SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002288_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein W (SelW)
SpeciesPongo abelii (Orangutan)
Promoter IDSPR00002288
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002223_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002288_2.0 # Promoter # Selenoprotein W (SelW) # Orangutan (Pongo abelii) Full length # Forward
CAGGAGGGTCCCGGGGATGGCCCGAGGTGAGGGGCTGCGCCGCAGACGAACGCCTTGCGC
TGCTGGCTGCTTGTACCCATCTCCGTGGTTCAGTTGGCCCGATTCCCTGATGCATTTCTC
TGGTCGGTCTCTTTTACCCCGGTAGCCGGCTTTGGGTTCCCCTTTGTGATGGGTAGGGGA
AAACAAGATCTGAGAATTTAAAGGGTCTGAGTTTTTCTTCTTTCTTTCCTCCCACAGCTC
GTCCGTAGATTGGAATCGCCCTGAAGATGTAGACCCTCGAGGGATTTATGTCATATCTGC
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GCGCTGGGCAGAGGCAGCACCTGCTTTTTCCCAACCCTTCCTCGATTCTGTCTGTGAAAT
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GGGAGGCAGGGGAGGCAGAGGGGCCAGCTTCTCTAATGCTTCCTACTCATTTTGTTTCTA
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GGTGGTGCCCAGTCTCTGCCGCAGAGGCTTTGGAGTTCAATCTTGAAGGGGTGTCTGGGA
GAACTTTACTGCTGCAAGTTGTAAATAATGGTTATTTATATCCTGTTTTTTCTCACCCCA
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TGCTTTGTATTTGGTGTTGGGGCTGAGGGGAAGAGATTTTGTCTCCTGAGGAGAATAGTA
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TAAGTTTCAAGTTTTTTGTAGAGAGGGGTTCCTGGTATGTTGTCCAGTCTGGTCTTGAAC
CCCTGGGCTCAAGCAGTCCTCTTGGTTTGGTCTCCAGAAGTGCTGCAATTACAGGCGGGG
TTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCACCTTGC
TCTCCCAAAGTGTTGGAATTACCGGCGTGAGCCACTGCTCCTGATCAGGGGCTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTAAATCAGTCTCTAACACTGGAACACTTTTCTGCTTCGCAAGTAAAAC
CATCCAGGCTGTTAGACACAGACACCCCTCTCTTGGCTTCCTTCAAATTACTGAAAACAA
GTGTCTCCACCCCCCACCGTACCAACCAACCAACCAAAGACTGGCCAGCGCATGCTGTAG
TCTCAGAACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCGAGGCTGC
AGTGAGCTGTGATTGTACCACTGTGCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACAGCCTGTCCTC
CCAAAAAATAAAAAAATTTTGTAAAAAGTACATGTCTGATGTACTCATAAAAAATAAAAG
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GGGAATACAGCAGTAAACAAGACGGACAAGGCCCCATCCTTGAGGAGCTCACAGCTTGAC
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CCAGCTCTGCCATTTAACTAGCTGTGGGCAAATGTTTAGCACTTAGTACTGTAATAAATG
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GAGGCGGGTGGGTCACTTGAGGCCAGGAGTTCGAGATGAGCCTGGCCAACATAGTGAAAC
CCCATCTCTACTGAAAACACAAACATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGCACCACAGTGTAAT
TCCAGCTACTTGGGAGGATGAGGCAGGAGAATCTCTTGAATCCAGAAGGCTGAGGTTGCA
GTGAGCTGAGATCACACCACTGCACAACAGCCTGGGCCACAGAGTGACTGTCTCCGTGGT
GCTCATCATCATTCTCCAGATGTCAGTTGTCCCCTTTTCTAGGGAGCCCTCTCTGATTGC
CGCAGACTGACTGAACCTATTCTGGGATCCCACAGCTCCTGGGCTCCCTCATCCTGGCCT
TGAACGCTCTGGGCTGTAGCTCTTTGGTGATGGGTATGTGTCCCCACTGGACAGGGAGCC
TGGTGAGGGCAGGGACCAGGGCTTTCCTGATCCCTGCTCTGTCCCCAAATTCACCCAGCA
GAGAAGTGTGCACGCAGCAGGCACTCAGTACACATATGCTGAATACCTGAGTGTCACCGA
CAGCTGCGGAGGCACTGGGGCAATCTGTGTGTTTCTCAGCCTGGCGTCGGGGGTTAAGGG
GGCGGGAGTTACTCGGCGAGGTCCGGAGGTCGCGTGCCCTTCGAGCAGTGGAACCCGGGG
GCCAGGTGGAACTCGGTGTAACAGAGCCCCCAGTGGTCCCGCCCAGTCTCAGAACCCGGT
GCGGGAGACGCTCTCCCCGCCCGAAGAGGGAAGGCGGGCGGGACTCCCCCAACCGGCTTG
CCCGGGTCCCCCTGGGCCCC
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