SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001892_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Promoter IDSPR00001892
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001827_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001892_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Tilapia (Oreochromis niloticus) Full length # Forward
CTCGTGATCTCTTTTCTGCTTTTAGTCATCATTTGCTTCTGTAAATTTATCAGCTGGATC
TTCATGGTTGGTTTGCGTTTGCGCCCACTTGTGCGGACCTTGACTGGAGTAATGACATCA
TTGTCAGGTTCAGAGATGAGACCCTGAGGCTCTCTGCTCTTATGTTGCTCACCCTCTGGG
CTGCAGTGATCATTTGCCTGCACCTGGCAGTGCAGTTCAGAGAGTTCAACATTAGCCTCA
CTGATGTTGGCCTCAGCCATCGCAAAGTCTTTCCCATCTTTGCAGCGGTCTGCAAGCACG
TTTGCAGTCTGCCCATCGGTGTGAGTTTTTAGATGCCTCGCAAGCGACAGCTCCCAGTTA
AATGTCTTGTTGCATTGCTGGCAGGTGTAAATGCAGTCTTTCATGTGCGTTTGCTTGTGC
TCAGTGCGTGCTGACAGGGAGTTGAAGGTCTTTCCGCAGATGAGGCAGTTGTACTTGCGC
CCAGTTTTGTGTGTGTGCCGGTGTCTGTCGAGGGACTGCCTGAAGGAGAAGCAGCGGCCA
CAGTCCCTGCAACGGTGAGGGCGCTCCCCGGTGTGGATGACTCTGTGGGCAATTAGTGAA
GACGCAAACTTGAATTTCTTTTCGCAGTCGGGGCAGTCATGCGGCCCCGCAGGCATTACA
GGCTGAGGGGATGCCGAGTCAACCATGTTCACTTCTGAATGGGCGTTTGATTTTTCTTGT
CTTTCTTTCTCATCTTCTTCACCTGACCCCTCTTCCTTGGCTCTCTCTTCAGCAAGTGTG
ACCAATGAATCTTCAGCCACTGCATTAGCACCTCTTCCTTCAAAGCAGTGTTCTCCCATC
AGCACTTCAGTATCAGTGCTTGGACCCAATTCAACCTCTGCATAATCAGTCACTGTGATT
ATTTCAACTGCAATGTGATCCACAAATGTCACAGTGTGTGCGTCTTCACTGGTACCCTGT
GGTGGATCTGACTTGTTGGCCTGTTCTATACATTTTGATCCTCTGCTGGGGAGGACTGCA
GAGAGTGAGGAAACGATGTTGTCGCCCATACTTGAAGGTGGAACTGCACAAACAGAATGA
GGTAGATTCATCAGTTACTTCCACAGGTTTGCACAAAAAAGGAAAATACAATTGATGCGA
TTGCAGGAAGTGACTAACCATATTGCTCTAAATATGCGAGGTTTTTGTGGTGTTGGAGCA
GATTTTTCAGATCTGCAGGTTCACAGACTGCATGAACACAATCCTCCAATGCAGAGGATT
CAGCTCTGAGCCAGGACACAGTCTGTGGCAAAGGTAATAAATATGCAGTATACTTGAATT
AATTACCTAAACACAGGTTTGAACTTCAAAAATAGCTTAAAAACGACCTGAACCATTGGT
ATTATCAAGTAAAATGTGCCTTTACTGTAGTTCAGGCATTATTAATGAAAAGGCTCAAGT
CCCCAGAAGTGCAGACAGTTACCAGTTCCTAAACAGTGTTACTAATGCACATGGCATTAA
TAGCAGTGACATAATTTAGTATGTATTAATCACAAACTTTATCTTTTTCCATATGTCATA
ACAGGTGACACTGCAATAAGTAGGTTTTAAAATATTAGGTCACAGCTTTCATTTAAGTGC
ATTAATTTGTTACATGTTGACTCGACCTTTTGCAGTTTTCTACACATCTATAATACAGAC
CCATACAGGTTCCTAAAATTACAACAGGTGTAAGATTCATCACTGGTTTAGGACTAAGAA
TGCAGAAGCATTTTAATAATACTAATACTACTAGTATTATTATTATTATTATTATTGTTA
TTATTATTCATAATTATATATTATAATAATATAATTTTAATAAAAATACATTTTTAACAT
TCATTTAACATATAATTTATTAGCAGTAATTTCTTGTGTCATTGGGCTTGACACTTTACT
AAAACTGAGTGCTCAGAGTAAAGTATGCTGGCACAGTGAGCAGTGGAGAGCTAAACAAAG
ACACCAATTTAGACAAATAGAAGGATACAAGGATCTCTTATGCATTTACCTTTAAGAGTT
AGACAAAAAACACATTTTGTGAACTGATGAGCATGAGCATGAGCATGAGCATGAGCAAAG
ACTACTGGAATAAATGCTACATGGACAGAAAGTTGTAGGTTTTCAACCAGTTTTGTTGTT
TGGATTTTATGTACATAACCTTTTTATTGTTATTTTATATTAAAAATATTTTTTTAAAAA
TCTTTAAAAATCTGAAATGACAGGAAAACCCACACAAAAACAAATGAAATTAGTTAATTC
ACTGTACATGGACAAATCATGCTCATTACAAGTCTGTCATCATACAAAGTTGCCATTTTT
