SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00002944_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein O (SelO)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Promoter IDSPR00002944
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00002879_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00002944_2.0 # Promoter # Selenoprotein O (SelO) # Xenopus (Xenopus tropicalis) Full length # Forward
TTTTAATTACTTATATAATTTATTACTGTGTAATTGGTCCCATACCTGTATTAGACATGC
ACAAATAGCTGGCACTTAAACATGCAAGCTGTGTTCTCCCTTACACGTTAGATCATGCAT
GTACATGTAAGACAAAAACCTTACATGTACATTTCTGTCACTAGACAGGACAAGGCGCAT
TGTAGCATTTCCCATTTGCTTCAAATAGGGGGAAATTTCTAGCAGGGCGTGCCATTACCC
TAATGATGTATAAAAGCAACAAATAAGTATTCTGAGAATGTGCCAAATGGCCATGTTTTG
TGTTGACTGCAGTGTTTTTTTTCCTAATACATAAATATTGATATAAGGGCTTTTACTATT
GCTCCAAAGCAAGTGCAAGAATACTAACATGCTCAAAACAAAATGTACACCTTTAGCCAG
TAATACACCCACAATTCTGATCCAGTTTTTCAGAAGTGTTTTTTGACACAATTTTCATAA
ATAATGCAAAATAAAAATCAGCAACCTCTAGATATTTTAAAGTGTCTTTTTCATCAATCC
TGTCTGTAAAAATGGCCCTTTTATTGGAGCTCCCTATAGATCCTATCAGTTCTCTGGGCC
TGTTTCAAATGAGAGGTGAGTGTGTCCTAACGGTCCCTGCCAGAAGCAAAGTAGGAGGGA
GATAGCCAATCACAGCCCTGCACTCACACAAGCAAAGACAGGCTTCAGTTCCCTATCAGG
TCAGCCTAGTTGCTGATTGGTTCCTATCCTACAGTGCAGTGTACTGAGAGCCGCCGGCTC
TCCTGCACATCCAGAGAATTCAGCCAGCAGGAAGTGGAACAGATGGGCGGGACTAGTGGG
GTTTTGGGGGAATTTCTCAATAAATCAGTCCAAAACAAAACTTTTTAAAGCACATTCCTT
CTATATCTAGAGGAGTATAATTCACTGGTACATTCATAATTTTTATAGGATACATCTCCT
TTAAGGTATAGAGATCCAAATTAGTGAAAGATCCATTATTCGGAAAACCCCAGGTCCCAA
GCATTCTGCAAAACAGGTCCTATACCTGTATAATAATTCGGTAGTAGGTAATTTCTTTTT
AGAGCACATTGTTTTTTTCCAGAAATGATTGACTGTGGCATGGGCTGGGGTACCTAAAGA
ATGTAGGGTTCTAAAATCAAGAGGGATAACCCTTGATTTTATCCAAGCAAAATGGATTGA
TCTCATGTTTGGAAGCTAGCTGTAACAATACTAACATACATAACCATAGAATGAATGTGC
TGAAATTGAAAGTACTTTGCCTATAAAACGTAGCGTGAAACAGTGATGAGAAGCAAATTA
AAGGCAATGGAAAGCACAAGCAGTGTGCTTGGGTAACTTAATGAATGAGGTGCAAGTAGA
ACAATTCCAGGAAATAACACATTTTGTGCCCAGATATTTAAATGAAAAGAGTCCTAGTGG
AAAGATACAGCAGCTTTATTAGTTATGGTTAGGGCAAAGGCACAAGGGGCATTTTGCCGG
CCATTGATTTCCAGTGGTGGCTGGTGGGTGACAAAACACATGGAATCTCCCCTCCATTGA
CCTGAATGGTTCCTGCCAGATGAGGTGATAGTAAAGCTGTAATATTCCCCCATTACTTCC
TTGTAAAGTAAAGAAACTTGTGTCGTTGATCATTTTTTTTTTTTTTTTTAACTGGATCCC
TCTTTTAGGTGTCAGATGATATTCTCCTCCCTTCTGCCCCATCCTATTTAATATTTGGTA
CAGGTAGTTAATATATCATGCAGGAGATGAGTAAGATATACTTTAGACCTGCATTAGAAA
ACTTTCTATTTTTGTTGGTATTTTTGTGTGAGTAAATCAGTGATTCTTGTTTCCTCTGCT
GCAGAAATAATGGAACGATGTTACAGAAGAGATACATTCAATCATTGCGACTAATACTAA
GTATTCCAGCATGATTCAAGATGGCTTCCTACACATATGTTTTTGGGTAGTGTTATGCCC
CCTTTATATTGGATTGAAGGCAGATCTTCTGATGGATGAAGTGGGCTCTCCCACTGTGTA
TATGAATAGCACTTCAGGCACCTTAGGCTTTTGTGAAAGAAGAAGGAAAGTTTATTCAGT
GGATCAGTGGCGTTTGTCAACAGAGGATATACTTGGTATGTTGAATTTTAGTACAGGTAT
GGGACCTGTTATCCAGAATGCTCATGAAACATTAAATAAACCCAATAGGATTGTTTTGCC
TCCAGTAAGGAGGTTCTGTTTTATTATTACAGAGAAAAAGGAAATTACTTTTAAAAATTT
