SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003189_2.0
Identity
PromoterThioredoxin reductase (TR)
SpeciesNeotoma lepida (Desert woodrat)
Promoter IDSPR00003189
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003122_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003189_2.0 # Promoter # Thioredoxin reductase (TR) # Desert woodrat (Neotoma lepida) Full length # Reverse
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CCACCCTCTCCCAAGAATAAATGGCATTCTCTTGAGACGGATGACCTGCTGTCTTGTCTC
TGTTCAATCCTCAGCCCCTCGCTCAAAACTTGGAGGATAACTTGCAGTGCAGGCGCTACA
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AGCAATCCAATAAGCAGCACCAAATGAAGAAGCTTCCAGTACTGGGATTGTGTTACATCT
AATTGAGCTGTTGGCCAACGATGTCCCTTAGGAACCTCCAAACAACCTAGGCTGTTGCCA
AGACTGTAGGTTACTCTTCACAAACTGATGGCAAAGCCCCATTGCTGAAAACAACGCCTA
CACAACTCATTGAACATGGAGAAGTTGAGCTGGTTCCTACATAGACCCTTCAAACATAAG
TTCCAGCATCTTTGATACAGGGAGGCACTTTGTATGCTACCAAAAGAGAAAGGTAAACAC
CAACCCCTTGGATCGACAGTGGTGGCCTGCCTGCAATATGCTAGTGTAATGGTGACACAA
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ACCCATAACTGACACTGCTTGGGTGACTAAGAACCTGAGACTAGATAGCCCAGGGACCTA
CGGTAAAACCAAATACTAATGTTCTAAAGAAAAAAAAATCAGCAATAAAATGACTCCTAA
TGAGATTCTGCTATACTCATAGACTAGTGCCTTGCTTAGCCATCATCAGAGACGCTTTCT
CCTGCAGCAGATGGCAATAAATAGACCCACAGCCAGACATTCTGCAAATGAGATACCTTG
GAACACTCAGCCCTAAAAGGGATATCTCCATCAAATCCTTCCCCTCAGGGCTCAGNGAAC
CCTATGGAAGAGGAGGCAGATCGAATAGGGGAGACCAAGGGGATAGAGGACACCAGGAGA
ACATGGCCCTCTGAAACAACTGTGCAAAGCTCATATGAACTCAGAGACTGAGGCAGCATG
CACAGGGCCTGCACAGGTCTGCATCAGGTCCTTTACATATATATTATAGTTTCCAGATTA
GTGTTTTTATAGGATTCCTAAGTTTATTGTGCCTTCTCTTGGATTATTTTCCTTCTGTTT
GTTTTGTCCAATTCCAATGTGTTAGTTCTCATTATTATCATCCCTTACAAGCCTCATTGT
TTTCTAATGAGAGTAAGAAAAGGAGTAGATCTGGATGGGAGGGGAGGTGGGAAGAAACTG
GGCAGAACGGAAGGAAGGGAAACCATAATCAGGAAAAATTATATGAGGAAAAATCCATTT
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TCCAAAACAAAATTTCCCAAACAATAAATCTCTAAACATACCTTTGAGTTCATTTTGTGT
TGGGCATCTACTGCTGGGCACGGGCCCTGCCCTTACGTGTGGTTTATATACCCAGTGAGA
CTCCTTTGGGAAAAACTAATATTTTTATTTGCAAATGATTATCAATTGGAGATAGCTTTT
GTTAAGAATGTGAGATCATGTCCACATCCCCATTTCAGTACTGGGACCCTATCTGGTTTG
GACTTGTAAAGGCCCTAAGCATGCTTGCCACAGTCTCTGTGAGTTCATATTTATGTCAGT
CCTGTTGTGGATTGAAAACACTGTTTCCTTGCTGTCCTCCATTCCCACTGGCTCTTACAA
TCTTTCTGCCTTGCCTTCTGCATTGTTCCATGAGCCCTGAGAAAAGGGTTTGGTGAAGAC
ATTCCATTTAGGACAGATTGTTCCAAGGTCTCTCAATCTCTGCACATTGTCCAATGTGGG
TCTCTATATTTATTCTCATCTCCTACAGGAGGAAACTTCTCTGATGACGGCTGAGTGAGA
CGTGGATCTATGGGTATAGTAGTAGAATGTCTTTAGGAGCCATTTGATTGCTATGTTCCT
TAGATGAAAATAGCATTTGTTTTCCCCTATGTCCATGGTCTTTCTAGTCTCAGGTTTTGG
GCACCCTAGCAGTGTCAGGGATGGTTTTCATCTCATGGAGGAGGTCTTAAATCCAATCAG
ATAGTGGTTGATTATTCCCAAAACATTCATACCACTATTGCATCAGTGTGTCATGCAGGC
AGGTCATCATTGTAGATCAAAGGTTTTGTAGCTGGGTTGTTTATCTTTTTCCACTGATAG
CATGGAGAGTATCTTCCAGTACCATGAACAGTCATCAGTATGGGTGAAGGCTCTAGTTAT
TCACCAGCTTGACTTCCTCATGTTCAATGAGACATATAGGTGTTTTCTTCAGCAATAGGG
CCTTACCATCAGTTTGTGGAGAGTAACCAATAGCCTTGGCAATAACCTGAGTTGTGTGGA
GGTTTTGATGGGGCCCCATTGGCCAACAACTTAATTATGTGCAATCAGTTCCTGGCATTG
GAGGTTTCACTTGGTGGCAAGTGATGTCTAGTTGGCTTTGTCTCCCCCATTATTTGGTAA
TTCCATTTAAATTTCCTTCATGTATGTATATATTTTAAGAAGCTTCTCTTATAGTAGGTT
CCCATATGACCCCTCAAATCCTCTTTAGTGTTAGCTATCCTGTTGTAGATTATTATTTTA
AGATGTGTTACTTTTGTTTATGTTGCATGTATTAACTCTGTGAAGCTGTGTTACTTTGCC
TGTCTAAAACACCTAATGGTCTAATAAAGAGCTGAATGGCCAATGTCGAGGCAGGAGAAA
GGATAGGCGGGGCTGGCAGGCAGAAAGAATTAATAAGAGAAATCTGGGACAGGNGAGCTC
TAGGAGTGAGAGGAGGAAGA
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