SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001820_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein K (SelK)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001820
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001755_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001820_2.0 # Promoter # Selenoprotein K (SelK) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Reverse
TCATGTCTTTTCTCCTGGTCCCCACTGTGAATGCAACTGGGAAACCTCCTTCAAGAAATC
TTATGAAAAGGCTTCACAACCAAATTGTTGGCTTTATCTCCACCATACTTTACTAATGGA
GCTTTAAGATTTGATCTCTGTTCTGAAATTTCTTACTTCGAGTATTATCTACTGAGATAA
TCTAAGGATGAGAAATGATTTTATTTTCAAATCCATATATTTTTTCTCTAAATCGCTTGA
AAATTGATTAATTCCATCTTTAGTACAACTTTATTTATCCATGCCTCATAATGCAGGGAT
GGATTCAAGGCTGGATTCATCTGGCTTTGTTGAACTCAATGTGACCTCTCTGGTATGTTG
CTGTTCTCAGGGGATAGCCCTAAGATCTAGTGTTCGAGTTAATAAAGCAAAAACTGTATT
TTTTTTATGATCAAGTCTCAGTAGTCACAGGGCTTAATTTCTGCTCCATTTTAAAGGTGA
AAGAACTCACTAGCTTACCCAGCTACAAAGGGAGAAAGCAAAGATCCAATGTCTAATACA
AAAGGTGTCAAAGATTTCCATTTGAAAACAAACATAGCAGATCTTCACTGCCAAAAATGT
TAAAGAAAGTTCTTCTGAAGGAAATCAAATTACACCAGATAACAATTTAGACCCATACAA
CAGAATGGAAAGCACCAGAAATGTTAAACATACGGGTGAGTAAAAAGTGTATCATTTCAT
ATAGCAATAAAGATATAGATCAGATCTTATACAACTGCAATCTTATCAACTCATAAAGAA
ACAAATAAAACAAGACATAAAAGAGTGGCATTTCAAGAGGGTAGAGTAGTAGAAGAAATT
GTATCGTATGAAGGAAGGGAAACAATGTCAGGCACGCAGGCCTCTCCACAGGCCTCTGCA
CAGGCCTCTCCTGGAGGAGTCATCATGGCTAGCAATGTGTGTAAAGTAGCTTCCCCAACA
TGTCCACTAACTTCGAGATTACACATTAATGCACTCGCACACTCCAAGTACTCACTATAG
CACTTCTTGTCGTAAACTCCTGAATTTCTAAAATATCAAAAATTTATAAATTCAAAGCAA
AAATTCAACATTCATGAAAGATTAAAATAGTTTCCTCATAACATAATGCAGAATTACAAC
TGGTAGGTCAACCTATGTATATGCTTAAGAAAAACTTTATTTTGAAGCAATTGACATGAA
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TTTCACTATTTGCCATCATCTATTTCTGAGTAAATGTCACGGCTAAAATAAAAAGATAAA
AATTTTATTTCATAATGGCCCGGTAGAGTGGCATAGCAGCTAAAGTCCTCACCTTGAACG
CGCCGGGATCCCATATGGGCGCCGGTTCTGATCCCGGCAGCTCTGCTTCCCATCAAGCTC
CCTGCTTGTGGCCTGAGAAAGCAGTCGAGAACGGCCCAAAGCTTTGGGACCCTGCACCCC
TGTGGGAGACCTGGAAGAGGTTCCTGGCTCCCGGCTTCAGATCGGCATAACACTGGCCGT
TGCGGCTCACTTGGGGGGATGAATCATCGAACGGAAGATCTTCCTCTCTGTCTCTCCTCC
TCTCTGTATATCTGACTTTGTAATAAAAATAAATAAATCTTTTTAAAAAATTTATTTCAA
CATTAGTTCACAAAAAGGCAGACAAGGTCTATGTTATTCATTGAAACACTTCATCTTAAA
GTCCTGTTCCATTTTATAACATGACCACCATGCTGCAAGAGATCAGGGTTGATCTCTCTT
ACCAACAGTAACTTTAAAGAATTTAAAATCATTTTTACTAAGTATGGGCCCAGCACCATG
ACCTAGCAGCTAAGGTCCTCACCTTGAACGCGCCCAGATCCCATATGGGTGCCGGTTCTA
ATCCCGGCAGCTCCACATCCTATCCAGCTCCCTGCTGTGGCCTGGGAAAGCAGTCGAGGA
CAGCCCAATGCTTTGGGACCCTGTACCCGTGTGGGAGACCTGGAAGAGGTTCCTGGTTCC
CAGCTTTGGATCGGCACAGCACTGGCCCATTGCGCTCACTTGGGGAGTGAATGATTGAAC
GGAAGATCTTCCTCTCTGTCTCTCCTCCTCTCTGTATATCTGACTTTGTAATAAAATAAA
TCTTTAAAAAAAATCATTATTACTAAGTCTCAAAAAAACTTTTTTTTTTTTTTCACCAGC
CACTTCAAGCATAAAACTCAGTGTGCTATTGTGGAGATAAGTTCAATCTTTTCATAAAAT
TTTAAAGAGATTTTAAGAAGTTTTATATGAATTCAATATTCCAGGTTCTCCCCAATATGT
AGCTTCAGTCTTAAGATTATACAAAGAAAAGAACATGTGAAAAATTTTTCACTATACTTC
CTAATATTCATCAGTTTGCCGGAACATTCCTACCAAGTGGGGTCTTTTATCACAGGAGGT
GGAGCCTTTAATCAATAAAATTCCATCTGCATATTCATAACTCATTGGACACCCATACAG
AAGCATGTTAAATATTAACCTGTCATAGATATATTGAATTTCGAGTCCCACCCAGAGGTA
GCCTTCAGATGCAAGTCAACTGAAACCACAGTCCTGATCTTTCGGATGCAAGAACCTCAC
TCCCAGCCCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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