SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002486_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesSarcophilus harrisii (Tasmanian devil)
Promoter IDSPR00002486
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002421_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002486_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) Full length # Reverse
CCTTCGCGGCCGGGGCGGAGGCCGCTCCCGGGGACCGCTGCCCGGAGCGACCGAAGAAGC
TCCGACGGGACTGCTGCACCCCGGGCCGCGGGAGAGGGGCCGCGCCTGACGGACTCCGGG
AGCGGAGTTGGGACCGCAGCGAGAACGCTACTAAGTGCGCGTGCGCGTGCGCGCTGACAC
CCTCCCGGCCTCTCTGGGCCCGCAAGCCGGGGGCCGAGCCCGGAGGTGTCAACTCCCGGC
CTCCGCGCCTGCGCCCAGCGCGGCAGCCCTGGCGCGCCTTCCAGTTCGGACGGAGCCGGG
AAAACCAAACTGCGTAACAGGGGGGCGGGGTCGGGGGGGGGAACCCTCTTTTCCGAATCC
CCACACAGGGCCCTCAGAAATGGCCAGTTCCTGAAAATAAGAAAATAGCGACGGTTAGGC
AGCGATCCAATGATGTTATCGGTGAGGGAGAATTCGGGGCTTCGTCTTCCCAGACTTCCC
CCCCCCCGACAATCGGCCTCACTCTTGAAAGCGCCCAGCCTGGAGCATGCGCAGAAGCCG
TCTGCCCTGCAAGGCGCGAGGAGACAGCGTGGGTGGCTCCTGCAGGCCAGCAGTCACCAG
CGCGGTCTGGGAGGCGCCTGGGGTGCCGCGAGCGCGCTGCTTGTCCGCGGCCCCTGACGC
CCTCCGCCGCGATCCTGGAGGGAGGCTGGGCGGAGAGGTTTATGCTCTTAGTGCGAGGAA
ACGTACCGAGAGACAGCCAAGCGGCGAAGGCGGAGCCTGAAGCGCCCCAAACAACCTTCG
GGTTATTCTGGGCCAAGCCCTTCAAAAAAAGAAACACTAACTCCTATTCGCTGTGCGGGG
CCCAGACAAGGAACCTCCCCATCTTTGAGCTGCGCTTCTCTTGCGGTTTATCCAGCCGCT
CAATAAGTGGGTCATCTATTAAGCGCCTACTGTGTGCCTGCCTACTGTGTGCCTGCCTAC
TGTGTGCCTGCGCTGCTCGGGCTGCGGGAGAGCCCCAATCGTCCGAATCAACAGGAATAC
GTACAGCGCAGCAGCAGTGACGCTAACAGGGCTCGCGTAGTCCCCGCTCGGGGCCGGACT
TAGAACCGAGTCACTGGGAAGGAAAGGCCGGGGTCACCCAGCAAGCCCGAATCTGGGGCA
GGGCGTGAACTCGGCATCCCGGCCCCCCGGCCCCGCGTTCCCTCCGCCCGCCGCTTCGAG
GCGACGTCCCGAGACTTAGGGACCAAGGAGATTCTGGCAGACTGAGCAGCGAGCTCCGGC
CAGGGCAAGCAAAGGCGGGCGTCCAGAGGTGCAGCCCTGTGTGTCCTGGGGGGCTTCGTT
GGTTAAATGAGGAAACTGAGACAAAGAGGGGCAAAATCAGGCCGACCAGCGCGCCCGAGA
CTGAGGATTCGGAGGCAGAATCAAAAACGTCAGGTGTCCGGCCGAGTGCTTACACTCCTT
GTGTGGGCGCATCCGTGCCTGTGCTTCTGGGTCCCGGAAAGTGGAGGGAAAGGCCCTGGG
CCAGCAGGAGACTGTCAGGTGTCATATTCAAAGGTTAACTTAACTCCACTATCACTTTTC
TTTCCACTGGGCCATACTCCTTAATCAGAAAGATAAGATACAAATCTGAACCCATTATCC
TAATCCTGGAGAAGGCTCCTCTTGCATTCCTGCATCTTTATCTGCCCTGGCAGCTGCCTT
ACTAAGTGGATTGAGTCAAGAAGAACTTATCTCCCCTTAACCTTTACTAGTTATGCCACT
TCCTTACTAGCTATGCGACTTTGCTATTGGCACTAGCTGTGCGACTTCCCTACTAGCTGT
GCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGTGACTTCCTTACTAGCTGT
GTGACTTCGCTACTAGCTATGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCGCTACTAGCTAT
GCGACTTTGCTATTGGCTATGTGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTCGCTACTAGCTAT
GCGACTTTGCTATTGGTTACTAGCTATGCGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTCCTTAC
TAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTAC
TAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTCCTTAC
TAGCTATGCGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTCTTTACTAGCTATGGGACTTCCTTAC
TAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTTGCTATTGGCTATGCGACTTCCTTAC
TAGCTATGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGTGACTTCCTTAC
TAGCCGTGCGACTTCCTTACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTACTAGTTATGCCACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTTG
CTATTGGCTATGTGACTTCCTTACTAGCTATGCGACTTCCCTACTAGCTGTGCGACTTCC
CTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTAGCTGTGCGACTTCCTTACTGGCTATGCGACTTTG
CTATTGGCTATGTGACTTCC
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