SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001491_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesMeleagris gallopavo (Turkey)
Promoter IDSPR00001491
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001426_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001491_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Turkey (Meleagris gallopavo) Full length # Reverse
NNNNNNNNNNNNNNNGCCAGCTCCTACATAGGGAAGAAAGGGGAAGTGAGGATCACTCCT
CTCCCAGACGCTCATTCTGAGCATCTCAGCTTCAGAGTTAATTTGCATTCTTTCCAGACC
ACAAGCAGTGATCAAATGAAAACATTAACATCCCTTGGCAGGATTTTGTCTCCTGTGTCA
CGACTGGGCCAAGATTTTGGCTCCTTGCTCCACAGGTATCACTACCTACCTATACATCAG
GAAGCACAACTCAACCACCTTCTCCAGACACTCCTGTAAGATCCCTGTGCCTCAGTCTCT
CCCTCTGTAACACTTGGTGGGACAGCCTGCAAAGCCCACATGGAGATCCCCCAATGGCAA
ACAGCAGTGGCATGCACTGAAATGCAAAGTCTCACTTGAAATGGCCCCAGAAAGGCTAGA
TTCTGCTAGACTTTTCCACTCTGCAGCACTTATCATTGACAGAAAAAGAACAACTTGCAG
GCAGGGCAAGAGAGCTCCACGTTGCTGTGAAGGAAAGAGACAGCAAGACAGACCAGTTGC
ATCACTGGAAGCCAGCAGATCTCACCTGGTCTCTCATTTTGGGGCAGCTTCCCCTGCCAC
ACCAGTAAACACCTAAAGGACAAATATTGTCATCTGCTGTTCAATTGTTTATTGTTTGCT
GCACCATTTTCATCCCCACAGCTCCTGTCTGTTTATTTTCCTGTCTGTTACCTGCCAGTC
AAAAGCAGCAGTAATGCAGCCCAGAAGGCTGTGCTCCCATCATCTGCAGCAACAGAAGCA
CTTAAGAGCCTCCCAGGGTGATTTCAGGACTGAGCAGATAAAAAAAAGCAAAGACACTGG
AATACAAACCAGAGATCTGGACTCAGACATGACTGAATAAAGGCAATAGTACAGAACATG
GAATGTGGAGAAGAGTACACAGGAACTCCACAGCTCCAAATAAGAGTAAAGAAATATGAG
GGTTATTTATCTACTGAGAGGAGCAACCCATTCAGGAATTTCCATGTTTCTAAAGCCAAA
ACCATGCCTTTATTCTCCAGATGAATGGGACAAACATACATGGGGCTCTACACAACGTTT
TCCTGAGCAGCTGCCCTGTTAGCTGAGAGCCAGGTGACAGGGTTATGTCACGAAGTGCTG
GACCAGATTCCAGAGCTTGCTTGGGCCTGGCACATCCTGCACCATCCTTACAGTGCAGCC
AAGTGTATAAGTTGTGCACAATGGCAACCTCCTCTGCAAAGGAGGCCATGCAGGCTGTGT
GCTAAGCTCTAACGAGATGGGCCACATCCTAAGCCCATCAATGATTCCCTGCTGATGAAT
CTTTCAGAGCCTCTCTCTTTTGCACTTCACAGAGAAGGACCTCAAGGGATGGAAGGCAAA
TGAGCAACAAAGATTTTAGCTGGTGAGACCACCTGCTGCTGTAGCATTAGGAAAACGACA
CGATAATTTGCTTAACAGGGCTGGAGGCAGAAAGAGAATCAGTTATGTCCCACACATGCA
GAACATTTCTGAGCAGTGAAGGCAGCAGAATATGAGGAAGGGAACGTGGGGGCCAGGCGT
TAAGACAGTACCATCTATCAGTCCATAAGAATGGAGAGCATACTCCAATAACCAGAACCA
CGTGCTTTAAGCGAGCTGAAGAAAAATTAAAAGCTTTGTTCTGTTTACATTTTTTCTCAT
CTCCAGCACTGCCCAGTCACAACCTGCCACAATACTGATTCTGTGGCCACCAATCCCTGG
CTGCCTTCACAGCCCATTGGGAGCCAACAGCACATCTGGAATCACCTCAGCATGGCAACC
GTTGCCATCACCCTGGTGACCATCTCTACCACAGCGGGCACCTCAGCCCCACGACGGAGT
CCTCAGCACTGTGATCACAGAATCACAGAATGTCAGGGATTGGAAGGGACCTCAAAAGAC
CATCCAGTCCAATCTCCCTGTGAGAGCAGAAGCACCTGGATCAGGTCACACAGGAATGCA
TCCAGGTGGGTTTTGAATGTTTCCAGAGAAGGAGACCCCACAATATCTCTGGGCATCCTG
TTATTACCCTTACTGTGATGAAGTTTTTTTTCTCTCATATTTATGTGGAACCTCCTATGT
TCCAGCTTGCACCCCTTGTTCCATCACTGGATGTCACTGAGAAGAGCAATGACCTCATTG
CTCTTCAGTACTTAAAGGGAGCCTACAAACAGGAGGGGAATCAACTCTTTGAAAGGGGAG
ATAACAGCAGGACAAGGGGAAATGGTTTGAAGTGGAGGGAGGGAAGATTTAAGCTGGATG
TCAGGGGAAGTTCTTTACAGAGAGAGTGGTGAGGTGCTGGAACAGCTGCCCAGAGAGGCT
GTGGATCCCCATCCATCCCTGGAGGTGTTCAAGGCCAGGTTGGATGGGGCCCTGGGCAGC
CTGGGCTGCTATGAAATGTGGAGGTTGGTGGCCCTGCATATGGCAGGGGGTTGGAGCTTC
GTGATCCTTGAGGTCCCTTCAACCCTGGCCATTCTGTGATTCTGTGACCNNNNNNNNNNN
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