SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003227_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein I (SelI)
SpeciesMiichthys miiuy (Mi-iuy croaker)
Promoter IDSPR00003227
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003160_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003227_2.0 # Promoter # Selenoprotein I (SelI) # Mi-iuy croaker (Miichthys miiuy) Full length # Reverse
AAGAGCCATGGTGGTACAGTCTGGCTCCACAGTGAGATAAATAGATTTATCCTCTTGGAA
ATGCAAATCCCTAACGTTAGCTGCCGAGTCGAAGTACCATCTAGCTTGGCTGTTGTCGTT
CACGCCGGGTGAGGCGATGTCGAAACATTTGGGCCACTCCTACGGGCGGCGGGGGAGTGC
AAACATCCAGCTAACCGGAGCTCACTACCGCCGCCTCTGGCCTGGAGGACAGCGATAAAA
TAATTTTAAAAAACCAATTAAATTGCGTCGAACGGTCTAAAATGACGTTTTTTTTAATTT
GTTATACTGTCACTTGAAAAACGAACGTTAATAAAGTTTGTTGAGGTATGTTTTGTAGGT
TTTATTTGTATTCATTGATCATTGAGGTCTGCTCTAATCGACGTATTTCTATGACGCTCT
TAAACGTGACGTGGCTTTCCCCTCCAACCGGAAGAGAGAGACAGGTTTGCCCGTTTGTTG
CTGAGCGGCTGAAACATCACTCAAACCGACACTAAAAACCCAATTTAAGGGATAATGTAA
GTAATAACATGATTTAAACTGTGTTGAATTTGGTTAAATGTTTATCATTTTCTTCAGACT
TCACGAGGGAGTACCTTATATTGGAGTAATTTAGACAGTTACTGTTCCAGCTAGCTAGCT
AGCTAGCTTGACATCACACAGATTTATGGAGCAGTCTCAAAATGTACCATGATTTGGCAG
ACTCATTTATAATCATGCAATCTGTGGGGGACTGTAATGACGAGTGTAACAGTTACTCCG
ATTTTCTGATTCATATGCAAAATATAAACATGCACAACCTGCTAAGATAATTTTCAATGC
GTTTTTCATGCTCATAAAGCTGCCATTAAAGTGCTTTGAGATTGAGTGAACATCATGCTT
CCTATTTATTATGGCTGTTATATAGTCATGTGAATGTAAAACAACTGACTGATCATAAAG
TACATGTGTATTATACTTTAGAATGGACAGAGATGATGATAAACATGTCAGTCAAAAACA
GTGGTATGATCTTAAGCTGTTTACCATTACAGGCCTGATTATATACGTATTTTAAGACTG
AGCAGCTTTCTTACACTAACATGTCCCTTTATCCTCTGCAGAATGGTGACAGACGTGCAG
CTGGCCATATTTGCCAACATGCTTGGCGTGTCACTGTTCTTGCTGGTTGTGTTATATCAC
TATGTTGCCGTCAATAACCCCAAGAAGCAGGAGTAGAAGCTGCCATTATGATTGGAGAGG
TGAGTGCAGTTTATTTGCATAAGGTGGTTTCGGTTGCGGTTTCACTGTGACCTCAAAAAA
GTCAAGTTCTTAACTCAGTGCTGCAGCAAATGTTTTTTTTTTGTACAGGATTAATGATTG
TTGTGGCAAATGTAACAAATTTAGTGAATGATGATGAGTTGAGATCATTATGTGTCAGTA
AAATGTGGAGCATACTTCCCACAGGTTTGCTTAAAAGTTGAAACGCATTCAGCCACAAAG
AGATGCTTCTTTCCAGTGTTTTATCACCTGTGAATCCACTTAACATCTTTTTCTCCCCTC
AGGTGAGATGGGACTCCCACCACCATCGAAACAACATTCCCCTCTTCCAGGCCTCTTTTC
CAAGAGATGAATTTCTTTGTTAAATTGCACAGTAGTGTTTTTTTCTAATAAAAATGTGTG
AAGTCCATTTGCATCAAAGTTATTCTGCTTACACACAATATACATTCTCATTGAGTTATT
ATATTACAAACAAACATGGGTTTGTCATGAGGTTTTTTTTTAAACTTCATTTATTTTAAC
TTCAAGTTTGTTTCAGATTCAAACAATATCTTACCAGTCACAGTATAATTTGGTAAAAGT
CAGTCACTGGATTAAATAAAATGCTTATACATTTAAAAAGACAACTATTTTAACCACTTA
CTTTACACAAAATATTTATGTAATTGAAATATATATGGTAATAAAGGATATGTTTCCATA
TTGGTGTGCTGTGGAGCAAAAGCTCTAATGGAATGTTGACAGGGAACGTCTAGGTAATAC
AAATATGGTGTATAAAAGTATTTAGCCACCCTTTGGACCTTCTCAATAATCTGGACTCAA
AACAAACAAATCAAAAGTCCCTTGTTTGCACCTTTAGCAACAATTTTAGCCATTAATCTA
TCGGACTTATTTTTAAGCCACCTGTGTAACTGTGTAACTTTAAGTATACATGGAAACTAA
ATATCCTAACAATTCTCTCATAGGCTGCAGCAGCTTCTTCTTTAAAGGACTTTACAAGCC
