SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002942_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein N (SelN)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Promoter IDSPR00002942
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002877_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002942_2.0 # Promoter # Selenoprotein N (SelN) # Xenopus (Xenopus tropicalis) Full length # Forward
AAAACCAAAGCAAAGCATCTGATTGGCTGCTAGGAGCAACATCACCCGTAATGTTTTACT
CCACTTTTTCCACAGCATAATAAATATACCCCAATTATTAGTGTTTTCAGTTGTCTTTAC
ATTCACTAATACCTTTAACCCACTGGAAAATGTGAATGAAGGTGTATAGAAAAGCTGCGC
ATAGAAAAGCTGCTCAGAATAACTTTTTCTTTCATTATGAAAAAAAAAATAATGTTGGGG
GTTTGTATGCCCTTTAATCCTAGGTGCAGTCACTTTTCCCTTCTCCAAACATCCCTTCAG
AATAAATATCCAGAGGTGCAGCGCAGCACTGCAGGGGTTAAACAGCGGGAAGGGGGCAGA
GCGGCTCAGGCATTGGGTTATACCATTGCACTGGTTAGAGGGGGGGGTGAAATCTATTTT
TCTGTCGAGTGCGATTCTTTCTTTGCCCTACAACACCGGAAGATCTTATATTAGGTGGAA
GCGGATGGTAAGGAGTATATAGGGGGCCGAGCTGTGGCTCCGGTGGGCAGATTTGGCGAG
GGGGGGTTTATTGGGCTTTCCCTGTGGCAGATGGAAGGGCTGGTGTAGAGGCAGCGGAGC
TCAGTGTGAGGGGAGCGGAGGAGGTGAGTAGCGGTGGGAGTGAGTGCTGCTCGGTGTGTA
GTTGTGTCTGTATATACTTATGTTTATATTATGCTTCTCACTGTAGCACAGGCAGGGATC
AGTATAATAATATTATATAAATACAGTTACATTCATGAGTAAGTGCTACAAGCCAAGAGG
TCCCTGCCCTGATGGGCACCCATCCTCTGTAGTCACATGACTGTCCTGCTCTATCCCCCT
GCAACTCCCTTTGGGGGGTCACTAGTGCCCATGCTGTGGGGTTCCTATCTTCTTGCTTTT
GGACTACAACTCCCATGATCCTCTCTGACACAGCTGTAATCAGAGATGAGCCCCTTCCCA
TCCTGGAAGGTTTCATGCACCATGGGAGTTCACCTTTTGATCAATACACTTCTAAAAATC
CCATAGGAATGAATAGAATGTGGGTGAGTTTCTATGTATTAAGCTCTAAACTACAATTTG
GCTAAATGTGCCCCTGGGGGCGGGGCCAGAGTGCCACATGGGGCCCATTCAGTACAATGC
AACTTGCACGTCTCCAGCTGTTCCCCCCACTAAAGCCGTTATACAATATTAAATTAAACA
TTTAGGTTAATTATATCTTAATAACAGCACTGGGTACATTGTATCGTTTTATTCTCTTGC
TCCTGCCATTTCCATTCAACCTTCAGCGCAGGTCAGTGCTATTGATTGCGTGTCCTGCCC
CCGGGGGCAAAAGCTCTGTCCCTGCACTGTGGGTTAGTACTGCACGGCTGAACTGCATTC
TCTCCCGATACATGGAAATCCCCATTATGGGATTATATACCCTGCACTTTATTTTAATGC
TCACTTACTTACTATATACTATGTATGCTTTCTTGTGTGTTTTAATGTATAAACCCATTC
ATTGTACAACTCTGCGGAATAATATTATTATTTATTAACATTTATTTATAAAGCGCCAAC
ATATTCCGCAGCGCTGTATGTTGGTAATAGTTATTTGTAGTATTATGAACTGGAGAAGCA
TTAATGTGACCCTCTTGGTCTCCTGTCCCACTATTGTTCTGTCTATTCACGTATACAGTA
CATGTACAATAGAGTTCCCTGACCTATATAACTCAGCCTGCAGCCTTGTGCCTTTATATG
GGCACAGAACCCCTCAGTGACTGCTAATATCCTGATCATTTACAGTAGGGGGTACATTAT
CCCTTATAATACATGAGTGATACTCAGAGTTCCCTGTATAACTCAGCCTGCAGCCTTGTG
CCTTTATATGGGCACAGAACCCCTCAGTGACTGCTAATATCCTTATCATTTACAGTAGGG
GGTACATTATCCCTTATAATACATGAGTGATACTCAGAGTTCCCTGTATAACTCAGCCTG
CAGCCTTGTGCCTTTATATGGGCACAGAACCCCTCAGTGACTGCTAATATCCTTATCATT
TACAGTAGGGGGTACATTATCCCTTATAATACATGAGTGATACTCAGAGTTCCCTGTATA
ACTCAGCCTGCAGCCTTGTGCCTTTATATGGGCACAGAACCCCTCAGTGACTGCTAATAT
CCTTATCATTTACAGTAGGGGGTACATTATCCCTTATAATACATGAGTGATACTCAGAGT
TCCCTGTATAACTCAGCCTGCAGCCTTGTGCCTTTATATGGGCACAGAACCCCTCAGTGA
CTGCTAATATCCTTATCATTTACAGTAGGGGGTACATTATCCCTTATAATACATGAGTGA
TACTCAGAGTTCCCTGTATAACTCAGCCTGCAGCCTTGTGCCTTTATATGGGGGGCACAG
