SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002936_2.0
Identity
PromoterSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Promoter IDSPR00002936
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002871_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002936_2.0 # Promoter # Selenocysteine synthase (SecS) # Xenopus (Xenopus tropicalis) Full length # Forward
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTTGCATGTTTGTCACACAAAATGTTTCT
GATCATCAAACACATTTAACTATTAGTCAAAAATAACACAAGTTAACACAAAATGCAGTT
TTTAAATGAGGGTTTTTATTATTTAGGGAGAAAAAAAAATCCAAACCTACATGGCCCTGT
GTGAAAAAGTAATTGCCCCCTGAACCTAATAACTGGTTGGGCCACCCTTAGCAGCAATAA
CTGCAATCAAGCGTTTGCGATAACTTGCAATGAGTCTTTTACAGCGCTCTGGAGGAATTT
TGGCCCGCTCATCTTTGCAGAATTGTTGTAATTCAGCTTTATTTGAGGGTTTTCTAGCAT
GAACCGCCTTTTTAAGGTCATGCCACAACATCTCAATAGGATTCAGGTCAGGACTTTGAC
TAGGCCACTCCAAAGTCTTCATTTTGTTTTTCTTCAGCCATTCAGAGGTGGATTTGCTGG
TGTGTTTTGGGTCATTGTCCTGCTGCAGCACCCAAGATCGCTTCAGCTTGAGTTGACGAA
CAGATGGCCGGACATTCTCCTTCAGGATTTTTTGGTAGACAGTAGAATTCATGGTTCCCT
CTATCACAGCAAGCCTTCCAGGTCCTGAACCAGCAAAACAACCCCAGACCATCACACTAC
CACCACCATATTTTACTGTTGGTATGATGTTCTTTTCTGAAATGCTGTGTTACTTTTACG
CCAGATGTAACGGGACACGCACCTTCCAAAAACTTCAACTTTTGTCTCGTCGGTCCACAA
GGTATTTTCCCAAAAGTCTTGGCAATCATTGAGATGTTTTTTAGCAAAATTGAGACGAGC
CTTAATGTTCTTTTTGCTTAAAAGTGGTTTGCGCCTTGGAAATCTGCCATGCAGGCCGTT
TTTGCCCAGTCTCTTTCTTATGGTGGAGTCGTGAACTCTGACCTTAATTGAGGCAAGTGA
GGCCTGCAGTTCTTTAGATGTTGTCCTGGGGTCTTTTGTGGCCTCTCGGATGAGTTGTCT
CTGCGCTCTTAGGGTAATTTTGGTCGGCCGGCCACGCCTGGGAAGGTTCACCACTGTTCT
ATGTTTTTGCCATTTGTGGATAATGGCTCTCACTGTGGTTCGCTGGAGTCCCAAAGCTTT
AGAAATGGCTTTATAACCTTTACCAGACTGATAGATCTCAATTACTTTTGTTCTCAGTTG
TTCCTCAATTTCTTTGGATCTTGGCATGATGTCTAGCTTTTGAGGTGCTTTTGGTCTACT
TCTCTGTGTCAGGTAGCTCCTATTTAAGTGATTTCTTGATTGAAACAGGTGTGGCAGTAT
TCAGGCCTGGGGGTGACTACAGAAATTGAACTCAGGTGTGATAAACCACAGTTAAGTTAT
TTTTTAACAAGGGGGGCAATCACTTTTTCACACAGGGCCATGTAGATTTGGAGTTTTTTT
TCTCCCTTAATAACGTAAACCTTCATTTAAAAACTGCATTTTGTGTTCAATTATGTTATC
TTTGACTAATAGTTAACGGTTTTTGATGAGCAGAAACGTTTAAGTGTGACAAACATGCAA
AAGAATAAGAAATCAGGAAGGGGGCAAATAGTTTTTCACACCACTGTATAATGCATAATA
CATTTCACTAAGTTTATTTTTTTCTTGGATTTTACACTTATTTTCTTCTGGGCCCCTGAA
CAGGGGTTCTGCTGTACAAAATTATGAGAATAAAAAAATCTGGATAGATCTACTTGGACG
GCCTAGCACCAATACAGCTAGGGTTGCCACCTTTATAAAATAAGTATACTGGCCTGGCTG
GGCAGGCTGTGATGTCAAGTGGGTGGAGTTGTGATACAGAGTGGGCAGGGTAGTGATGTT
AAGTGGGTGAAGTTATGATACAGAGTGGGCAGGGTAGTGATGTTAAGTGGGTGGAGTTGT
GATACAGAGTGGGCAGGGTAGTGATGTTAAGTGGGTGGAGTTGTGATACAGAGTGGGCAG
GGTAATGATGTTAAGTGGGTGGAGTTGTGATACAGAGTGGGCAGGGTAGTGATGTTAAGT
GGGCGGAGTTGTGATACAGAGTGGGCAGGGTAGTGAGGTTGAGGGGGCTGGTTGTCGCAT
TAAGGGGCTGGAGTGTGTCATCAAGTAAGGAAGCGCAGAAAAAATGGGCAGATTGGGGGC
CATCCACATTAACTATTTATTAAAAATTTACCAGCAAGTATTACAATGACATTTTTTGAC
TTAACTATGTTACTATGTAAGTATATTGCTGTTAAATTTGAAATACCAGCCCCGGCCTTG
GCTGGTATTTTTTACTGCTTAGGTTGGTGAAATACCAGCAAATGGCAACCCTACATACAA
CTTGCTTGTCTGTGCAATGGCCATATAACCAAGGTTACGTAAAAGGGGTACACTAACTTT
ATTCTCTTTTCTTTGTCCTC
Chart Advanced