SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001784_2.0
Identity
PromoterGlutathione peroxidase (GPx)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001784
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001719_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001784_2.0 # Promoter # Glutathione peroxidase (GPx) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Forward
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NNNNNNNNTCGCTCAGTACCTGAGGGAAAGAGATACGGTTAGGGAACCATGAAATTTATT
AGTAAGAAGGTGTTAGGAAACCTGGGTTTGTGCTAAATGATTTGGGAGCTGTTTCAAGGA
ACAGAATCTTCTCTCTGGCTTGGATGCTATCAGGATCTGATATAAATCTGAGATGGAATT
ATTTTTGTCCTGATCTATCATGGTCACTTGTTTTGTGACATTGATGATCTACAAAACTGT
TTCTTATATTTTAAATTTTATTTTTAATTTGTTTACATAGTTAAGAGGAATGCATTCCCG
TGCGGTGCTTCAATTAGGATGGGAGAGGTTGAGGTATGCAGAAAGGTGGGTGGGACAGAT
GTTTCAGTTCTTTTCATTTTATTCTCCTTGTCTGCTGGGATAGAAGACCACTCCTTGCTG
CCAAACTACATCAGCATCCAGAGGGTGGGAAGGACAGTCATTTGATGATGCCTTAGAGTT
CTCTAGTTTAGCCTGACTCAGTCCATCACCACCCCAAGCTCTCATGCAAATCATTGGGTG
CTGCAGTCCCACAAAGGTCAACCCACAAGTCCCCTGTAGAATCTGTTCCCGGATGTGGTT
CTCTCTCATTTTTGATGGGCGCTATGGCTCAACCTGATGTGTCCCACCCTCTGCTCTGAC
ACTCATGGGTGATTACTGTAGTATAGCTTTACCAGGCATGCTCCAAGCTCCAGCTTTTGT
GTGTACCAGCCAGAAACTAGTGAGGCCACTTAGCCCAGCCTTGGTCTCCCACGTGAACAG
GTGCCTTGGCCTGACTCAGACATGTCCTCCAGTTTCCCCCTCTAATCCACCCCAACTCAG
CTCCCTTGATTACCTGCAAGTGCAGTATCCTGGTCTGTGGAAGACCCCAGAAGTGATTCC
TTCTCTGTAAAATATGCCTGCAGCTGCTCCCACTCCAGTAAGTCAGCAGATCAACTTTAC
CAAGCAATCTGAAACTCTGGTGGCCTGGATTGGTGTGTCCCTGCCCAGCATTTCCACTTT
CCTCATATATCTTTTTCTTAAATAATAAATTCAGTCTGTTTTTGATGATGTTTACATAGT
TAACAGAGATGAATGCCCATGTGGACCACCAGTTAGGGTGGGGAAGGTTAAGGGATGGGG
AAAAGTGGATAAAGTAACTGTATCCAGTCTCCTTTTATCTTCTGGTATCTGGGGAAAGTG
GAGAGAGAAGGGCAGAGGGCTGCTCCCAGCAACCTAACTGAATTAGTATCCTGGGAATGG
AGAAAGACTACCTGATGTCATCCTAGGGTCCCCGATATGAAGCATACTCCAAGCATAATG
CTTAAGTGGTTCTGATGATTCTCAGATGCTGTTGATTTCATTGCTCCAAGATTGAGAAAA
ATCCTCCCAAGGCCAACTGACTGACATGGTCTACCTTAGAGTCTTGTCTGGGAGAGCTGT
TTAGTTCTAGATGTCTCCCATGAGCATCTGACCATATTGCACAGGCCTCAGCAGCCATGG
TGATCCAGTTCTGACACATGCACTCCATGATCAGACCTCACAGCCTGTTTTTCACTGCAG
TTGGAGTTCTGAGTCCAGTGAAGCAGTTGGGGGTGTCCCCAAGAAACCTCGTGAAAGGTG
ACCCAAACCTGACTTCTGTGTGTGCCAACAGTATGGAGTCTGGCTCAGTCTATCACTCAT
ATCAGGCTACACACTGGTGGCTGCAGTCATCTGGTCAGTTCTTTCCCTCGCCCCATCTCA
TATGCAAAACAATGGGATGCTGTGGTCCAGCTTTAACTCTACCAACCATACACTCAAGAC
TCACGTACATCAGCGCAAATGGCAGCAAAATTGGAGTAACCACCAATAACCCCACTAGGT
CTGTTCCCTGCCCTGGTACCTGTGTATGCCAGTATGTTCAGAAGACTCGGGTAGCCTATC
CCACTTCCCCATTCAGCTTTTGCATATCTCACGGGCCGTTGGAAGCCTAGCTCAACTAAC
CCCACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTCACTGTGTGGGCTTTCTG
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