SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001878_2.0
Identity
PromoterSelenophosphate synthetase 1 (SPS1)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Promoter IDSPR00001878
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001813_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001878_2.0 # Promoter # Selenophosphate synthetase 1 (SPS1) # Tilapia (Oreochromis niloticus) Full length # Forward
CTGTGCCAGAAACCCCCTGCTGTATGTGTAACTGTAAGGGCACCTTGCAGGCTATTTTGC
AGGAACTACGTGCCATGAGGAGGTTGATGCAGACTCAAAAAGGTTAGTAAATGAATACCA
ATACACACCCTAAAATAAAGAAATAAAACACAATATAATGTTTTTCTGCCTTTTAATAGC
ATCTTTAGAAAGGCAGGAAAGGGCAGCACCACCATCTCAACCTCGCCTAGGTGCAGGACC
CAGTCCTCGCCACAGACCTCGAAAGAGGAGGCCAATCTATAGGATGACTCCGTTATCCGT
GTTTAGCACCAGAAGAGCTGGTCTTGCTCCTCTGGATGCATCACTGCTAAAAGCTGCACC
TATGGAATCTGTAAAGAGGCGAGAATGTGAGAAACAAGACTCATCTACACCCAACAATCA
TCCCATCTCCTCTGACATTCCTGTGCCGCCACCTCAGACCAACCCAGTGACGATCAACAA
CACCCCTCCTCTCCTGAACCAACTAAGGGAATCACAAGCATTAGAGGTAATCTGTACCTT
AGTGTGGATGTACATATGCAGCAACATGTGTGCTTACCAAGCCTCATTTGCATGCTTAAT
TTGATTCAGGTACACTGCACCTGTCTTATGAATTTGAACGTGTATGTGTATTTGCATGTA
AAAATAATTTGCAGCCTAAACTTTGCTTCTTTTGTGAAGCTCCATGCCTAAAAAAAAGTT
TAAGTACCTTGATTTTTCCTTGTTTTTTGCCTAATGAGACATAAACCTTTGTGCAAACAT
TGCGGTTTATTTTACAGCACATCTATGATTCGAGCTAATGCTAGAAATGAAGATAACGTC
TTCTTGCTTTTTCTTTCTAAAAACTCATTTATATTTCAACTGGTGATATTTATTTAATCC
TTTACAATTAACACTCTGTGTTGCTTGACTCCTTCACAGTCTGAGGTGCGTCTTGCAGAG
GATTATGACGTGTTTATCTCTAAGGCCCAGCTAGACTCCATTCTGGTCAACTATACACGC
TCAGGCAGCCTGCTGTTCCGGAAACTGGTGCACGTCTATGATTTTTAAAAGCATTTTCTC
CTGCTCTGATTATTTTATAATCGTGTGAAATGTCAACAAAGAACAAAAAATGCTGCTTGG
TCAAGAGCTGTGCTGTGTGTTTAGGTGTGTGCCTTCTTTGATGACGCCACGCTGGCTAAC
TCCTTGCCAAATGGCAAAAGGAAGAGAGGGCTAAATGATAACCGTAAGGGCTTGGACCAG
AACATTGTGGGTGCCATTAAAGGTAGGGCAGAGAAAGACAAACTAAAGTGTAACTACATT
TCTGAGCAAACATTAATGTAACTATGGTGTGTGTCCAGTTTTTACAGAGAAATACTGCAC
TGAACACAAAATAGAGAAGTTGCCTGGACCACGAGACTGGGTTCAGATCCTTCAAGATCA
GATCAAACTTGCAAGGAGGAGGCTGAAAAGAGGTTCTGCTGCTAAATCATTTAAATCATT
TTAATATTTTCCCTTGATTAATGTGCTAGAGGAAGCCCATTCCTTTAACAGTACTTATAA
GCCAGCTCATTTCAAGGCTAAAGAAAAGGCTGTCTGTCAATCTATGTTGTCTTTGGCTCT
TCAGATGCTGTAGAAGCAGAAGACATCTCAAATGGACCATCCACAAGTATTAAACTCATT
ATTATGATTTTTACACTTAAGGTGTCTGCCACACGTGGGCACACACACAGACACATACAT
TAATTCAGTTGTCTGTTTTGACCATTTTCTGGTAGCTGGTTCCCTTCATGTCAGCCCTCC
ATCTTACAAAATCTTTCCATCAGCCCCCCTCTGAGTACACAATGGCTTTACCTCTCCCCA
CATCATTGTCACAGCATACACACACACACACACTCAAGCTGGTGTTGCCAGCTCGCTCAT
TGGCTCATCGGTCTTTGTCATGCTGTCACAGTGACTTTTGACATTTTCATGCAGCTTTCC
AAAATGTCAGCTAATTATCCTCACACCATGCCGCATATCCACTCTTTCACCTCTATATTT
CACCCTCATTGTCACAATAGTATTTCATTTTGTTGCCATGCTCATTCATTAAGACATCTT
TTTGGTGATAATATATATCATTTTGACAATATTTTCTTCCTTCTTTTAAAGGCTGTGATA
ATAAACAGGCTGCAAGTGAAGAGAGGACAGCAGCGAACACAACTGGTTAATCCAATGGCT
GCCACGATGACCTTACAGTAGAGTCTTGTCTTCATTATTTCTCTGAGTTGATGCATTTTG
