SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001234_2.0
Identity
PromoterIodothyronine deiodinase 1 (DI1)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Promoter IDSPR00001234
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001169_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001234_2.0 # Promoter # Iodothyronine deiodinase 1 (DI1) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) Full length # Reverse
TCTCGGCACAGCCAGAATTGGCTCTGAGGCTGATGGACCCAGAGGCTGCAGCCAGATGAC
ACTGGGCGGAGCTGGACAAAGGTACAGAGTCAGAGCAGCCAACTCCAGGCAAGAGGAAGG
TGCCGTGGCAGAAGGTATTTGCTTTCCCGTCAATAAAGTGGAAAATTCCCAGCCAGGAAT
ACAAAGGTCTGTTCTCATTCTTATTGTTTCAGATTCTTTGCCTTAGTTTTTGAGAGATTC
GTGGATTTTAAATTCTCCCTTTGATTAATTTTTAAAATATATATATTTTTTATAGATGGA
GACAATGCCTTTACTTTATTTTTATGTGGTGCTGAGGATTGAACCCAGTGCCTCACAAGC
GCTCTAGTGTTGAGCTACACTTGCAGCCCCTTCCTTTGATTAATTTTTTAAAACAAATCC
TTAAAAAGATCCACACTTAAACCTTCCCCACTAAAAGATCTATTGCAAATGAATAACTTC
TAATGTTAATTATTCTTTTAACAATATAAATAGTTCTTTTACTAGTGAAAGGTGGTTTCC
CACTCTTTGCAGAGGCAAAGTCCCTTCCCAGAGGTTTTGGATCTGGACCTCCCAGGCAGT
GACATCTCTGGGGCCATCAGCAGTTAAGGGCCTGCAACTCCTCTTAGCACTGGGAGAAGA
GAGTCAGGTAAAACTCTCTGCTCTCAGGGAAGTCATAGTCTAGCGCAGGAAAGACAAGTA
AACAGAAAATTGCCATTTAGTATATTAAGTAGAGAGACAGGATGCGTAGGGACATAGGGG
TATGGAGAAGTGGCAGCTTATTCTGTATAGAGAGGTCACGAGGCTTCCATGAGGAACTGA
TGTCTATGCTGCAATCAGAAAGACAGTGAGCTGTCAGCCAGGCAAAGTGGAGGGAACTGC
ATGGTCAAGGCCTCACAGCCAGAGCAAGCATGACTCAGAGAGGCTAAGAGTTGGAGAGTG
TTTAAAAACACATCTAGAGGGCCAGGCATGGTGGTGCACATCTGTAATCCAAGCAGCCTG
GGAGGCTGAGGCAGGAGGATCGAGAGTTCAAAGCCAGCCTCAGCAAAAGAGAGATCCTAA
GCTACTCAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAAATACAAAACACGATTGGGGATGTGGCTCA
GTGGTCCAGTGCCTCTGAGTTCAATCCCTGGTCTCCCCACCCCCAGCAAAAAATGCACAT
CAAGAAAGAAAAAGTGGTCTGACTAAGCCTGTTCCTGTATTACATAATCCCTATGGTATT
CGTTCACAAAGCTTTAGCTATTCGTCTCTGGCATTTATATACCTAAATACTCTCTGTTAG
TAAGAGTGGTGCTGGGGATTGAACCCAGGGCCTTATGCATGAGAGGCAGGCACTCTACCA
ACTGAAGGATGACAGGAAAGCTAGCACCAAAAGGTGTCAGCCTTGGCTCTAGGGTCCAGT
AGGTATTAATTTTATTAATTAACTTTATTTAGGAAGTGAGGGATAAAAAGACCCTTCAAA
ATATGTTTCATTTTAGAGCTCTTCACAGCAAATACCACATATGTTGCTCAGTATTGAAGA
GTACAGCTCCTATCTCTTCAAGCTCGTACCAAGAACCCCTGCATCCCTGAGATTGCTAAG
GTTTTGGTTTTATAATGGGATTTTTATTTTTGTACTGCGTTCTTATATTCACAGCAAAAT
TGAACAGAAAATATAAGGAGTTCTCACACGTGCACAACCAACCCTGCCCCTTAGCAGCAT
CCCGCCGAGCCAGAGTGGTACTTTTGTCACAATTGATGAGCTTCCATTGTCACATCATAA
TCATCTGAAGTCCACAGGTAAAGTTAGAGTTCACTCTTGGTGGTATATAGTCTATACATC
TGGACAAATATATAATAACATGTACCCATAATTATAGTATTGTACAGAATAATTTCACTG
TCCAAAAATTCACTTGTTCTTCATCTATTCTTCCAGTAAACCCCAGTGCCCTAGCAATCA
CTATTTTTTTTTTAGTTGTTGATGAACCCTTATTTTTTATTTACCTGTTTATATGCTATG
CTGAGATTTGAACCCAGTGTGTTACACATGCTAGGCAAGCGCTCCGCCACTAAGCCTTAA
CCCCAGCCCGCCAATCACTAATTTTTTACTGCTTCCTTAGTTCTTCTCTTTCTAGGGTGT
TATCTAGTGAGAATAATATAGTATAAAGCCTTTTCAGAATGGCTTCTTTTACTTAGTAAT
