SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001168_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Promoter IDSPR00001168
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001103_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001168_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) Full length # Forward
CTCTGAACTTAATAGGATTGGACTCAAACCCATGTTGTCCTTACAAATAACACAGTTCCA
CATTGTGTTCCACAACCCACATGTGTGACATTAGAATCACCAATGCTCCTTTGTCCCTCT
TAGTCCACGAGCGACACACTGCCAAAACTCTGTGGGACAAGACCGGAGCTGTGGTCATGG
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CTGAACAGCCATTAAACGCATTTTGTGTTTGCTATGCAACAAACCACTTAACTAATCATG
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TGCATTTTTATTAATTTTATGAACCGGGTCGTACATTTGTTTCTAATATCCTACAGTTGG
CTGGCAGTAATCACTGAGCCTGCTTATAAAGAAAGCTTTGTTCAGTGTTTGATGGACATA
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CCACATTGTCATTGAGTAGTTAAATCTATGACTATGACATCATCATATTTCTGAAGGTAA
TCATTGATGAAAATTCCGTTTGAGGTGGAGGTGATTGTGTAATTATGTTTTTGTAAGCCG
ATCATGCCTTGTATCAAAAGTCCAAATCAAAGTGGTGGCAGAGAAGAAGAATCTAAAATA
CTCAAGTAAAATAGCTCAAAAACCACAGCAGTGCAGGTTCCTTTCAAAGCCTCAGGCGTG
ATCCTTCTGCCCAGCACCGTGCGGGCATCTCTTTATGCATGACACACCATTATCTTTATT
CATTAGAATTTCCTGATTGTGTTAACATTACATTACATTAGTACCTGACACTACCAGTGC
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ATCTGTCTCTATTGGCTGCTGCTGTGATCATTTTTTTCATTTTTCATTGGGCTTCTCAAG
TGTCGCAACACAAATGCATTTGGGGGATTTGCTTTTTGAAACTGGATGAGCCTAATCTCT
GCAGAATAACGATTGCTTTGCCTTCTTGGAAATAGAGACAAGTTAGTATATGGCTTTAAT
TCTTACTTTTCATATACCTGCAAGTGTGGTAATTTATCAATTCTCTGCTTATTCATTTCT
CTGTGTAACTGTTGACTGTGATTTACCATATGCAGTGTTTCCACTAGATGTACTACCTTG
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CTGGGCATTTTAATCATGAAGAAAAAATCCTGCAAGTCTGTAAACTCACAATTCAGCACG
ACAAAGCTGGCTTAACTTTCAGAGAGAACACTTGTGTTTATTTCTTTCAGGGAGATCTTG
AGGGTGTTTGTAGTCAGGGGGGGTCAGTCATTTTCCACGCTCCCGATGCTCTCCAGCTGT
TCGACAGCTCTGAGGTGGCGACTGCGCCTCTCTCTGGCGGGCACGACCATGAGCAGCCAG
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TATCTCTTTGTGTGGGACAGACTACAGCCTACCTAATTTAAAAGTATGTGAGCTATTTCA
TGTCCCAGATAAGCTGTTTATGAGTCCAGTGATAAGAATCTACTTTGGATACAGCACGCT
TCCCTCAAACGCAAGACAGAATCGGCAGGCCTGGTCCTGTCGCTCTCAGTGTTGGAGGTT
TGAGGTCTCCTTCTGTAAGAAATGAGAGGAAAGGAAAATGCAACCCACCCATCCTATAGG
AAATGTAAAAAAAACTCTGCAAACACTGTATTTTTCCAAAGCTAACAATGTCTACGTCTC
ACTATGAGCATGTGTGAGATGACTGGCACATTTCCCTCCGTGCTGCAGTGCTGTCCTCTG
TGTCCGAGCTGGAGGGCGGG
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