TTCCAGGGTCTGCTGCAGAGAGGCATCCCCACAGCATGATGAGGCTGCATGAGATTTACA
GTGCTCTCACATTTTTTCACATTTTTTTTAATAAATCTCCTTACTTTGCTCCAAGAGCTA
TACACAGCATTGGATTTTTTTTGTTTGTTTCATTACTCTGGTACTTTATAGCAATTTATC
CTTTTTCTAAGTAGTAGCTGAATTTATAACCTGTAAGTATTTATCCTAATATTACATGAC
AGATGGCTCTCACACAGCTGAATTGTGATAATTCTAAAACAACTGGCTACGCCAGTGATA
ATTTAGGTGTGTTATAATTGAATACTTGTGCAGTTATTGTTTCATAATTTGCACTTAACA
CTGTACTATTTTACAGTTTTACATTTCAGTTTATCTGCTGTTGACCAGTGTCAAAAATGA
AAAAGTCCAACGGGGCCATAGGCTTTTATAGGCACTATTCACAGAACACAAAGAACTCCT
GACAAAATGACACAAAACACACTCACGCTCACACATTTGTCTAAACTCAGAAAGGATATG
AGGTCGTAAAGGTGCTGCCATGCTCGTCAGTCTGTGTGAAAATCAGACCTTTGCTGCTGT
GGCTGACTGGGGAGCTAGTTATCAGTGCATTACAGTGTTAGTGTGCATCTAACATGTTTT
TCTGGGGGGAGGGGACAACAACAGGAAAGAACTAAAAAACACACATAATATGTGTGTTTT
TGCTCAGTGTCTCACATATTATGTGAGAAACAGTAACGCTAGCTGAAATGTTAACATATT
TCAAGTCTGTGGATTCTTGATTGATTGGAAAGTTTGTACCTCTCCCTTACCTCAGCCACT
GCTGTGGTTTCATTGAGCAAGGCACTTGACCCCCATCTGCTCCAGTAAAGATGCTCAGTG
TTGTACTGGACAGCTCACACAGTAGGTCTACAGCACTGTCTGAAAACATCATGCATCCTC
TGAACAATCTAAATAAATAACTTGAACTGCATTGAACAATAAGGTATCCCAAGTAACCCC
CCTGTGACACAATGTCCCCTCCTGTTTGCTAGTTTTAAATCTTTTCGATCAGAATATGGT
ACTTTACACTCATATTAAGTAAATACACATGTACATGAGTGCCTTTTTTTTCAGTGCAGT
TCCTAGGCTTCTCCACACAGGGTCACTGTCTCACACATGTTCACAGTCTCAGGCAGAGGC
ATCACTGGAGTTTCCTCAACCTTCAAAGACAACGTCACACAGCCCGGTCAAGCTTTACCA
ATTTGATTCATTCGTGTTCAGTTTTTGTCTCAATGTACATCAATGCTATTTGACACACAC
TGTGTATCACCTGTTGCAGAGTTTCATCCGTTTCTGGTGCAGTTTCTATAATAGTGCTTC
CTTTGTTGTACTGGAGACTCCTGTCTGTGCTCTTCTTCATTAGTGCTTTAGAGGCCAACT
GTATGGGAGTCTCTTTCCCAGGTACACCTGTAGAGTGGAATAAAAGTGGTAAAAAAAAAA
ATGTCATACTTTAAAAAACAAACTTTAAAATCATTGAATTAAAGGAAAGTATCTTCTTTT
GAGGGAAAAACATGGAAATGAGAGCAGCAGTTTTAGAAATCAACTGAAATGTCACAGTCA
GGTGGTTTTGTAGAGTCACCTGATGTTTCACTCTCTTGAAGATGGTGATGTTTAGAAGAT
GTGATGTTATGAGCTTAGCATGTCAGGATGGACAAGAGTGACACAACGTCTGGGGACCTT
GAATGTCAGTACAAAATTTTGTACCAATCCATCAAGCAGATGTAGGAATAGTGCACTGGA
TAAGTGAACATTTTTACATGATAGGGATGCTAGGATGTCAGTACAAAATCTAATATATCT
GGCATATCTATCTAGTAGTTGTTGAGATATTTCAGTCTGGACCAAAGTGGTGCGTCAACT
GAAAGACCGGCATTGCCGTCCACAGTGGCTCACAACTAGCATGGCTAAAAAATGGCCATG
TAAGATCATTTAAATCTTTTTATTAATTCTACTTTGACTGATGCAGTCATTAGTCAGGTA
GCTCCCTCTGGATTAAACAGAATTAATAGCACAACATCATGTGTACGTCTACATGCCTGA
CAGTGGCAGGTGTCGATGGAGGCCAGGTCTAAGCAGCTTCCAGACCTTCATGGTGGCTGA
CTCGTCCTGATCTCCGGATGAGGCTGGGTTAATGCTTGTAGGGGATGTTTTACTGTCATG
TGTAGGAGGGGTTTCAGTTGACCCCACCCGTCGGATGGGGATGCGACTCATATGAGGTTG
CAGCTCACACCTGGGCAGGCAACAGAGAGGTTAATATTGATCACCACTTTGATAAATAAT
AGCAGGAATAAGGCTAATGTCCATAATATACATTGTTCCATAGTAACGACACAGTCTTCA
TTATTGTATTGCACTGTTCTCCATATGGGTCTTCTTCTTTGGCTTAAAAATGTTCACTGT
GTGATTCAAACACTGCTTCAACATACTTAGACAAGGTTCGACTCACTTGCTAAATTTGAT
GGAGGAAAGGATGTGTTCAGACCCCAAGTCTTTAGCAGCCTGCGACAGATGGAGACATTA
AAGCGATACTTCATAAACCCGAGTGTATGTTGTGCATAGGAAAAAAAAAAAAAATAGTAA
TACAAGAAATGAGGAGAATTTCTGCGAGTGAGCCAGCAAGGGTCAGCTAACCTCTGTGCA
GGCCTCTGCAGGGTGGCGAT
Chart Advanced