SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001916_2.0
Identity
PromotertRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Promoter IDSPR00001916
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001851_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00001916_2.0 # Promoter # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Tilapia (Oreochromis niloticus) Full length # Reverse
TGGCGCTGCCGCGGTGAAGATCCAACCACGAATGCTGTTCACGGTCCAACTGCTAAACCG
CACCGAAGCTTCCTGTACGCATTAGCCTAACGCGGAGCACGCGCCACCACTACGTCCTAC
GTCACTCTTCTTCTTCTTGTAAGTATTATTGGCGGTTGGCAAACAACTTCAGGTGCATTA
CCGCCCCCTTCTGGACTGGAGAGTGGATCGGAACAGCTTTACACCTATATTCTCTTAAAA
ACACCTGTTGCTCTTAAAAACCCAAATATCGCCCTGTAAACTACGTCACCTGGACTCCTC
TGTAATATTTATTTGACACTTAATTGAATTTTACTTTTCTGTAACTCAAATTGGAGTATT
TATTGACCACATTCTAACATTACACGTTCAAATGTTTCACACTTCCCTCTCTCATGCTTA
TTCATCTTTTTTAGAGTGTTATTTAAACCTGTATGACCAAATTTTACTCTTGAGATTACA
TCGTCTTCTCTTTTACTGCTATGACTTCTACAGTGTCCAGCTGCTCTCTGTATACAATAA
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TTTACTGTATTTTACATCCATATCTACATGACTTCTTCTCGTTGCACCTTGTGCAAATTT
AGCGGCCCGTTGGTTTCCATCTACACCGATATGTTCAGGAATCCATAAAAATGTATTTCC
ATTCCTCTGTGTTTGATTCTACAGATTAAACTAATTGCTACATTAAAAAACAATATCGTG
TCTAGAATCCAAACACATATGACATATACTCAATGGTGCTCTACTAGAGTCCGAGCAAAT
CAAATACTTCCTACTGGTGCCTCCTCCACCCAGTTTGCAGTGATTAAAACTGCTACAGTT
CTTCAGTATGAACTGTTAAATCATCAGTAATTCTTTTATTAATCACAAAGCTTCTTTCTG
GAATAACAAACAAAACACCCGCTTTATTATCTAACAATTATGATGCATCAGTATATTTTC
CCACATGTTCTGAATAATTTTCCCTTATATGATCATATACCTGGTTCTTCCTTTGTGTAA
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GCTGGACTAATAAGTTTGTTAATTCCTGTCTTATTTATTTTTCCCCTATAATCCAACCAA
AACTTCTTATTCGTTCACTTTTTTACTTTTTCTTAAACACGGTTTGATTATCTCCGAAAG
TTGAATCTGTTCATCTGGACGTAGCATTTGGTGGGAGAAACGTTTCGTCACTCATCCAAG
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GCATTGTCAGTCTCCGTCGGATCCGCTCCTCTTCAGATTTTAGCATGTCGATGATAAAAT
TTGTCTGCCTCACCCGTTCATTAAGCAACTGATGCTGTGCCTTCTGGAGGATTTTTGTTG
CCCGGAAGCCTTTAACTGAAGAGCTCATTTGCAGACTTTTAGGAGTAATCCTGTTTTGTC
GGCATCTGAGGCTGAATCTCAGGTGGTTCCTGTAGTCCGTCATCTTACGTGCTGTTTGCT
CATACTGACGTACAAGCTTTAGGCAGTCCTTGCCAAAGTGGGTTAAAACGTCTTGATTCA
ACTTTTGGAGATTTACTTTCCTGGATGATTGAGAATGCATCAAGAAGGTTTAATTATATT
CTGAGCTTTATGATTTTCACTGTGTCCCTTTAACTTTGCCCAATAAGTTAAAGCTATTTC
ATGTCTTCTGATTTCTAGAGGTTGTTCACCCATTTCAACTTGCAGTGTGGACACTGGTGT
AGTTTTAATGGCCCCACAACACAACCTCAGCGCTTGATACTGAATTTTATCCAAGTTATT
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GCAAACAATGATTGATCTATATTATTAAATACCTCATTAGGGTTCAGGGTTAGCCTAACC
CTACAACAGGAGATGCTGGACTAGAGCAGCTCAGGTATTGAAGGACCCGTCCCTCATGGC
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GATCAATAGTGTGCCAGTGATCCCTCAGAATCACATGCAAAGGACGTTATTTTGTTATTG
ACTGTTATTTTTATCAGATTGTGTGAAAATGGCCTGATATTGTTTATAAAGAGATCCATA
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CACTACATGTAATTCTGTTCAAACACAGCGTTCCCACAGAGTCATCGGCCTTCAAGGCCC
ATGGACTACATTTCTGTTGCTGGTGGTTCCAAACGTAGAACCTTTTTAGAGGCTGCTGAT
GTCATCTTCAATCATTTGTG
Chart Advanced