SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001843_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U (SelU)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001843
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001778_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001843_2.0 # Promoter # Selenoprotein U (SelU) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Forward
CGGCAGACACGAGACAGAAGACCAAGAGATGCAATCACGCATGAGGCAAGGTTTATTTCA
CACTGGCTCGTGGGCGCCCCTGTTTGATCGAGTAAGGAGTCGCGCCGAGCCGTACAAGCT
GGGTCTTTTTATAGGATATGGGAAGCAGGAAGCGGGGTTATAGAAGCAGATGCATAGTTA
CAGGGATCCCATTGGCACTTTTAAGTCACACAAGGCTATGATTGGTACAGGAGCTGCCCC
TGCTTAAAAGGCAGTTTTCAAGCATGGCTCAGTGTCCGAGAAATAGAAACTTATCTCTTT
CTTGGGAAATAGAAACTTGGGAGACTGAAACTCAATTGTCTTAGCTGTTGGAAAGCATCC
AACGGCTCCTAGCTCTCTATCTTGCAAGGTCTTCTGCCTCTCCTTATCCTACAAGGTCTT
CTGCCTGCAGGCATCCTATTGACCCTTTTTCTGCTGGAACTAAATTTGGGCTCTTCATTA
CCCCCTGGCAGGACCTCAGGGCAGCCCAGGGCACAGCATGAGCTGGGTAGTTGCACTCCG
AGCCTTGGGACGCCTGTTTCCCATCTGCTCCTGGGCCCTCTGCTGAACCTGCGGGATGGA
AGCCGGGGTCCTGCACAGCCACCAGGGCTGGGGGAGAGGCAGGGAAGACCAGGGGACTCA
GGGTCCTCACGGGGCACTTGTCCTGCAGGGCAAAAGGAGTGAAGCCAGCAAGCCCATGGT
GCTGGAGGCGCTACCGAGCGTCACCACGGTGGCCGAGGAGGAGACGGCCCCTGTGCTGGC
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GGAACCGCGGGACAGTGACGTGGTGGCAGCTGCTCCTGGCTCGCAGCAGGCCCGGCAGGA
CCCGGGGGGCGGGGGCTTCCAGAGCGCCTGGCCGGCCCAGGACGCGGCACAAGGCCGGCT
TGGCCGCCAGCCATGTTCCGAATGAAGTGTGTCCCCGCTGGCCACAGCGTGTTTCGGGGA
GGTGCTTGGGGCTGTGTCTTCTCTGGCTCCCGCCTCAGCGCCCCTGCCAGCGTGCACCCC
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CCGACCACCACTTCCTCCGCGGGAGAAGGGGCCTCGCGTCACCGCATTTGCCAGGCGGGA
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GAGAGCCCTCCCTCTCGCCGGCCTTTATGGGGCTTGTGAGGGAGTGGTTACACAGCAAGG
CAACACGGCCCCTCTGAGGCTCCGGGTGGGCAGAGGGGGCAGCTGGTGGTGGCGACCCCA
CAGGTGGACAGAGGGGGCAGCTGGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGGCAGAGGGGGCAGCT
GGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGACAGAGAGGACAGCTGGTGGTGGCGACCCCACAGGTG
GACAGAGAGGACAGCTGGTGGTGGCGACTCCACAGGTGGGCAGAGGGGGCAGCTGGTGGT
GGCGACCCCACAGGTGGGCAGCTGGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGGCAGAGGGGGCAGC
TGGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGACAGAGAGGACAGCTGGTAGTGGCGACTCCACAGGT
GGGCAGAGGGGGCAGCTGGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGACAGAGAGGACAGCTGGTGG
TGGCGACTCCACAGGTGGGCAGAGGGGACAGCTGGTGGTGGCGACCCCACAGGTGGCAGG
GTGTGGCTCGGGCCGAGTCCCCGGGACACGGAGAGCCACCAGCTCTGCCCCAGGACACAG
GATCGGGGTGCGGGCTCATACATATGCAAATGAGTCACCGGTTCTGACCGGCCCGGTGGG
CGGGACCCGCAGGCGGAACAAGGCTGTGGGCGCCGCCATCTTGGGGCGGGGCGTCTCAGA
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CCGGGAGCCGAAGAGAGACGGGTCGCCCGCCCATGAGCAACCGTGGACCCTTTGCCCGCG
GTGGGGCGCCGTGCGTCCTGAAGCAATGCGAACGACCCGCGAGAGAGTGAAGAACGGGCG
TGGGCACCCTGTCCTTTGGAGCAGGTGGGAGTGCGGGTTCGGGCCTAGTTCCTCCGAGCT
GGTCGCCCCTGCTGGACGCGAGCTCCCTGCGCTTCCACTGCGCTCCCCGCTGAGTCCCTC
CGAATGGATAGTCAGAGCTTGCTTCCCCGCGAGCTGGGCGCGGGCTCCCTGCGCTCCACT
GCGCTCCTCACTGAGTCCCCCGAGCCTGGTTCCCCCGCGAGCTGAGCGCCGGCTCCCTGC
GCTCCTCACTCGGTCCCCCAGGCCGAGTCCCCCGCGGGCTGAGCGCGGGCGCCAGGCCGG
TCTTGTGACCCCGCCTCCGG
Chart Advanced