SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001566_2.0
Identity
PromoterSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesMonodelphis domestica (Opossum)
Promoter IDSPR00001566
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001501_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001566_2.0 # Promoter # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Opossum (Monodelphis domestica) Full length # Reverse
TCAAAGAGAAGAGAAAAATGAATTAATATTTGATTAAATAAAAAAAACAATTTGAAAAAA
GAGACTGTCTTTTAAAGCAGCAATGAATTTATCTTTTTCAGAACCTTCATAGAACATTTA
AGTGAAATAGTAGTGTCACTTTAAAATAGCTTAACAATGACTAAGTTATTCACACAAAGC
CATCAATTAAAATGGAAAATGCATAAAAGATTACCAGTTTCAATGAAATCATTGCTCCTT
ACGTAATCAAAGCTGTTAAAGCAATCAAGAATACAAGGAAGTCATACTTCAGGAACTAAA
AATAAACTTGGTAGTAAGATATTTAATTCCACAGACAAAATAGTTTAGGCTTTACTAACT
TCTTTCTTTTTGCATTCAGATTAAGGCTAAAATAGTTACTTCAAAAATGTGAAAACATGC
AATGAAATCAAATCTAAATATTTAAAAGAGAAACAACTTTCTTAAATAAAATTGTTGGGA
AGCTGAAGATGATTTGAACATAAAAATGTTTTTAGAAAATTTTAAGTATGTGTTTTATAT
TAAATGTTTATTTTTCTAAAGAAATTTCGATGAATTCAAATACATTTTCTTCCTTTGAAT
GGCAGTCACTAATGTAACAACACACATTTTTGGATACTACATTACTGTTCAATATTTCTT
AAATATCAGTGCTCATTGACTTAATGTGAAATCTTCAGAAATTTATAAAACCACAAAATA
TTTTAAGCTACAAAATTTCAATGACATTTGTGAGTAAAGAAAAATTTTAGCACCAATTAT
CTGATATTAATCAAACTCATTTAGGTCAGAAATGATTAATTATGGATCCCTTTGGCAATC
TGGTGAAACTTCCCCACTTTTTCTCAGAATGTTTTTTTTAAGTGTAAAAATATGTAGGAT
CACAAAGAAAACTAATAATAATGAAATATAATTATCAAAATATTTTTAATTGAAAGGTGC
CAGATAAAGAGTTTTTTATTTCAGCTTTTAAAATCTGCAAAAACCAGACTTAAAATTTCT
TCAATTATTGAAACTCACATGGCACAGAGTTCTCAACACCATTCTGAGTTAGCCTCAGGC
AATGTTGTCAAAAAAAGATTACAAGGTCCCAAGAAACTGTGCAAAATGTAGGACTCTAGA
AGAGTAGTAGCACTAAACTCGGAGTTTAAAAAAATGGGGTTTAAGTTCCACCTCTGACAC
TTTCTATCTGTGTAGCCACTTCACGTCTATGAGTCTATTTCTTCCACTATAAAATGAGCT
TTAAAAGCAGCTGTAGTATCAACATAATAGGGTTACTGTAAGGCTCAAAAGATAATATAT
AAAAACCAATTTGCAAATGTCAAAACATCACATAATGTAAATAGTAACTGCCATTTATGT
AGCTCATACATCCTTTCTTACATAAGTGTATTAATTTGATGCACTGTAAAACATTTAAAC
TATTTACTTTTTAAAAAGAACAGCAACAAACCATATCATTAACTGATATTTCTTAAACAA
TGTTTAAATTTTGCTGTTCTAACACTAACTCTCAAATAACTCTAATATATACAGAATTTA
TGCTTTGAAGGAGTTCAGTTCTGTGCTTAAAATTCTCATTGATCTTCATAACTAATAAGG
CAAAATTTAGTCCTTAAAAGCTAGGCAGCAATAAAGAGTAAAATGTCACTACTACATTAC
AAAACAAAAAGTGTGTTCTTACCAACAGAATTCTAAAGAATATCTGAAACACCCCAAATG
GCTCATCAATAAACAGAGAGATAGAATGACTATTGTAATAATTTAAAGTTTCCTCATGGT
AGAAAATAAATTTACCTCTTCAAATATGGTTGAAAAGAATAGCAGACATGGGAGTTAGAG
GACCTGACTTCAAATTCCAACTCTACTACTTACTACTTGACCTTGTGACCTTATAGAAGT
CACTACACACTCTCTGAGCCCCAGTTTCCTCATCTCTAATTGAACTAGCCAATCTCTAAG
GTTCCTTCCAATTCCAAATTTATGCTCCTGTAAACAAGAAATTTAAAGATTTAGGTTACT
CTTGCTTTAACAATGCACACGTTCTGCAAAATTGCCTTAATTTTTTTAAAATAAACTGCA
TAATGTGCCAGAAATATTTTTAAAATCTTCTTGTGAAACAAGGAATTGTTTTGAAATGTG
AATAATTGTAACCTAACAAATCTGTTTTATAAAAATCTGTATATGTGTATGTTAACATTC
TTAAAGCAAGGAATATTTGAGGTATTTTTAATGAACTATATTTTAACACTAAAAACTAGA