AACCCCTCAGTGACTGCTAATATCCTTATCATTTACAGTAGGGGGTACATTATCCCTTAT
AATACATGAGAGAACCAAACATAATTCAGCCAGCAGTTTTGTTAACCTCTTACATGGGCC
TTTAAGAAACTGTTCAAGCTGGCCAATATGCCCTCCAGTTTCCTGCTGAACTGTGCTTAG
TACAGGGGAATCCCTATGTGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCTATGGGCAA
ACTTAGGGGGCTGTTCCTGCTGAATTGTGCTTAGTACAGGGGAATCCCTATGTGCCATAG
TTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCTATGGGCAAACTTAGGGGGCTGTTCCTGCTGAATT
GTGCTTAGTACAGGGGAATCCCTATGTGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCT
ATGAGCAAACTTAGGGCGCTGTTCCTGCTGAATTGTGCTTAGTACAGGGGAATCCCTATG
TGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCTATGGGCAAACTTAGGGGGCTGTTCCT
GCTGAATTGTGCTTAGTACAGGGGAATCCCTATGTGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTG
TACAGGCTATGAGCAAACTTAGGGGGCTGTTCCTGCTGAATTGTGCTTAGCACAAGGGAA
TCCCTATGTGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCTATGAGCAAACTTAGGGGG
CTGTTCCTGCTGAATTGTGCTTAGTACAGGGGAATCCCTATGCTGCCATAGTTTTATGGT
ATCTCTCTGTACAGGCTATGAGCAAACTTAGGGGGCTGTTCCTGCTGAATTGTGCTTAGT
ACAGGGGAATCCCTATGTGCCATAGTTTTATGGTATCTCTCTGTACAGGCTTAGGGGGCT
GTTCCCATTAGATCATATTAACTACAATCTGCTGTAGAGGGGACATATGTACAGCCCCAT
TTGACTAGTCACAACCACAGTGATGTGAAGGGAGTTGCTTAGAATTCCATTTCCCTTATT
ATGCAGTAAAATGATCCCCGTATGTTGCCGTTCAGGCCCCCTGTCTGTTTGGCTTCCATC
AATGAAGTCATTCTGTCCAGCCCGGCATTAGAGGATGGAAACTGACGTACCCATAGAAAC
GGTCATGCAAGCATGAAACTACAATTCCCAGCATCCTCCACTGACTCCCCTGGGAATGCT
GGAGTTTGGAGTTGTGACCGAGGGCCACTTACTTCTATAGTGATTTTTAAACCAGCTGAA
CATTAGATTTCATTCCTCTGCTGCTTATTAGTGATCCGGCTGTCATTGCAGAGAGCTTGT
TACCGGTCGGATAATCTCCCGAGAGATCCATATCCAGCGCGGTGCAATGGGATGAAAGGG
GATCGGTTAATCATGCAAGAAATGGCTCTCGCTAAACTCCTTTAGAATATAAATCAGCTT
GGCTTAGTCTCCCCTTTACCAGCAGCTCTTTACACGTTTCGCTTGGGCGGGTTTTAAATG
TAACCGTAACTATTCAGCCGGCTGAGCTGCAAGTGTGGCCTTTAAAATATGGTTGCCTAT
GGGTTAAAGGACAACTAAAGCCGTAGCAATTAACTTAAAATGCTGTATTTTATATACTGT
ACTTACTGTACCATCCCAGAGATTCAGCAGCCCTATAACAGGAATAATCCAGGCCTTCAA
AGTTGTCCCCAGAGCTTCCATCCTGGATCTGGTTAGGCCATTTATTGTGTGCCAGTGGCA
CTGCACGTGCTCAGTGGAGCCCAGGGTAAAGTGTTGAACAGACAGAAAGGGCCAAACCCT
GTGTGTATCTGCTTTAAAGCACAAAAGGTCAGTGGATTTCCACATTAGTTATACCACAGA
AGCAGTAGGGCTTGCATCCAGTCAAACAGAGGGATACTGGGAGTTGTCGTACAGGTTGTC
TCTGAGAGGAAACTGCCAATGAGAGCTGCTTTGGCTTTGCCCTGTGCCCTATTGCCGTGT
CAATGATGGGTCCTTTAGACCGATTTGGCAGGAGTGCATTGTGCGTGAGTCTGAGCTTTC
AGAAGGAGCCAGCTCTACACATTAGAACTGCTTTCAGCTAACCTATTGTTTCTCCTACTC
CCATGTAACTGGAGGAGTCCCAAGCCGGACTTGGATTTCTTACTATTGAGTGCTATTCTG
ATACCTACTGGGAGCTGCTATCTTGCTCCCTTCCCATTGTTTAGGTGATCGGCTGCTGGG
GGTGAGGGGGGGGGGGATATCACTCCAACTTGCAGCGCAGCAGTAAAGTGTGCCTGAGTC
TGAGCTTTCAGCCAGCGCTACACATTAGAACTGCTTTCAGCTAACCTATTGTTTCTCCTA
CTCCCATGTAACTGGAGGAGTCCCAAGCCGGACTTGGATTTCTTACTATTGAGTGCTATT
CTGATACCTACTGGGAGCTGCTATCTTGCTCCCTTCCCATTGTTCTGCTGATCGGCTGCT
GGGGGTGAGGGGGGGGGGATATCACTCCAACTTGCAGCGCAGCAGTAAAGTGTGACTGAA
GTTTATCAGGGCACAGGTCACATGGCTGTGGCACCCTGGGAAAGAATATTTTATCTTATT
GGATTTTCCTTTTTTTACAG
Chart Advanced