TTGCTTTTGAGTTTTCTCCATATCCTTTTATGGCTTGATGGCTCACTTCTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTAGTTTAGTTTAGTCCACACATGGACACACAATGCTTTTTTATTATATTTATT
TATTTTTATGTGGTGCTGAGGATCGAATACAGGCCTCATACGTGTTAGGCAAGCGTTCTA
CCACTGAGCCACAATCCCAGCCCCCATTTCTTTCTTTTTCTTCTTCTTTCTTTCTTTTTG
TTTTTTGGGTGCTGGGGATTGAACCCAGGGCCATATGCATGAAAGGCAGGCACTCTACCA
ACTGAGCTATATCCCCAGCCCCCCTCATTTCTTTTTAATTCTGAATAATATTCCATTGTC
TGGATGTACTACAGTTTATCTGTTCATCTGTTTATCTGTTCATCTGTTCTATTGAAGACG
GTGTCTTGGTTGCTCTTAATATTTATCAATTATGAATAAAGCTTCTTATAAAAATCATGT
GCAGATTTGGGGGTGGATATAAGTTTTCAACTTATTCAGAAACACCAAGGAGTATGAATT
ATATGGTAAGAGTATGTTTATTGTTATAAGTAACTGCCTTGCTATTTTCCAGAGTGGTTG
GATTTTTTTTTTTCTTTTGATACCAGGACTTGAATCCAGGGGTGCTTTACCACTGAGCCA
CTTTTTAATATTTTATATAGAGACAGAGTCTCACTGAGTTGTCTGGGGCCTCGATAAATT
GCTGAGGCTGGCTTTGAACTTGCAATCCTCCTGCCTCAGCTTCCTGCACTGCTGGGATTA
CAGGCATGTGCCACAACACCTGGCTAGAGTGGCTGGATTCTTATGTATTCCTCCAACAAT
GAATTAGAGGGGCTGGGGATGTGGCTCAATTGGTAGCGTGCTCGCCTAGCATGTGTGCAG
CTGGGTTCAGTCCTCAGCACTACATACAAACAAAAGATGTTGTGTCCGCCGAAAACTAAA
ACAATAAATATTAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAAAAAAAACAACAACAATGAATTA
GAGTTTTTTTTTTTTAAAAAAATATATATATTTAGTTATAGATGGACACAGTATCTTTAT
CTTATTTATTTATTTTTATGTGGTGCTGAGGATCAAACCCAGTGCCTCACGCGTGGGAGG
CAAGTGCTCCACCACTGAGCCACAACCCCAGCCCCTGAATTAAGAGTTTCTATAGTTGCA
CAGCTTTGCCAATATTTATAATTAATTTTAACCTGTAATTCATCGATGACATTGAGTATC
GTATGCGTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTCTG
TCTGTGTTTTGCTGAGGATCAAATCCAGGGCCTCCTGGATGCTAGCCAAGTTCTCCATCA
CTGAGCTACATCTACATCCCTTTTTCAATTTTTATTTTGAGACAGGGTCTCATTAAGTTG
CCCAACCTGGTCTCAAACATGCAATCCTCCTGCCTCAGGCTTCCAAGTAGCTGAGATTAC
AGGTATGCACACCATGCCTGGGTAAGCATCTTTTTATATCTAGATACTTCTTGACTTATA
ATGGGGTTATATCCTGATAAACCTAGTGTAAGCTGAAAATATCATTAAGTTAAAAATGCA
TTTAAAAGAAAAGTAAAAGTAAAAAAGTGAAAACCACAAGTGGAACCATTGTAAGTCCAG
GATTATCTGTCCTTGTTTACCATCTGCATGCCTTTTGCCTATTTATTTTTAATTTGGTAC
AAGGGATTGAATCACGTAGGAGAGTTTAAACACTGACCCACATTCCCAGACCCTTTATAA
AATATATTTTATCTAGAAACAAGGTCTTGCTAAATTGCTTAGGGCTTGCTTAGTGCTGAG
ACTGGCCTCAATTTGTGATTCTCCTGCTTCAGCCTCTTGAGTTGCTGGGATTATAGGTAT
GCACCACCACGCCCAGTCTCTTTTGCCTATTTTAAAATCAAGCTGTTTTCTTATTGTTAA
GGTTTTTGTTTTGTCTTGTGGAGCTGGGGATTGAACCTAGGGCCTTCTGTGTGCAAGGTA
AGCACTCTACCAACTGAGCTGAATCCCCAGTCTTTACTGTTGAGTTTTAAGAATTCTTTT
GGATAACAGTCCTTTTCAGATATGCCTTTTGTGAATATTTTCTCCCAGTCTGTGGTTTAT
CTTCTCACTTTTTTCACAGTTTCTTTCATAGAGAAGTTTTTTTAATCTTTTTTTTTTTTT
TAGATATTTTTTAGTTGTCAATGGATCTTTATTTTATTTATTTAAATTTGGTGCTGAGAA
TCGAATCCAAAGCCTCACATGTGCTAGGCAAGTGCTCTCCCACTGAGCCACCACCCCAGC
ACCCCCACCCCCGTTTTTTTTTTAATCTTAATGTAGTTCAGTTCAGCTTATGAAACATTT
TTTCATGAATTATGCCTCTGGTGTTGATATAAAAACACAAAAAAACAAGATAACCTAGAT
TTTCTCCTATGTGGTTATTCTCTTGGAGTTTTATGTTCTACATTTAGTCTGTGCTTCATT
TTGAGTTAATTTTTGTGAAGTGTGAGCTTTGTGTCTATATTCTTTTCTTTTCTTTTTCTT
TCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
GCATATGAATGTCCAACTGTTCCAGCACAATTTATTGAAGGGACTACTTTTTCTCTGATG
TATCACCTATACTCCTTTGT
Chart Advanced