTCTCTAGTTTGAACCTTAGTTCCT
CATTACTTACTGAGGTAATAGTCGCACACAGATTCTATTACATAGATTTTTTGTGAATAT
TACAGGCCAAGGGAACGTCACTGGGTTGTGATCGGTCACTGTCTGCCCTCTCAGGTCCGT
GGAGCCGTCATGGTCACCTTGGGAGCTGTGCAACTGGAGGACCTACCTGTGGTGATCAAG
TTCATCCTACATTCTGTCTCAGCCTCTGATGCATATGAGGTCAGAGCTCAGTGACATGTC
GACATCGTTCTGCATAAGATAGAGATAGTAATTGTGATGTATTATTTTTAAATCAGGAAT
GTGCCGTGTGTTTTTCGTGGTAGGTGGTGTGTAATCTTCGTAAAAAGCTGGAGTTGGAGC
AGTGTGTTCTCCCCCTGGTGCTGCAGGCCTCTCAGAGCCTCATGAAGAGCAAAGGATCAA
CAGCGTAAGACGTCACAGATTTAAAATCCCTCGTAACCTTTTATATAATGCTTGGTCAGG
AACTCGTTTTGAAGTAGGCCAGCAGGTTCTTGATACAATTGCATTCCTGAATTTGATCTA
ATAAGTCCGGTCTTGGAGCAGGTCCGCTGCCACGCCGTCAGCTGGCAGCAGCCAAGACAG
CGTTACATTGGTACTGGACGGCATCAAGTCAGCGGTGCGATTCCAGAAAACAATATCCGA
GGCTTGGCTCAAGGTCTGAAAATGAACCATTATTTTATTTTCCCTTGCTTTAATTGATTT
CTACGTACTGATATTTTTGCTCTCTTCAATGTTAGCGCCGCTAACTGCACTTGTTTTTTA
TTAGGCGATAGAGTCCGTGGACAAAGAGGAGGACCACAAGGTGAGCACAATACGCCGCAT
TCACACTAACTGTCATCTTCAAATCCGACACATGTGAAATCAAGGACCTGTAGGAGAACT
GTTGTTTCACATCTCACATTTACGGGGATTTGAATCCGTCTGTCTGATATTTGCTGCGCC
GTGTCAGGTGTTGGATCTGCTGGTGCTGTTCATCCTCCACTCCACCAACGCCAACCAGAG
TCGACGGGGGGCAGAGAGGGTGCTGAAGGTGAAAGTGAGGAGTGGATTCATCCAGGAGGT
TCTACTCCAGAGGACCTTCAGGGACTATGCTCAGGTGGGTCGGTCTGCTGACGTAAAGTG
CATTTTATTGACAGAAGTTTTGTGTCATTCTTTGTTATTTGAGCGATGGGTTGTATTGAT
CAATGGTGACTCTCTAGGTCATGCGGGGGTATTTCCCCTCCATCCTGGCTCTGGCTCAGA
GCTTGTTGCGCTCCCCTGACCCTTGTGTGGTGCCTTTTGGGGGACACATGTACCGGCACT
CATTCACTGCGTTCGACTCGTACTGCCAACAGGTGGGTTTGAGATTCTTTTTTTTTTCTC
TTCTCTTTTATGTATTTTTGCAGCCGAGTCATTGTATTTCCACCGTGCATGTTGTGCAGG
AGGTTGTCGGCTCCCTGGTAACCCACGTGTGCAGTGGTGTGGGCGGGGAGGTGGACATGG
CCCTCGAGCTGCTCTGCGGCCTTGTGACAGAAAAACACTCCGAAATGGCCCTTTATGCAG
TTTTTGTCAAGGTATGGTGATCCACATATCTGCCCTTACTATTTGCGAAACAAACCATAA
AAACCAAAGGTTTATTATTATTGAGTTTGGTCAGTTTTTGTAACTGAGAACTCTATTGGA
TTCAGGGAATCTTAGATTACATGGACAACCTCACACCCCAGCAGATCCGTAGACTCTTCC
ACCTCCTGAGCAGCCTGGCC
Chart Advanced