SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001844_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Promoter IDSPR00001844
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001779_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001844_2.0 # Promoter # Selenoprotein U2 (SelU2) # Pika (Ochotona princeps) Full length # Reverse
AAAAAAAGGGACATGTATATGTTACTAGGAATTACGTAGGTTTTATACAACTTCCCCTAA
TTCAACTCTGTTTCATTCTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGCAGCTAAAGTCCTCGCCTTGACGC
CCCGGGATCCATATGGGCACCGTCTATCCCGGCAGCTCCACTTCCCATCCAGCTCCCTGC
TTGTGGCCTGGGAAAGCAGTGGAGGATGGCCCAGAACCTTGGGACCCTGCACCCATGTGG
AAGACCTGGAAGAGGTTCCAGGTTCCTGGCTTCGGATCGGCGCACACCGGCTGTTGCGGC
CACTTGGGGAGTGAATCATCGGATGGAAGATCTTCCTCTCTGTCTCTCCTCTCTGAATAT
CTGACTTTGTAATAAAAATAAATAAATCTTTTAAAAAAAGAAGCAAAAAATGAAAAAGCC
ATTTAAAAATAAAATTAGGCCATAAATGCCAGATACAGTTATGACTAACTGTAGAATTTA
GGGTAGTAGTTATTAGTAGTTCTTAATGTAGATTTCTGCTTACTTTGCTTAATATGCTTA
TGTGTGAATAAAATTATTTCCTCTATTTTATATCATAAAGTGAATTAACTTGGGATTGGT
GTTGTAGTGAGCTAAGCCACCATCTGTAATACCAGCCTCCTGGAAGGGTGTTTGTTTTGA
TCCAAGCTGTTCTACCGCGACGCAGCTTCCTGCTAAGGCACCTGGAAGAGCAACAAAAGA
CGGCTCACGTAATTGGGCTCCTGGACCCACGTGGAAGCCCTGGAGGAAGCTCCCGCACAG
CAGGTGGCCCTCCTCTGGTCTGTGAGAGCCTTAAGACAAAGACACCTCTCTGTTGTAGCC
TGGGTGCCCTCCCTGCCCTAAGAAATCCACCCCCCAGGAGACAGAAATCCAGAGGTGGTT
TCCCGCAGGGACGGCTTCCTTAGCTCTGTTTGTCACTCGTGTTTTGGAAACCACAGGATG
GCATCAGACCCAGAGCGCCTGGCAGAATTCCTGGACAGCCTGCCGCTGACCCCATGTGTA
ACAGCCTTGGTCACCTGTGTAGCCTGTCTAGGGCAGGCATACTTAGCCTAGGACCCCATG
TTTGCTGCGATCAGCTTTCGCAGGCACCAAGTGTGAGCTGGGGTCTTCTGGTCTTGGAAA
GACCTTCCTCACCACAGACCACCTTCGGGTCCCCTTCTCAGGGTCTGGGCATGAGTGGGC
GGAGCTGACCCCACAGGATGTCCCTGGGTTGTGGCAATCAGACACAGGTGGGCCCCTCTG
TGATAGCTGTGACCTAACGTGTCTGTATGGGATGGTAAGAGCTGAAGCCATGAGAAAACG
GGGTACACACTGGCTCAGCTGGGCTGCGACAATGTCACCATTTCTGTTGATTTTCCTTCT
CCTTTCCCCCTAGGAGCCACATGAGTGGAGGAGCAGCACCTCCTTGTGGTCAGCATGAAG
GTGGCAGTGTCTGGGAAATTTTCAGAAATTCTTCGGTATGGGGCAGGGAGAGCCCCAAGA
TCCACCAGCACACACAAAGGCTGGTTGGACAAAAGGGGCAGACTATGCCAGGCAAGGGCC
TGACCCCCCATGGGTCTGGGAATGGGCTTGATGAGGAAACTTCCCTGCTGGGCGTTGCTC
CTGCTGGTGAGCAGGTAAGTCAGGGCTGGGTGTTGGTCAGTTTAAGGCCCAGTGTGATGG
CTCAATGGCTAAATCCTCGCCTTGCAAGCACTGGGATCCCATATAGGCACCTGTTATTAA
GCAAGGCACTCCAAGTTGCAGGATGGGCCACTCAGTATCAGCCAAAACCAACCTTTTGAC
AATTAGGGTTACTCAAGGTTTTATGTCAGGTGCTACTATTCAATTATGTTCAAAGATCTC
TTCATGAGACTTCAATGCTCTCTGATGGACGTGAGTTTATCCTTCTGATTGGTGTCCTCT
GGCTGACATGCTGAGAAAAATTTTCTGCTTTCTTTGCAAAGGGATATGAAATTAATGCGT
GAAAACACAGATCGAAGCATGTACAAGCCCAATAGAATTTAAAGTTACTTTTGTTCAACT
GATAAGATGTAGAATCCTGCTCAAATATTTATTCAGATTTCCTGTTTTTTTTTTTTTAAG
ATTTATCTGTTTTTATTGGAAAGTCAGATTTTACAGAGACAGAAAGATCATCTGTCCGTT
GGTTCACTCCCCCGGTGGCCGCAATGGCTGGAGCTGCGCTGATCTGAAGTCAGGAGCCAG
GAGTCCCTTCCCAGCTTCTATACGAGTGCAGGGTCCCAAGGCTTTGGGCCATACTCCACT
GCCCTCCCAGGCCACAAACAGGGAGCTGGAAGGGAAGTGGGAGCAGCCAGGACACGAACC
GGCACCCATATGGGATCCCTGCACAAGCAAGGCATGGACTTTAGCCACTGGCTATCACAC
AAGGATTTTTTTTTTTAAATCTTATGCCACATGAAGGCATGGCATTCAAGACTGTTATAG
AAATCATAAATTTTATTCTGTTAAGACTTGAGGGAAGTCTTCTATTTGTCAGTCTTGGAT
GTAACACATACCTCAAGCACCCACATCTCCTTACCTGTCACACAAAGCCCCATTTTCATG
AAAGGAAGACTGGGAAATTAAAACTAGATGAGTGTTAAGAAAAATGAACTCGTTCCTGGT
GAAAACATTGTCATGCTGTGTGGTATGGGAGTTATCTAAGGGGATGTGACTTTAAATATT
TAGGACTTCCCACGGTTCTTTGAAAAAGAAGTCTTTGTGAATATCACGTATACTGATCAT
ATGTCTTTTAAAAAAGATTTATTTTTATTTTTATTGGAAAGGTGGATATACAGAGAGGAA
GAGAGACAGAGAGGAAGAGAGATAGAGAGGAAGATCTTCCATCTGATGGTTCACTCCCCA
AGTGACCGCAATGGCTAGAGCTGAGCCAATCCAAAGCCAGGAGCCAGGAGCTCTTCCAGG
TCTCCCACACAGGTGCAGGATCCCAAGGCTTTGGTACATCCTCTACTGCTGTCCCAGGCC
ACAAGCAGGGAGCTTGATGGGAAGCGGGGCCGCAGGGATTAGAACCGGCGACCATATGGG
ATCCCAGCAAGTGCAAGGTGAGGACTTCAAGCACTACACTATGCCCAAACATATGCCTTT
TTGACAAACTCTTCCTACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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