SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002039_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein J (SelJ)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Promoter IDSPR00002039
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00001974_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002039_2.0 # Promoter # Selenoprotein J (SelJ) # Medaka (Oryzias latipes) Full length # Forward
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACAAAAACCAAACGAAAACTCACT
GTGGCGTGGCGAGGGACAAGGAACGAGGAACAGGGCATGACATGGCATGAACACCAGAAC
AGGAATACTAATGGACCAACACAGGAGGAAGGCAGAGACAAGACTTAAATACAGACAGGG
CAGACAAGACACAGGTGGACACGATCAGGGCTGATGGGGACCAAAGGAAGCAAAACTCAA
GAAAACAGACAAGACAGGAGACTTTCAAAATAAAACAGGAAACAGAAACAAGACAGAACA
AGGACCAAAAACAAGACAACAAATTCAAATCATGACACTAATACTGTCTAGATGAAAATA
GTTAAGGTATGTCAAGACTGGATGTTACGGTAAAAATGGCAAAAGGAAGTCTGTGGTCAT
TGGTTGGTATGACAATACTGGCTTTTTTATGTAAAAGCAATAAACTATCAAAGTGGAAGC
CATTAAGCTTCTTCAATTCAAAATGTTGATGGACAATTTGAGCTAATTATGTGTATTTGT
TGACTGTATACCTGTTGAATTGCCGGAAAGCCCTGATAATGGTTTACACAGTGAACTTCA
TAAGGTTTGGACGGACTCTTTGTCCTGCTTCAGCTTTTGTCATGCCATGGAAAATGACAT
GGTCAATGACTGTTGCTCGCATCTCGTCCGTAATGATGGTGCGAGTTTGTCTTGCTCTCC
ATCCTGGACCTCCTCCTCTCCCTTGTTGGCCTGCTCCTCTTCCTCCTCTGATTTTAACTC
CTCTTTCTTGTTGGCCTGCTCCTCTTCCTCCATGGCCAGCTCTTCTCCCTCCTCTGATTC
ATATTCCTCTTCCCCTGACTGTTCCTTCATCCATTGTGTTTCTTTGAAATCTTGTTTAGA
ATTAGCAACAAGTGTCTTCAATTTTGAGTCTTTGTGTGTGTCATGGTTTGAGTTTCTTTT
GTATTGGTTTTTGCTTTCTGTCTTGTTCTGTCATGGTTAAGTTCTGTTTCCTGTTTTATT
TTGAAAGGTTTCCTGTCTTGTCTTGTTTCTTGAGTTTTACTTCCTTTGGTCCCCATCTGC
CCTGATTGTGTTCACCTGTGTCGTGTCTGCCCTGTCTGTTTATAAGTTCTGTCTCTGCCT
TCCTCTTGTGCTGGTCCATTAACTTCTGGTCGTGTGTTTAACGTCTTCATGTGGCCTCGT
CCGTTCATGCCATGTTTCATGCCCCGCCACAGTGAGTTTTTGTTTTGTCATCCTGCTCTG
CAGAGCTTTTTGTTATAATTAAACCCCTTGCCCTTGAACCCGTTTGCCTCCCGTCTCTGC
GCCTGGGTCCTACCGGCTCTCGAGCCTCCCGCACATGACAGTGTGTTAAGAATGTGTGTT
CATTGTGTTCAAATCTTGCTGACTGTGGCTAGTATTTTGCATCACATGAGCTTTCATTTG
AGAATATGAACAGATTTCTTTTGCAACTTCTCTTTTAGCAAAGAAAAACATGTTAATATT
TATGAGAACAGAGGATTGTGTTCTGTGAAGTGTGTCTTCATGTGAAATGTGTTTAAGATA
TTGGAAAAAGGTGGTAAAATTTAGTAAATGTGTTTAGACAACTGGTCATTTGGTTAAGGG
GATTGACTTTTTGAGAAAAACTGTAATCATTTTATGGCTTTATTTTCATTTCCTAAATCA
CTATAGTATATAAGTATAAAACATATAAAACATGTTTTTTTGTTGTAATGCTGTATTTGG
AAATTTGAAGTTTATTTTTCTAATTTTGAAATCTCTCTTTGAAACTCCGTCAGGATCATT
ATGCAACAGTTTTTCGACCCGTAGTGGTTGAATGCTTATATCACCCTCTCTGAAGGACCC
CCTCCCCACCAGAAAACAGTATTTCAGACAACATTTCACGTGGTGGCGTGAGAGTTAAAG
ACTGGCCACTGAGGTAAGAGTTTAAACACCTGATTTCTGAGATCAAACTAAAAAAATTCT
TTGTTTTTTTGTGTTTCATGAATAGCTTTTGTTTTAAAGTATATCAAAGTCAGTAACTAA
CATTTATCCTAATAATTTCTACATTTTTGTAGTTTAAGTAGTGTAAAATTAGTTTAATCT
GTTGTTCTGATGGACATAAAATGTAACAGATCTCTCGTTTATGTTAGTTAAAGCTAAATT
TAGCCAAATTTAGTGTCATCAAGTTTTTTAGGGACAGTCTTGTCAAGGCAGCAATTTATT
TTTGTTTTCTTACAAAATGTCAGCTGTCATTGCAACTGTCTTGTATCTTATCCATGTTTT
CCTCTAATACAGTGACAAAA
Chart Advanced