SelenoDB: selenoproteins database

SelenoDB
Release 2.0
Chart
Advanced
Promoter Report for SPR00002510_2.0
Promoter
Selenoprotein U1 (SelU1)
Species
Sorex araneus (Shrew)
Promoter ID
SPR00002510
Promoter release
2.0
External ID
None
Transcript
SPT00002445_2.0
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A)
[Report annotation error]
Orientation
Forward
Structure
Feature	Col Promoter	Col Coding exon	Col Non coding exon (UTR)	Col Intron	Col SECIS
Residue	Col Sec	Col Cys or Other
Toolbox
Sequence
>SPR00002510_2.0 # Promoter # Selenoprotein U1 (SelU1) # Shrew (Sorex araneus) Full length # Forward
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CCGTCTTATATTTTTCTCAAGTCAGATCTGAACTTTGGGATGATACAGATCTAGCCCAAA
TGTCGTCTAGCCTTTTTTTTTTCCTCTCCCTAAAGTCACACCATCTCATTAGTCCTGCCC
CCGTCTCTGTGCATCTCCTGCACTCCCTTTGCCACAACTGGCAGATTTCCAGACCTTTGC
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GAGAGTGGGACAGAGTTAGATAGGACATGCCTATCCACACACACACAGACATCCACACCC
ACTCATACAGACAGACAGTCATGTAGACACATACACAGGTACTTACACCTGTTCACAGAG
ACACCCACAGACATCCACAGACACTCACATAGACACACAGACATCCACAAACACTCGCAT
GGACACACCAGACAGCTACACCTACTCACACACACACACACACAAGGAAAAACATTGTCA
GACGTCCACACCCACTCATATAGACACACACTAACAAACTTCCACACCCACTCAGATGGA
CACACACAGATACTGACATAGACACATACACCGAGACACCAACCCCACTTCCATAGACAC
ACACACACACACACACACACACACACACGGATACACCCCCCCCACTCACATAGACCCGTG
CACGGCATTTTCTCCGCACGCAGAATCACACTGGTACTCAGGGAGGAAGACCCCAGGTTC
CAAGGAGGAAGCGAGAGTAACAGAACAATGAGCGGTGTTCTAAGAACTCTGCCAGCACAG
GAGAGCAAGCCGCCCCTTCCCCAGAGAGACAGTAGCTAAGACCTGCACTGCGAAGGGGAT
GTATTGACCAGGAAGGGAAGCGGAAGTAGCTGGCCCCCAGGGGACATCATGGACAGCCAC
TTCAGATCCGAGAGGTCGTACCCATGGCTTTGGGAGAGGGACCAGCCAATGAAATGCCTG
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GTCTCAGCCTGTGCCCGGGAGATGAGATTGCAGCCTTCTCGTGGGAGCAGTAACGTCCTC
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