AAAAACACAAATCTCAACTGAAAATAATCAATACAAATGATAGTAATCGCTACACATTTG
CACTTCACTCTCTACCTCTCTGCAAAATACTTTTTTTTCTTTTTGGCCAAAGCCTTATTT
CAGTTCAAAATTTAAGAAATAGTTCTCACTTAGTTCAATCTGTGATGCCCAAAATACTTT
TTTAGAAAACTTATCAACTCTTGATCAATGAAATGTTCAGGTCATGTGTATAATTTAAAA
TAGATTTTTTCAAATAAGAAAAAAAAACACCTCCTAATTATTAAATTCTAAGCTAATTTT
CTCTTTGATTTGATGTTTTTCAACAGTACTAGTTATATATTTCATTTCAACAATTAAAAT
GACAATAAATATAAATGACCTTTTGTTCTTCACAAAAAAGAAAAGCTACTGTAGTCATCA
CCAGCTGCAGAGACAGAAGATGTCACTAGTAGGAACAGACTGGTAAACTATATTCTAGTT
AGAGTACTGGGTGGCTTTTTTAAAGATCTTGTTTATTGTGACTTTAGGAAGTTTTGTATC
TCACATAAAATGCATTATCTTCCCCTTCCCTCCCCCAACTCCTAGACCAGAAAAGCAACA
TTAAAATTTCTACTTGTTGTTCCATATTCCACAGTTTTATAAAGGAGACAGACAATATGC
TTAGAGTGAATACACCACTAAAACAGAGAAAAAGTTATTCTTGTGTGAAAAACACAAATT
TTTCAGTCAACAAGAACATTTAGAGAGCTATGGGAATAGAAGAAGACATACTATATAGGT
AGGTTAATATTTGGTTTTATTACTAGATACTTGAATTTTGGTTTTAATTTGGAGAAAAGT
CATTTTTCAAAATCTGTTTTTCAGATATCCTAAGTCTCACATCAAGAATGTGACTGAAAA
AAAGACAAAAGCATAGTAATGCATTAAGGGGAAAAAACTAATACTACCAATGCTAAATTA
TCATTTTGCCTTGTTATCTTAAAAAAAAAATCAAACCATAAAATTAAATTATCTTTCATT
CTCCAATGTACTTCAGATTCAGTATATCTTAACTGAAATTATTTCAGAATTTTAAAATTA
TCACTGTAAAAATTATACTCCATATTAATTATTCCTGAAACTATAACAGGTACATTAGAG
CTTTTATATGTTTCATTTTAAACTGTCTTATGGGGAAATTATAGACATAAAAGCCGCTAC
TGTTTCTGTAGGTAGCATATTCACATTACCTCCCCTGGAAATCAGAATTTAGAAACAAAT
ATCTTGCTTCAAACCTATTTCATTAGCTTAGTCAAACATAAATACTCAATGGACACTAGT
AAGAGCCACTTAAATTCAATCAGTGTTTACTGAAGACAGCTACCCCAGATCTTTACAGGA
GGGGCTAAATACCATCTAAATATTTATTATTTGCTGATGATTATATACTGCGCGTTTTTG
GTGAAGTTTTTTTAAAGAGGCAGACTTTTCCACAAACTAAACAATGTAAAACTAAATCTA
AATGTCTGCATTATGTCTCAAAATAATTTCAGAAGAAATTATACCACCCACTGAAAGAAA
AGGAAAAAAGTCATATTATGAAAATACTAAATTCTATCCATCTTAGAATGGAAAGACATT
TTGTCTCCTTGTAGCCAAAAATACCTCCTGAAGGAAAGTGTGATAGAATGAAGTAATGAG
TATTCAAGAAAATCCCAGAAGCTATACTCCTAACATCCTGGAGATTTACTCGAATTGTTT
ACATTAACTAAATAAACCACTTGCCAAAACAAACTATAGGAGTAACTTTAGCCTGAATGT
AAAAATTTTGCAAGACTTTCAAACACATTTAGAAAAATCAAAGTCTGAAACTTTAACTTG
TTAAGAATCAATATTCCTGCTCACTTGCATTCCTATTCCCCTGACTTTAAAAAAAAAAAA
AAACCCACTACAAAGACATAATTTATTTCAATTCAAATAAAATATGGGATGTTTTGCATG
CAGCACATATAGTATGTATTTACTAATTAATAACTCAATGACAGAACAATACTGAAATTT
GTGTCATTTACTTTTACATTCAGACTTAAATCTAGTATTAAAGCCAGACTTAGAGCTACT
CTACCTCTAGAGTTTAAAAATGAACACATTTTGGGGTAACTTAACATCATTAATGTATTA
TTAGTATCATTAAAGCATTGGGAATTAAGAAATCTTATTTTAAATGAAGACATCAAAAAT
TCCACCTCCTTGTAAATTCTTGGCACATGCATGGCATGCCTGCTTTAATTCTTAGAAAAT
AAAATAAGTCTACACAAAATAACAAATTCTAACTATAGAATTCTCCATTAGTTATTCACT
GAAAAGTAGGTCAATTTTTGAACTCTGTGTACTCAATTCTTATGTCTATGTAAATAAATT
GGTTGATATTTTAATATCAAGAAGCAAAATTTCTTTCAGTGTGTATGTAATAGATTGTGA
TCTGGAATTTTTGTTGCCATGTTAGAAATTTGATAGTTAATAAAATAAATAAAATCTATT
TACACATTTATTAATTCTTCCTATGCTCCTCATACTACTGTTCAAGAAAGAGCTAGGCAG
GACACTTAATGTTCCTAGAACACCTAAATGAAATCCAGTACACCTGTTTCTCTTAGCTAT
CAAAATCAAATTACATGCTTTTATATAAAAATACCTAAAAGACTACTAAAATTATTTTCT
GGTATATCTCTTGCAAATGG
Chart Advanced