TAATTATTTGATTATAATTGAAATCTATGGGAGATGGCCTTTCCATAATTCGGAGCTTTC
TGGATAATGGGTTTCCAGATAACCAATCCTATGCTAGTATTTAAAAATACTTATAGCCTT
TTAACATTTTCTAAACATGCATAATTTTTGGATTTAGCTGAATAAAGACTTCTCTTTCAA
AGATATTGCCAGATTAAATCTTTGAAAATCTCCCACTTAAAATTGGCATTATTCACTAAA
AATGTGTTACCTCTGCATGTACAGCGCTTTATAGTCACATGACTGTTATTAAGACTGTGA
TTAAGATTTAGCTAAATATACATTCTAAACAGATCTTGTATTCGGTGCATCACTATAATA
AAAACCTAAATATGAAAATGAAAAATTTAAATTATTAAAAATCTAAAGACCATTTGCAAA
TTGTCTCAGAATATTACTTTCTACATCATACTAAAAGTTTACATAAAGGTGAACAACCCC
TGGGCTCTCGTAGTTTGGGCTCTCCTGGTCCATTGTTCCTATTGTTATGCCTCTGCGTAT
GAGAAAGTGGCAATACTGTATATGCTATACTGTATATACTATATACTGTAATACCTTGGG
CCTGTGGTATGGTAGGTGATATAGATAGTTAGAATCTGATTCATTTTTTTTTTATTTGAG
GGGAAAAGAAATGGAATGCTCCTTATAATACTGCAATGTGTCTCTCCCTAACAGATGAAT
TGCCTGTTGATCCTAACAGAAACAATTATGTTAGAAGAGTGCAAGAATGTATTTTTTCCT
ATGTCTCCCCAACTCCATTCACGTCAGATGTCCGACTCGTAGCTGTTTCAGAGGTAAGGT
CAGCGTCGCCTATATTATACTGACTACATTTCCTCCAGTATACGGTACTGCAGTCAGTTT
TGGTGTTTATATTGCAGGGCACAGGCATAACAGCAGGAAACTCTTTCTGCTTGGCAATGC
ATTAGGGAGAAAGGCCCCTTGCACAGCCAAAATGTCCACCTCTCCTAAATGACAATTTTG
GTGTTTTAAACATTATAACCCAGCAGAGGCATAATACAGGTATAGGACCCATTATCCAGA
ATGCTCGGGACCAAGAGTATTCTGGATAAGGGGTCTTTCCGTAATTTGGATCTCCATACC
TTAAGTCTATTAAAAAATAATTATATTATTCAAACCCAATAGGATTGTTTTGCATGCAGT
AAGGATTATTTATATCTTATTTGGGATTAATTACAAGGTACTGTTTTATTATTACAGAGA
AAAAGGTTTTGGTTTTAAAATTCTAAATTATTTGATTAAAATGGAGTCTATGGGAGACTG
ATCTTTCTGGATAACGGGTTTCCAGATAAGGAATCCTATACCTGTACTGGTACATTTTAT
AATCGTATCCTTACACTTCATGATAAATCTCATCTTGTTTTACAGTAAAACCCTTTAAAC
TATAAACTTTATATTGCAATGATAACAGTGATATTTCAGCTTTTGTTTCAATGAATGTCT
TTAAATATTCTAATACAGAAAAATTTTAACAGGATGCCTTGGAGAACCTTCTAGATCTTG
CCATTTCTGTTGGAGAGACAGATGCATTTCTTCAATTTGTAAGTGGGAGAGATGGCTTTA
CTGACTGGGGGCCACTTGCGCACCGATATGGGGGACATCAGGTAAATGCACATGTCCTTT
TAACATCTGGTGTAGATTTCCACATATTCTCAGCACTTGTGTCACACCACTATATACATG
CTTGTGCATAGTGCTCTGTGCCTTATCTTCTAGAAATATTGAATTTGATGCAAAGTACTA
TGGGTGCGAGGGATTCCTGTAACTAACACCTTGGTAAGGTCATATTTACCAGGTCCTTGT
ACTTGACCTGTACGATAAAAAGGTTCCTTTCTTTGAGAATCCAGGGTCAGACTGAGGGGT
ACAGGGGCCCTTATCCTCCCCATAGGCCCCCACACCCCCCAGGGGCCCCTGCCGCCCACG
CCACCCCCTTCCTTCCCCCTGAGCATGAATACATTACACATATCTTAGGTGCGATCGGGG
TAGGGAGCTCAGCTGGGAAGCACCGGGTCTGGGTCGGCAGTGGCCAGGGCCCACTGGGTT
TTTTCCCGGTGCCCCACCGGCCCAGTCCAACCCTATGAGAATCTCAATGGTTTTTGAACC
ATGTGGTTCCATTTGTGTTAAGGGTCTGATCCCAGCTGCATCACACATTCATAAGATTCC
TAGTCTTGTTCACCATCCATCTAGTCTGGATGTCTCTTTCTGATCTGATAAAACTGCATG
GAAGCTCTGTATGAAGCCAACAGGCAATCTGATATGCTAAGGGTTGCCACCTGGCCAGTA
TTTTACCTGCTTGGCCAGTAAAATTATGCTTGATGTTACCAATGTTATTAATAGGGAAAA
ATTATAAAAAAAAATATAGGAAAGACAGTATTTTTTCCCAAAAAAGGTGTCAACCCTAGA
TATGTAAAGAGATTTTTCTGTGATTGGCTCTATAGTCAGTATTAATTAGTATTAATGCAA
TAAAGGTAGCATTCAGGTAGACAATTTTAATTGCATATTTCTGTTTCCAGTGAAATTGTT
ACCAGAGTCCTACTAAATCCCAGAGTCATGATAAGAAAGATATATGATTAGAAATATCTG
CTTATTGCACTTGAAATGGTGCAAACAGAATAAATATACATGTTTAGTATGTGAAAAACC
TTTCATTCTTTTCATGCTGC
Chart Advanced