CCACTATTTGCAGCTGTTAACTGCTATGTGCTATGGATGTAAAGAGACATAAAATATGAC
CAAACAAGAATCCCAATGCAGTATTTGTGATCCAAAAGGCTTTTCATTGGGGCCACATTA
AAACGCTGAGATTTGGAATTTTGTGAAAATAAACACTGAACTATACAGCGGTTAGGTAAT
GAGATCGGTCACTTACTGTTTACATAAAAGACAACAGCCTTAAAAGCTAACTTGTTTTAT
TTTCATGCAATTAAATAAAGATCAAACATCTCAAATGAGACTAAGTACTATAACAGTATT
GCGTTCATTTATTTAGCAAAAACTAAACGTCACGGGAAGCTGTTCATTGTGAATTGTGCC
TTTCAAGTAACTTTAGTGGGTTTAATGTGCAGTGCAGCATCCACCTTATATCCTGACATT
ACATCCAAATGCAAACATCTTGTAAACATGGTCCGATGTATTTCTTTTTGGGGCAAATTT
TAACTCATTAAAAAAAATCTGCAAATTAACAATAGGTTTGCAGTCTACATTTGGTGAACA
TATAAAAATATATCACACACTATAAATGTTTTTTTTTTCTTTATTAGATTTTTAGGCTAT
GCATACCACTGCAGCTGGTGTCAATATTGTGATGGCATTATGTATTTTCCTTTCATTTTT
GCTAACTGTACATATATTTAAAAAAAAAAGTTGATCCCACCATTAAATCTACTTTATCCA
AAGTTGCTGTTCGTGTTTTATTTTTTTAATATATTGTGGAAAGTATAATTACCAAAACAA
AGCACTCAAATATGTTAAAAGAAAAGTTTCAAATTTAGGCTAATTGTTATTAAAACATAA
GCTAAAAATAATAAAATAAAAGTTCTTTTATCTTTTATTAGGGTAACTTTGAGCCAGGCA
ATGTTGTGTTGCTGTAGTTGCACTTGGAGGGAAACAGTAAATTAAAGGTACACTCCATTG
TTGAGATTTTGTTGCCAGACTTCACAGCTCATTAAAGGGGATGTTGAAGCCGCCAGTGTG
CAGAAGGAGGACCCTTTGAGATCTGGTTAGTTTCCTTCTTGCATTCTAAGTCACACATTT
TTTATAAAGGTGAGCAGAGGTTGGATACATTTTTTTAAACACAATATGCTTAATTACTCG
CGATACTTCGACAGTTTTATTCGCCTGGACCGATGTTAGAAGTCAAATATGTGTCACTTT
TCGTCAGGCTTTCTCGCAGGGCAGCCGTTTGTAGCCCCGGTGCATGCTGGTGCCTTCCCC
GCTCTTCTGTCGGGATCCGCCGCTAACGTGAATCTGGTAAGGATAAAATGGTCAGAGCAA
TTAAAGGGGAAATGTTGCAAGAATATACCTCCGCTTTGGTCCTAAAATCACATCTAGAGC
AGTTGTAAACACTTCTATTGCACCGCAGCGTTACAAAGTTTGCACACGTAGCAGGTGCAG
CGCGGTTTTATTCGCGTTGACGCTGATGTTGCACACATCGCATGGCGAGGGACAGGAAAG
GGTTAATTTTTTCCGCCGCCGACATTTTTGTTCGGCGGTCTACGGCAACTTCTTAACTTA
CATGTGCTACGAGCTGACACTGCGACTCAACGCTACGCGTCACGTTTAGGTCGCAGTGTG
CATCTTATCTGTTTTTAGATGTGCGGCAGGTCTTGGAGTGGGCTGCTCATCGGCTCTTTG
TTACACAGAGCTGTTCAATGGCTCCTGCATGTAGCAGCGTTTGCTAGCAAGAGCTAGCAG
CAGCAGCAGCAGCCAAAACTGCATTTTCAGCAAAACAAACAGACGTAGAGGGTGTAGCTG
TCATTATCAACGCACGTGTCTTAAAGCTGAGCTACCGACAGTGTGTTATGCCGCTCACAT
CACACGGAATCACTCACACATCATTACTTTTATTGTTAGCCTGTGCCCAAGGGTTGAATG
AACTTGGGATCATTGCTTGTCTTGAACACTACCCCACTATACCAGTAACGGGCCCCCTTC
AGCAGCTCACGCCGGTTTATGTTAAAAACCAAGATTATAAGTAACACCCAACTTGCACGG
CGTTTCAGTTTTATCAACTATATGGAACTTATTTTTAGGAACACAAAAGTTTATTACATT
TTCAGTGATTGGAGAGTATGGGGGGAAAAGCCATTTAGGTGATGCCACATTCATTATTGT
GCATTTCAATTTTAAAAGTATCCGACACCCCGTTGCCTTCAAAAAAAAGAGAATAAAATA
ATTATAAAAACTAGTATTTAACAAATTAAAAACATTTAATAACAGCTGTGCATTAAAATC
ACCATGCAGTTTTTATTATTTATTTGCAAACTTGTTTCAATCACAAAATACAACACGCCT
GCAATAATATCACACTGATCTTTGAGTCATGTTTATAGTGGTAATTTCTAATGTACTTAG
GTGTTCCTAATATTTTGTCAACAGAGCTCCGGGACAATATTAAATGTCACTTCACCGCGG
AAGATTTCTATCATTGCAGCAAAAGAGATGCCATTGCATTATTTTGGTTGATTTATTCTT
TCCAGCGTTGCTCCTACAGATGTTGTACTTGGCTCCGATTCACTTGAAATGTTGCACTGT
TGTGTTGTGTCATTTGTGCAACTTAACATTTGCATGTATTTTCTTGACACACCCAGACAC
TGTTTGTAATCACCAGTTTTATTTATTTTTCATAATCATTGATGTGGTTCTAGTGGTGCG
GACCCAGAGCTTCTTCAGAT
Chart Advanced