SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002724_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesTetraodon nigroviridis (Tetraodon)
Promoter IDSPR00002724
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002659_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002724_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Tetraodon (Tetraodon nigroviridis) Full length # Reverse
GTTTGTCTGTGAGGAGACGAGAGAGAAGCTGAGATCCAGGTCGGAGCTCAGGACGCCGGT
GGGACAGAGACCCCCGCTCCACATGTCTGCTCAGGTCACATGAGCGCCCCACCGATCCAC
CTGAAGCCAGACAGAGGTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTACACATGGCT
GGATGTACAAGGATGCTGTGGGGGAGGGAAATGGCTTCAAATAAATGAGACGAGGTGGAA
TGAGAATGACACCCACAGCTGGAATCCCCCAGCTCCCTCGGCAGATCCTCCCCCACCCCC
GCTTCATACACACATACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCC
GTTCACCAACAACCGCATGTCCACAGTGTATCTGAATTTCACCAACTGAATCTAAAGATA
TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGAGAGACGGATTTACTG
TAGATATAGGGATGGATAAGGAGGGAATTTAGCTACCGAGAGGGTGAAAAGAGTAAGGGC
ATTGCAGAGTAAAGAGGAAAGTGAACAAAAAACAGATGAGAGCAGGGAAGAAAGGAGAAT
AAGCGCATTGTTCTCTTATAGAAATCATCCTTTTCCTAAAAACTGGGACCGTTCCAGTGT
TTTATGGTTGTGCAGGATTGTAGAAAGCTCACGAAGGGGNGNTGAGAGTTTGACAAAAAA
GTGAGAGAGACAGGATGGGGAGGAAAGGGAGGTGTGGGTCAAGATGAGTCATGTTGGCAA
TAGAAGAGGGGGAAACAGCTGAGAGCTTTTTGAGGTGCGTCGTTGGCTCTGATCGAGTTT
TTATTTTGGCTGCAGTAAGACGATACTTATGTGGAAAGAGGCATTTCTCTTTCACAGACA
CACACACACACACACACACACACACACACACTCAGAATTTTCTCTCCCACTCTCACCCCC
TCCTCCTAATCTATCCTGCCAGTTTTTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTGTCGTGGGAGGTC
ATGTGAGTGTTTCCACATGTGCTAGCCCAGTGCTACTAGTTTGGCTTGTAACACTGACTC
GACACAAAGCCTCCACAGAAGCAGACGAGCCACCGGTCACAAGGCCCTTCATCTCCTGGC
ACTTCCCCCCAACGTTAAAACTCAATGAACAAGGATGAGAAACCAACCAAGAGGGCAGCA
GAGGTTCATTGCTTGAATAATACTATTTTTCTAGTTTTAGGTATTATTAAATACATATAT
GTTTTAGATAGAATTTGATTCCAGATGTGCCTGTATATGTGTGTGTGCTTGTGTAATGTG
TGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGAGAAGAAAAAAATCTCTTTTTTTTAATATAATGT
ATTTTACGGGGGGACTGGTTACTAACTGTGATGGAAGTGAGGCAGCAGGCAGGGAGGAGG
AGGGAGCGTCCGTTAGTGCATGCCACCATCACAGTGGGGGGGCCGTGGCCTCTGGATACC
CTGAGAATGGTAAAGGCTAATCCTACAGGAATGTTCAGGAATGTGAAAGTGAGTCAGGGA
TCGATTNCCACACAGTGGCGATNATGCGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNTGCAATTCATTACTGTCAACCCCAACAAAAGGCTATTTTCCACTGGGTGG
GTGGAACTCCTCGGATTTTAGGATCCACAGTGTTTAGAGCAGCCACCAAAAAACAGTGAT
TTGTGTCGTTTATCAAATTTTATCGTAATGTTTATTCTGTCCAATATGGATAAGAATCAT
ATTACCATTGTAGTTTTTGTTAAACAGCTGCATTTTACTGCAACTAACTCTGAAGTCTAG
AGGGAAATAGTTAATATGAAGTGCATAGGTTTTAATCCTTCATCGTTTCCTTAAATGAGA
TCTTACTACTCCTTCCTAACATCGGTCATATCAACAGTTTGGTCTGTTTCCCTGCATGAG
GAGTCCTAAACGAGCGCTCTGGGAAGGACATATTTGTTAGCGGTGTTATGTGAGGTGTGT
GGGCTGAGGTTTAAACTATAGGAAGAGGTTAGGGCAAAGGTTAAAGGTCAAGGATGTGGT
GGGTTAAGACTGAGGTTGCAGGTAGCATCCCAGACACACATGCAGTCAGTCTGATTTGAA
GTATAATACGGGAGGGGTGGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTGTGTGTGTTTTATTGGGCAG
TATGCATTTATTCGTGCGGGGGGGGGGGGGTCTTCATGATGAATACTTGTCTGCTCATCA
TTGCCACACCTTCTACCTTCTGTGCTATCCGCCAACCCCTCGAGATCAGCTAGTCTCTCT
GTCTTTTCTACTCTTTTACTTTCTTTCTCTTTACCATTGCCGTCCCGCTTTATATATCTC
ATTTATCTGCCCCATTTCACCCCAAAAACCCCCCAACCAAAGCTAGAGTGGGGTGTGTCT
TGGCACTGCAAACCGATGTGACTTCAGCTGTCTCTCTCTGTCCTCAGCACCAGACTGTCC
GTCTGAAACGCTGTGAAAGGCTGCAAGTGTGTCTGCCCTTTCCCGTCAGTAATGTTTTAA
ATGCCGCAGTTACACTATTTTCACTGGCTCTGTTTTCCAGCCACTGCTTTTAAAGGAGCA
CTTAAATGCCCCCAAACACTTTTAACTGTAACTTTCGCCATTAAATGTACCAGCAAAACA
GGAACTGTCCAACTACCTGTTTACATATGTGCGTGGGTGTGTGTGTGTGTCCCAAATACT
GGTCTCAAAAATGCAAAGCAAAACCAAAGGAAGATGCTGGGAGGTTGGCGGGAGGACTTA
CCAGGCCTTGTGGATGGCGTAGGCGGTGCGCGTCTCCCTGCCCTCCTGTCTGCTGATGTT
CTTGGCGGCCTCCACCACCTCCTGTGTGGTCTGGTAATCCTTCAGTGACCACTCGTGCAA
GGCCACCTCTCCGTACTGGAGTATGCCCACCTGGACGTTTGACCACACAAAGACAGCGTC
TCACCAGCGTCGTCGAATTA
Chart Advanced