SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003235_2.0
Identity
PromoterMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Promoter IDSPR00003235
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003168_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003235_2.0 # Promoter # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) Full length # Reverse
ATGAAAAGGGACAAAATGTTGAAGTTATTAACAATAAAACATTTATTTAGCAAACGTTTT
ACCTGTTTTCTTCAACTCAACCAAATTACAAAACAAGACAAAATGAGTGGAAAACCACAC
GTTTATGTCCAAAAGCCTTGGGAAACATGTTAGAGGAAATGGCATCCTAAACACTTAGAA
ACAGTCAATCTGTTTTAAATAAAAGTCTGGTTGCATCTGTCAATAAACTGAAAATTATAG
GTTTATTTTAAAACATAATGATTGAAAACATACAAGCAAATCAGCACAGCAACAGACATA
CAGTATATTCAATAACCATCTAGGTCTGATATTACAGTCAAATTCTATAAATTAGAATAC
ATGTCCCAATTCTTCTCTATTGTTAGATTTAAATTACCTTTTGAAAACCTTTAAGAAGAT
AATAAACATATTTTTAACACACCAATTTTGAAAAACCTATTTTTTTGCATCTAATCAACA
ACTGGACGTTACTACTGGCAGAAAATATGATGAAAATTACAAGAAATGGTAGGAGTATGA
TGCACGACATTTTTTTTGATGACTTCTCGCATGAACAAACTTATTCAAGTGTGATTTTAA
TTGAATTTCTTATTTAATCGAAACGCCACACTTGCAAAATTGTGTTATTTCAACATGAGA
CAAAGTTTTACGAACATTTTTAATGGAAAAATGAGTCCACTGGTTTAATTGGCTTAAAAG
GGAATTTTTTGTTATCAGTATTACACCATGTTATTATTCTAAAACATAAATACAGAATAC
AAGAGTAAAAAGGTTATAGGAACTGTGAAAATGCAGTCTGAAAGCATGCAAATTCACAAA
ATATTCAAGTTTGTTTCCCATTATTCTTCCCTTTCAAATGTTTTGATGCATAAATGTTCA
GCTTCCTCCTCACTAAAGACGTACATGTTTATTAATGGAGAACATACAGAGAAACCCAGA
ACACGGCACAAAGTCTACCTAGAAGCTGAGAGTACACACAGTGACCCAGTTAAAAATTTT
CAGAGCAGCTGCGCTCAGTCCAATCAGCGGCGAGCCAGAGGTGCATGAGGACGAATGCGA
GGCCGTGCAGCCACCTGGCTGAGCCAGCGCGCATTAACTTTGGCTTGCTGCGGGCTGCGC
GCGTGTGCAGATGGCCTACTGAGGGGGAGGAAGATGGATTCAAAAAAAATTGGAATGATG
GGGGGAGAATAAAAATGAAGCAAACATCTGGATCCACACACACACACGTTCAGCGTCTTC
ATGCATAGATGCATAATTGTCATGAGGGCGGCATGCTGATAGACAAAAGCTAGAGAACGG
GTGCAGCCAAGCAATCAGCAACACACACGCAGGGTGATAATCAGCTTGAGGTTTCTGTTC
TGCTCTCAGCATTCTCAAGATTTGCAAACACGCATCATCTGCATCTGAGTCAGTGAGTTT
AGTCTGATTGCATGAGGAGCCTTTTATTGTGAAGGATTCGGATGCTCCGTACTCTGCACA
GGGAACGTTTCAGTTGCTGCAGGGAAAACATCTCAGCCTCTTTAAAGAGGATTATTCATG
TTCCTGAAGTCACTGCTGTTTTTTCAGAACAGCATCCATACATGCAAAATTCATGTGTAT
TTCTTCTGAAAACTCCACCTTTAAAAATATCTTTCTACATATTTTTTAAAACTGTCACCA
TGTCATGATCGTTTGCTATGAGACAGATAATCTGTGAAAAGACTGATCTCCTCCACCTCC
TTCCCATTTTTGAAGAAATACACCAAAAACAACCAATCAGAGCCAGGAGGAGGGCCTTAG
TGCTGTCAATCAAGTTTGTGTACTTGCAGCTAAATGTGCTAATGACAAAGAAAACTGTCT
ATCTGCTGTCATGGTTGACTATGCTAACCAGCCTTAGCTAGACTGTCATTGACAGCGCTA
AGACCCGCCTCCTGGCTCTGATTGGTTGTTTCTAGTTGGAACTTGGAAAAGGCAGAGGAG
TTTGATTTGTTCACACATTACCTGTCTCATAACTAACTGTCACCTTGTGACAGTTTCAAC
AAATTTGTAAAAATTACATAAAGCAGCTTTAAAATGAACAATTTCTTAGCCTAACAATCC
CTACAACATGACAAATATATACTTCATATAAAAAGTATTCAACCCTTTTCATATTTCATA
TTTTATGTCTTCTAAAAATCAATCAAGATCAACATAATTTGGATAGCTTATAAAAAATAA
ACAAAAAACATTGATATTAAAATGAAAAGTAATTTCTACAAAATAATGACTCAAATAGTC
ATCTCCTGTAGAATGACTGACCTAATTCAACAGAGGTCCATCCAATTGGTGCAAATAGTC
TCACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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