SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002168_2.0
Identity
PromoterIodothyronine deiodinase 1 (DI1)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Promoter IDSPR00002168
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002103_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002168_2.0 # Promoter # Iodothyronine deiodinase 1 (DI1) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) Full length # Forward
CCCTTAAAGTTACGGTCTGACGGATTGAGGATATCTAATTCAGAAATAACTTTACTTTTA
AAAACAAGTTGGACACCATGCCCATTTCAGTGTCTGATCCTATGAGAAAATGTTCCCACC
TCTGCACCCACAGGGCCAATTCTGCTCAGCCTCAGCTTCAAATATGCAGTATAACCAGTG
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AGCTGCCTGCCCCCACTCTTCACCCATGCTGATGCCTTTGTACCAGAGACAGCAGCACAT
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GAATGACCTTGGATTGGCTTTGGTGCAAGTGAGATCAGCTATGCTGGGATGTAGCCAGTA
GATGGCGCTGTTTCTTTCTGGGTTAAGTAAAGCTGTTCCCTACTGTTCCCCCCGCCCTCC
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TTCCCCTCCCCCCCATAGGTAGAGCCATATTGGCGACGCCAGCCAATCAGACGCTCAACT
GCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCGCGCGCGCGCGCGCTCTCTCTTAAAG
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CAGTATGCCGGCTTGCACCATTCCTCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCGGCAAGGGGATAGT
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AAAAATCCCACTCAGACATTCTGCAGATGCTTCTGCGCACCTCAGAGAACAACTATTTTA
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GTGCTTCACTACCCTCCTAGTGAAATAGTTTTTCCTAATATCCAACCTGGAGCTCTCCCA
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ATTCACTGTAACCCCCAGGTTGTGAAGGCTAGGATTATACCAGAGTTTGATGTCCCTGTG
TCTCCTCAGGTTTGTCCCATGGTGGTTGCATTTCACGGTCTTTTCTGGCTCTGGCTGTCA
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CTGGGTGTGCAGGTGCAGCGTGAGGGGCACTGCTCACCAAAAATCTCCAATCAGCTGCAT
GAGGATGCACCGAGACCTGAGTGGAGTACCCACAGGGACACTACTCAATGAAGAATTTGT
ACTTAATTTTAAGCACAAGTGGTCCCAGTGACATCAATTAATAAAATAAAGCAAGTCCTT
TTTTTCCAGGAATAGGTCCCAAATTATTATTATGTTAATGCTGCCAGAAAAGTATCTAGT
ATGTAGTCAGTCTTCTCATTTGTAATACATGCAATACATTTTGGTAATAAGTCTTAGATG
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TTTCAAGATACGCAGTATAGTGGACCATATTTTATTCTCAGTCACATCCCATGCACTGAA
GTGAGTGGAACTGTGAGAGAGTAGAATTTGGCCAAACATGTGATTGACTATTCTTTAACC
TCATTTCCCCTCCTCCTTTACCTTTGCTCCAGCTCCATTACACTGTTTTCTTTGGAAGCA
GTCTGTCTGCGTCTGACACA
Chart Advanced