SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002932_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Promoter IDSPR00002932
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002867_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00002932_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Xenopus (Xenopus tropicalis) Full length # Reverse
GCTGGTTGGAAAGAACATAAATATTTTTGTAAACACCCGAAATAGCAGGGGCAATTCTCA
CTATTGTCTATGGAAGGGTATTTTCTGGGATTTAGTAGTCGTGACAAGTAGCTGCTACTA
AGTAGCTCAGTGTGTCTTCACCCTTGAATATTCATGGCAATATTCCTGTCCTCTTTTACA
CAAAACCTTCATACCCAAGTGGGATTGGTGAGCCCAAGATTACCAGCCGGCAGCCACACG
CAGGACCCCACAGCACCAAGCAACTATACTACAAGTAAAAGCAATACGGCCAGTTCTCTT
TAAAGTCACAGTGATTGGCTCTTTAAACTGGAGGAAGTGGCCAAATGATATAATGCAATA
TATTTCACAAGAAAGTATTTCTCAAAATCCTGTTGCCGGGTAAAGAATGGTTTCATGCTG
AACCTGTACAGAGTCATGGAATGGCATCTGACCCGCCTATCTTCCTGTATCAGAATTAAA
CTCATTGTATTCTACAGAGCTATTCAGTTATCTGCCATGTAAATATCTGCCCTACAGCCC
CAACTGAATGGCTGCCCCCATGGCTACAAGGGAAACGTGCGATACAAATCGATACAAATA
GCTTTATTGTGTTAATGTAAATTAGGGGGGCTGCAAGCTATTGCATGTATTGAAAATTAT
GATTTAATAGGTATCACTGAGACCTGGTGGGATGATAAATGCGACTGGGCTGCGAATTTA
AATGGTTATACACTTTTTAGGAGGGACAGAGAGATTAAAAAGGGTGGAGGGGTTTGTCTT
TACGTAAAGTCAGACTTAAAGCCATGTAATAAAGACATTACCAATGAAAACGTCGAATCT
CTTTGGGTAGAAATTTCTGTAGGGCTGAAGGTCACAAAGAAAATGATCATTGGTGTATGT
TATAAACCACCCCGTATAGATGAGGGGGATGAGGCCCAGCTATTGTTGCAAATGGAGGAG
GCTTCAAAACTAGGTCAAGTTGTTGTTATGGGGGACTTTAATTATCCGGACATTGACTGG
AGTAATGGGGTGGCTAAGTCAGAAAAAGCTAGTAGGTTTGTAAATATGCTAAATGACAAC
TTTTTATTTCAGGCAGTTCAAGAACCCACTAGGAATGACGCTATTTTGGACCTGGTGATT
TCTAATAATAAATGAACTTATCTCTAACATTTGTGTGGGTGAGCATTTGGGGAACAGTGA
TCACAACATGGTCTCCTTTGAGATAATGCTGCAGAGACAGCTCTATAAGGGAGTAACTAA
TACGCTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTGGAAAAGA
GGCGCTTGCGAGGGGACATGATTACTCTGTACAAGTACATTAGAGGGGATTATAGGCAGT
TGGGGGATGTTCTTTTTTCCCATAAAAACAATCAGCGCACCAGAGGTCACCCCTTTAGAT
TAGAGGAACAGAGCTTCCATTTGAAGCAGCGTAGGTGGTTTTTCACGGTGAGGGCAGTGA
GGGGGTTGGGGAATGCCCTTCCTAGTGATGTGGTAATGGCAGATTCTGTTAATGCCTTTA
AGAGGGGCCTGGATGAGTTCTTGATCAATCAGAATATCCAAGGCTATTGTGATACTAATA
TCTACAGTTAGTACTAGTGGGTGTATATATAGTGTATGTATGTGAGTGTATAGATTGGTA
GGTGTGGGTTAAGTGTGCTGGGTTTACTTGGATGGGTTGAACTTGATGGACACTGGTCTT
TTTTCAACCCTATGTAACTATGTAACTATAACTATGTAACTATGTAACTATGTAATGGGC
AGTACTATATACAGTATTATGTGGGCAGCGTGGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGT
GCGGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGTGCG
GTACTATATACAGTATTATATGGGCAGCACGGTACTATATATAGTATTATATGGGCAGCG
CCGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGCGCGGTACTATATACAGTATTATATGGGCAG
TGCGGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGTAC
TATATACAGAATTATATGGGCAGTGCGGTACTATATACAGTATTATATGGGCAGTACTAT
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGGGCTGAAG
CCTTGGCTATCCCATGCCCAGCTAGAGTTCCAGGAGCCTGGGGAAGAACGGGCTGATGCG
CTGGCTATCTCATGCCCAGCCAGAGTACCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCT
GACTGTCTCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCTGA
CTGTCTCATGCCCAGCCAGAGTTTAAGGAGCCTGGGGAAGGACAGGCCGAAGCCTTGGCT
ATCCCATGCCCAGCCAGAGTTTAAGGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTAT
CCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTAGGCTATCC
CATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTAGGCTATCCCA
TGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTAGGCTATCCCATG
CCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTAGGCTATCCCATGCC
CAGCCAGATTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCATGCCCAG
CCAGAGTTCAAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCC
AGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGTCTGCAGCGCTGACTGTCTCATGCCCAGCCAG
AGTTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCTGACTGTCTCATGCCCAGCCAGAG
TTCCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCTGACTGTCTCATGCCCAGCCAGAGTT
CCAAGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCTGACTGTCTCATGCCCAGCCAGAGTTCA
AGGAGCCTGGGGTAGGACGGGCCGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCAAG
GAGCCTCGGGAAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGA
GCCTGGGGAAGGACGGGCTGCAGTGCTGACTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGC
CTGGGGAAAGACGGGCTGATGAGCTGGGTGAGTTCATACCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCC
TGGGGAAGGACGGGCTGAAGCGCTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTG
GGGAAAGACGGGCTGATGCGCTGGGCGAGTTCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGG
GGAAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTACCAAGAGCCTGTGG
AAGGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAAGAGCCTGGGGAA
GGACGGGCTGAAGCCTTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGTTCCAGGAGCCTGGGGAAGG
ACAGGCTGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGAAGTGCTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGT
TCAAGGAGCCTGGTGAAGGACGGGCGGGCTGAAGTGCTGGCTATCCCATGCCCAACCAGA
GTTCAAGGAGCCTGGGGAAGGACGGGCTGATGCGCTGGCTATCCCATGCCCAGCCAGAGT
TCCAAGAGCCTGGGGAAGGA
Chart Advanced