SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00001953_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesOrnithorhynchus anatinus (Platypus)
Promoter IDSPR00001953
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001888_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00001953_2.0 # Promoter # Selenoprotein U1 (SelU1) # Platypus (Ornithorhynchus anatinus) Full length # Forward
GAGTTCACCTCCTCCAGGAGGCCTTCCCAGACTGAGCCCTCCCTTTCCCTCTGCTCTTCC
TCCCCTCCCCATCCCCCCTTCTCCTGCTCTCTGCTCTTCCCTCTTTCCCTCCCCAGAGCA
CTTGTGCCTATTTGTACATATTATCTATTACTCTATTTTATTAATCATTTGTATATATTT
ATGATTGTATTTATCTTGATGGTATTGATGCCTGACTACTTGTCTGTCTCCCCCGTGTGA
GCCCGTCGTTGGGCAGGCATTGTCCCTTTCTGTTGCCGAATTGCACTTAGTACAGTGCTC
TGCACATAGAAGCGCTCAATAAATAAGATTGAATGAATGAATACCCACAGCTCTGGAGGT
TGAGAAGGCCTCACGCTGCCTGTGCTCTTCACCCTCCTGGGTGGAGAAGGAGGGAGCTGA
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CCCCACATGGGGCGGGGACTGTGTCCAACTCGATTTGCCTGTGTCCTCCCGAGAGCTTTA
GTATAGTGCCTGGCATGTAGTAAGCGCTTAACAAATGCCATCATTATTATCATCATTATT
AAGCTCTCTGGAGCTCGCACCCAGAAAAATGTGCACTCTCCCATGTGCGGCTGCGACGAA
GAAAGAAGCATTACTGCCACGGCTGCCAAATGTGCAGTGGTCCTTTCCCAACCAATCGCA
TCTGCTCTTAGCAACGCTCTGTGGGACTCTTAATGACACAGAGAAAGTGTGTTTTTTACG
AAGCTTTGGGAAGAAGCCTGGCATTTCCCCCTCCCCCCCTTCCCATCTTGAGAGGCTCCG
AAGTGTGATTAGCTGCCAGGAACTGAAAGGAGCATAAAGGTTCCTGGGTTGGGGTTGTGC
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CCAGCTGCGCTCAGAAGGGATTTCTCCCCTTGGCATTCGGAGCCACTCTCCGAGTCTGGG
CCGGCAGCAGCGGGCGGAAGATCGGAGACCCCGCGTCCCTTAGACGTCGCCAACGGTGAG
TGGCTTCTCTCCAGGGAGGAAGAGGCTTTGACTTTGAATTCTTCAAAATGGATCGGCTGA
AGTCGCTTAGCTGGTCTGGCCCTCTGAGCGAGAGACAGCAAAGAAATAGGCTTTCCTCTG
GTCCTGGGCCAGTGAGAAAAATTCAAGTAGGGAGTAGATAGTATAATAATAATAGTATTT
GTTAAGTGCTAACTATGTGCCAGGCACTCTTCTAAGCGCTGTGCTTCTATGTTGCTTTTT
TCCCTCTTCAGAAATTCTGCAATCTATCTATATGATATATCTTGTGTAATCTCTCACGCT
GCACCCAGAAAGGGCAGTTCTTTCGTCACTTAAGCATCCCAGGGGTTCTGGGGGAATAGT
TATGCTTTCTTCAGCGGGCGGTGTCCATTTTAAAGGTCGTCTCTACAGCACATCCTGCTC
CAGCCCTACAACCACTGAGCCAACATTGTGTCTCTTGTACCTTCATTCAGTCGTATTTAC
TGAGCGCTTACTAAGAGCACTTGGGGGAGTACAATATAACAAAAAGCAGACACATTCATC
GCCCGCAATGAGCTTACGGTCTAGAGCCGAAACCATCCTTTAAAGTGCATTTCGTAACAT
GCTATTTTGTGGTTTGATCCGAACGGAATGGAACGATCGACTTTTCTTAGTCTGATATGA
ATAAATGTGGTATTTATTCAAATTCGTTAGATGCTACTGCGTGCCAAGAGCTATACTAAG
TGCTGGCGTAGATGCGGGATAATCAGGCCTAACACAGTACCTGATTCTTGTGTGTCTCAA
TCTAAATGGGAGAGAGAACCGATATCAATCCCCATTTTACAGATGAGGAACCTGAGGTCA
GTCTGTCAATCAGTCATATTTTTTGAGTGCTTAATACTGGGTGCAGAACACTGTACTAAG
TACTTCGGAGAGTATAACATTACAATACACAGACACATTCCCTGACCACAACAAACTCAC
AGTCTAGAGGAGAGGGTGATATACATTAATAAATAAATTACGGGTATGTACTTAAGTGCT
GTGAGGCTGGGAGGGGAGATGAATAAAGGGGGCAAGTCTGGACACAGAAGGGAGTGGAAG
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AAAAGTGAAGTGACTCGCCCAAGATCACACAGCAGGCAAGTGTGTGTGCCACCCAGTCCT
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AATTGACATTAGTAAAATGGAGAGTCAATATCTGTTCTCCCTCCCCCTTAGACTGCGAGC
CCCATGTGGGATAGGGACCATGTCCAACTTGATTATCTTGTGTCTATCTCAGCGCTGTCA
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TGTACTAAGCCACTATGATTATTATCATTGTCTCCTTTGCCAACCAAATCAAAAACCGTC
TGTGAACCTGGAATGCCGCACTGCAGAGATCTGGCGAGAGGCTGTCGTTGGAATCTCCTT
GTGAACCGCAGGTTAAGATATTTGCGTTAGAGTACCGGGTGCATGTGGTGAAGTCCCAAG
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GAGCCGTATCCATCTCTTATTTAGGATGTCTGCGGTGTCACCCCCGTTTATGTTGTAATT
GGGAATGCAGCCCTGAGGACTGTTGCGTTAGTCTGAGAGGAGGAGGTGGAGAGGGAGAAG
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ACCCAGCCTGCCGCTGAAGTTGCCCCCTCTGTGCACCAGTGACTCTGAGGAATGTGTCCT
AATATCTGTCTCCCCCTCTC
Chart Advanced