GCTGGCTATCCTTCCGTGCTTCAAATAGACTAAATTTTATTATTACAGATGGTCTTAATG
TGCACACACTTTTATATAGTTCTTTTCCTTTCAGAAACACTCTGCTATGATAGCTACAGC
AGTTAACACTATTATGCATTTAACTCTTCATGTTTTTCCAATATTAGTTCATATTAATTG
TATCTTCTTGGGTAAAAGGAGTTAAGTGTCACACTGTATTTATCAGTACAACACCTCTCA
CCTGCTCAATGTCAGGAACAGGCAGCAGTTGTGCCAGTCGACAGTAGAACTCCCAAAACA
GCGTCAGCAGATCACGGTCATACTGAGGTCCAAACTCTGCAGGAAAGACTTTCTGTGATA
AAAACAGTGTTACTGGAACCTAAATAAAAACCACACCCAGGCCTTGCAGCAGTGTAATAT
ATTCTTTTAACATTTTAACCCCTAAAAATAATACATTTTGGATATCTTGTTTTTGTCATC
ATTATTATCTTTTATGGCATTTTTATTCATGCATTCTTAATTACAGTAAACAATAAAGAA
CATGGTGTATTGTAGCTTGATAACAATAATGACAACAGAAATCTGCTTCATATGAAGCTT
ACTGTCACTACAAATAACACGATTGGGTTCATTTGGTTTAATGGGTTGTAAATTATGCTG
CCTCACCGTGAAAAAGTCTTGTCTCTCTTCAGGGTCTTTGAGGAGAGTCTGAATCAACTC
AAGAAAGGTAACTATAACATCTTCCTCTTTTGAGGCTTCTATCTGCAACACATGTATAAA
AATTATGTTTCTCATAAAGCCATGACTAAGCAGATTAAGGGTCAAACACAGGTGTGCTGA
ATATGAAAACTTTATCTGTGTTATAAACACTCACATCTGCCAGGGTGGCGTGTGGTGATT
TAACCTTGTCCAAGTAAGGCATGATAAACTCCGGTTTCACAAGGTCTTCATTTCGACACA
ATTCAAGAATATACTGTTGAGGGAAAGAAAAAAAGTAGAAAAGCCCTTTGTTCACAGCAC
AGTTCACTAATCATGTAGTTTATCTGCATCCATGAGGGTGATGAGCCTAAAGCCTTATTT
AAAAAAAAAACAAAAAAAACCAACAAAAAACTCGCGTTAGTACTCACTCTAACTCTTAAC
CCTAGGTTCAGCTGAGTCCTCTGTTTGCACATTAGCAGCTCAGGGACCATATCCACCACC
AATGAGACAAACTCTGCCACCTTCCAGTAGTTCATCACGTCCTGTTTCTTTAGCACCTGC
CACATTGATGCTGTCATAAGCTGCAAAGGAGATACCAGAAGGCGCAGTGATGCCAGCGGT
AATGAGTCACCTGTAAAGAAAAAGAAACCACTGAAAGCTGTACTTCCACTTATGCTTAAC
CAAAAGCCCATCATTTCAGACAATCCAGTTTCAAAAAAAGGTTGCATGCCCTGTAAAATG
TAATTAATAACAATGAAATGTAATCATGTATGCAAATAATTTACATCTTACATTTAATTG
AAAATGGGACAAAAATTGTATATAGACACCATATCGGAAAATCACATTAGCTTGTGATGT
TAATGATTACATTACACTAAAATATATATGATTTTCGGATGTAAACCTTAAGTTACCATT
TACAGTTACTTCCGACACATTATGCGATTTTTTTTATATTGAATAATAATAAAAAAAAAC
CCTGTATAATCAATAAAACAAATATGGTGTTAGATAATAATATTCTGTAGTTCACAGTGA
GCAAAAGCGTTTTCGTTCATTAGCTACTGGAGCTTTTTGTTTTTGAATGCAACCTCCAAG
TGAATGTTCAACAACAACAATGTTTCTCAAACTCCGTTACCTTCATTTTTCCCATGTTTG
CTACCTAGTCTGTACATTCAGCATTCACGGTCATAAGACATGCGTGTAAAATTATTTGTC
AAAGTAACCTTAGCACTCAGGAATAAGACAATAAGCTAGCATACAGAGCTAATTTCCAAT
GTATGTTGTATACTTAAGCTAATTTTGCCAGGAACGAATCCCTAAATGTCTGCGTTAACC
CAATTGTGACCTGCTCCTAATTGTTTAGGAAATGTGTTTTAGTGTGTTAAGTGTTCCTCC
ACAAACCGACCTCTGGAGGTGGCCATTAAAACCCCTGAATCCATCTTCTTCTCGGGTCGG
TGCTGAAAAGTTTGAGTAGCTGCTGTTAGCTGTTAGCCTGACAACTACCCACACAGCCAG
AGGAAGACACAGCTCTGAACGCAGTCGTTATCCAACTGGAAGCTCTTTTCTAAATTAAGC
GAGCTGGTAGAGGAAAAACGTATGAATATTAAAAACACACATATTTACACGATACATGTT
ACATTTTTGTTGCTAAGGGCTTCTTCTTTATGTAGTTTTTTTTACGTTACGTTACATTCT
TCGTCTTTTTTTACCGCCATCTGCCGGAGATTCTTTGTATCACGTCTTATGTTCCCCCAA
ATAAACTTATTTTGCCCCCCACTCCTTTTTTCGAAATAGCACTGATGACAAATTATTATA
TTTATAAACTTAATATTTTCATACACATAATTTAGACCTCATAGAACGGAATCCTTGGGC
CTATTTCACACTCGTTGACATTACAAAGTCCCAGCTGTGATTATGAATGACTGGCTCATA
TTAAGCCGCACAACGTATTC
Chart Advanced