SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001236_2.0
Identity
PromoterIodothyronine deiodinase 3 (DI3)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Promoter IDSPR00001236
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001171_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001236_2.0 # Promoter # Iodothyronine deiodinase 3 (DI3) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) Full length # Forward
AGGACCAGTGGGGCCAGGCACTGCCCCTACCTCCCAGGCTGGCCAGCACCAAGGAGTAGG
GCGAGGCCACTGCGCGTGCACTGCTGCCAGGACAAGTCAGCGCCCAGGCTGGGCCTAGCG
GGATGGGCTAAACCGTGGGGGAGGCGGCCACGCAGAGGCGCCTTCCCCCAGGGCGGCAGG
CAGGGGAAGGCGGGGTCTCTCCCAAATGTCCTCGATCCTGGGGTCTGTCGTAGACAGCAG
TGCAGGGACAGCACTGGAAAGATGCACAGGCCAGGCCAGGTCGGGCCAGGTCCAGGGCCA
CACAGCAAACACCAAGGCCTGCCTCCCAGACCTCCAAGTGAAGCCCTGGGTCCCCCACAA
GCTCTCCTGGACAGACTTCCAGGCTGCCCACCCTGGGCCCCACTGTGTCACCCCATTCTG
CCTCAGACTCCCAAAGGGACAGACACGTGATGTGTTGGAGACCCTCTAAGACTACTCCTC
TGAGCCCTGGGGCACCCTCCCGGCCTGCACAGGGTATCCACATGCTCAGCCTCAGTCTGA
GGTGGGAGGAAGCGTGGAGAAGTCGCTCCCCAAGCCAATGAGGAGGAAAACGCACCCCCA
ACTAGGGCCTGGCGCCCGGCAGGGCCTGGTCAGCCCAGGAAGGGAAACAGATTGGCCCCA
GAGACAGCGGACAGGTGTGTCCTTTAGACACCACACCCCAACAGGACTTCCAAGAGACTG
TGCTGACACGCCCCCCTTGCTCACCACCGTGCGTGTGCAAAGACCAGAACAAAATATCTT
GAAATTCCCCACAAATAAGGAGTCTTCAGTGAGTCCACGCTGCACTCCTTGTTTGTTTCA
CAAATCTTTATTGGGCAGCACCCCCCCAACACCCTGGGTGCCTGTCGAGAGTCCTGGTGT
CCAGCCTGGGAGCCGCTGGGTGTGCAGAAGGCAGACACAGAAGCCATGGGAAGACACACC
CACCAAGGCCTCGGCCACAGGGACGCACACACAGCAGAGGGGTGTCCTCCGGCTGCATGG
GCGAGGGCATGGTCAGGGGCTCTGCTGCCCCTGTGGGCAAGTGGGCCCAGGTGGAGGCCC
ATGGTAGGAATGGAGGAAAAATGGGAGTCTCCAGGGGAAGGGCAGAGGGAACAGCCCAAG
TGGAAGCTCAGAGGCAGGTAAGCCCCAGGAATCCTGGTGCAGGGGAGGGCAGAAGTGGGT
GGCCAAGGAGGGCTGCCCTGTCCTCACCAGTGTGTGAGGAGGCAGGGCCAGGCACGGGGC
ACCCACATGTCATTCTCCAACTCTTCTGGACGTGCGGGCCACACCATCCCCCTGAAGCCT
CAGGGGCGGGGCATGGAGGGCCACAGGGCATTCCCAGCCCCATGGGGGGTCTCCAGATGG
CCCCTCTGACCATGGATGGGGGTGGCTCCACCAGAAGAGACACGGGCTGCACTTGTGGCT
TCCCACAGCTCCACAGGGAAGCAGTGGGAGGGAGGGCACAGCACCTGGGTCCACCAAGCC
CTCCCCTTCAAGGACACCACCAGGACTGGGCTCCTGGGAGCAGGCCATCCGAAGGCCAGC
CTGACTCGCAGTGCCAGGGCTCTGCCCCTATCCCCTGCCCCCTCCCTCTCTCCAAGTGGC
TCCCAGACACCAAATGGACCCAGTTCAACATGTCTTTCCTTTTCTTTCCCCTGTCCGCCC
CCTGCTGGAGCTGGGAGAGGGTAGGCAGGAGGGGCAGGTCCGGTGGCAGGAGAAGTCCCA
GCAGGGAGCCTGCCAGGCCCACTGAGGCCCCCGTCCCTTGGGTCCCCCTGGGCCCTGGCC
TTAGGCCAGGACTCTCTCTCTGGACAGTTGGGAGAAGACAGGACAGTAGGGGAAGCAACA
GGAAGGGTGAGCTACAGTGAGTGGGGTGTGGCCCTGGAGAGAAGGGAAGGAGAGTCAGGG
GTGGCCGAGGGAAGAGGGCAGAGAGTGAGCTGGGGGGCGGGGTGCTGGAGTGGGAGGCAA
CAGGCAGCTTCCACGACCCGAAGCCAGTCTTACCTGGACCTTGAGTCTTCATTCTGGCTC
CTGCCTAGGAAGCTGTGGAGCCAGAAGGGTCTGGGCTCCCTGTCCAGTGCTCTGGAATCC
CCAGGGGTGAGGTTGTAGCCTGTCCAACCAAGGGACACCAGCAGACCCTAGGGCAGTGAT
AGACCTAGGGACAAGCAGGTGTCCTGGGTACTCCCAGGGCTGGAAGGAGTGTGGTCCACT
GCTACAGGTGGGCTGGACCTGCCCTGACCCTGCCTTCCACACATGCACCTGTGCACACAT
GCACACTCAGGTACGACACACACACACACACACACACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GCAGCACTGGGTGATCCCTCAGGGCTCAAGTTGCAAGGGGGCGGGCCTGGGCGGAGGTGG
AGTCTCCCGCCAATTGAAGCCTCGGCTATAAATTGAGCTCTCCGCAGGGCGAAGCCCAGA
TGCCTCGCCAGGCCGCCTCGCGGTTGGTGGTCGGAGAAGGCGAGGGGCCCCCGGGGGCCA
CGGGGCCCACGGCCACCATG
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