SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003272_2.0
Identity
PromoterSelenoprotein T (SelT)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Promoter IDSPR00003272
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003205_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxForward   Reverse    
Sequence
>SPR00003272_2.0 # Promoter # Selenoprotein T (SelT) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) Full length # Reverse
TTCTCCAAGCTGTGGCAGCTAATAGAATAAACCGGAAGTCGCCGGCAGGTTTAAAAGGTG
GAAATAACGCGCTGTGATTGGCTCACAATCCAGTGACGTGTATTCTGATATCGATTAGGT
GACGTGCTAGCAGTTAACTCCAACGTAAAGTCAATTTTATATATTTGTTTAAACTTTTCA
AATATTGTTAATATATTTGTTTTATTTATTCTGTCTTTTTAAAATAGTTTTTTTTAAAAG
ATTATATTGTTTTCACCCGATTTGTTTACATGCGGGTCACTAGGGAAGTCCGCCATTTTG
CGACTTTTCTCTTTTTTTGTTCTGCATATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGGACA
TTTGTATACTTATGTCAAACTTTGGGATATATATTTCGGGAAATATACATGCAGTACTGT
GCAAATAAAAACTGTAAACCATATATGTTTTTAAACGTAATTAAAACTAATAGTTTGCAC
GTAAATAATTATTTAAAGAGCAGTAATAAACTAAACAAAGTACAGTAAATTGGTGCAGTT
TTTTTTTTTTTTAAATTCCTTTTCTCACATAAAGATTCTGATGATGAGTATACTGGGAAT
AGTATGCTTTTTTTGTGTAAACTTTTCAAAATGATCCCCAAATTTAGTCTTTAACAACCT
AACAAGCCTAACAACTGTTACAAAAGTTATTTATTGTATGCCTTTTGTATTACTGTGTCA
ATAGAAAAGAGAAAATCGTGGATTTTCAATATACATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTGT
CTGTCTGTGAACACTTTGCAGATAGAAAAAAAAACATAAGTGAGGTTGATATTATTAGCA
ATGTGAGCAAATGTGCAAAATAGCAAGTGTGAGAGTCAACATCTCCAAGGCCTGTGACAG
GTTCTCCAAGATGTTTGGGAAGACTTATCGGCCAAGACAGCTGAAAAACGAGGTCACGCC
AAATACTGATTTGGTTGCATTTTTATTACATTTACTGCATTTTGCAGACGCCCTTATCCA
GAGCGACTTATTACTGTTTAGTACTTTTTACATTTAATTTATTTGTGTAAGCTATTTATG
TATGCATCTTTCATGCGTCAAAATTGTATTGTATGTACTGTGTATATACTTCGTAAATTA
GGGATAAAAGCATCTTTTTTAACGCATTTTGTATTTTTGTTTGTTTGTTTATCGCCACTG
ACATCAAGTGTTACTTTACATGTATGCTCAATTCCCACATGGCTTCTTCCTGCCTGTATA
AGTGCACTAAGCATGATACGAAACAGTGGCTGTCGAGCTGTATCTAGTGCACTAGACTCC
CAATAGGATTCCGTTTCGGATTCAGCCTTTTGGCTGATTGGCTGCATCCACACAAACTTC
CGGTAGGTGGGCGGAGTTACGTTTGTGAGTACGTAGCCATAAAGCGAGACAACTTTCTTT
CCTCGTTACCTCGAAATCCTGTCACAGATTTTGGACGCGGTTTCAGAGAAGCAGTCTTTT
TAAACACAGCAACGTCAAGATGGTGGCAAAGCAGAGAATCCGCATGGCCAACGAGAAGCA
CAGCAAAAACATCACGCAGCGAGGCAATGTCAAATCGACGGTAAGCCGCCCGTATCCATG
GAGATGTTCAACGTGTCAGATTTAGAGCTAAGCTAACTTACTTCCTTCTAAACGGGGACG
TACAAGAGGCACAACATTTCGTGAAGTGAAACATTAAAAAGCAACAATAGCTTTGTCTGA
ATTTTGTTTTGTTCCACTTTCAAAACGGCAAAATCAAACTTTTAAGTTAAAAAAATCTAG
TAATGGAGCTTTTATTAACGCCGCGTATAACCATTTTAGACGGTAGTTAAGTCAAATAGT
GCGCAACCATAAGCGGTTTTGAACGAGGGTTTGTGTCATACTTATTAGTATGGTACTCCG
CGGTTTCGCACGTACAGCTTATTGACACACTGTTTAGTATTGTAGTACGTAGATTTGGTA
CGTAGCTGTAGTATTAGTGGCATACTGGTTAGTATGATAGATTTAGTGGCATACTAATCA
GTATAATAGTATGCAATTTTGGAACGTCGCTGTAGTTTAATGGCATACTAATTAGTATGT
AGTTTTGGTACGTAGCTATAGTATTTGTGCCGTAATAATTAGTGTGCAGTTTTGCATGTA
TAGCCATGGCCTTATTGACATACTAAATATTATGGTAGTATACAATTTTCTATGTAAAGC
TACCAACCTATTCACATACTGTTTATTATGATAGTATGCAGTTTTGAAACGTAGCTAGCT
ATATTGACCTTCTAATTAGTCGCGGTTTTGTACACAACCAGGAATATAGTGACACCTTTT
GTTTTTGTTTATTTGTTTGTTTATTTACAGTACCCCAAAAACGGATGGAAAACATCAGAT
TGTTCTACTTAATATTTGATGATCTGCCTACTAATAAAATCAGGCTCAAAAATGTGTTCA
GATAAGTCATGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCCCCTCAGTATGATTGTAGAAAGTATAA
AGTGTACATGTTATTAGAACCGTCCTAATATTATAGACCGACGACACGCTCGTGTATTTT
GACTAACAGCATTAGTAAAATCAAACCTTTTTTTTAAAAAAACTTCTGATTCCTTTTGAA
ATCAATCACTATTGTGAGATGTTCTTATCTTAGCAAGAAATATAATGCGAAAAAATAAAG
AAGCCTCTACATGCTGATAAATGTCTACAGAGGGGGGGGGGGGTAATAGTATCATGGCAT
GCTAGTATCATGAGGAAAAATACTTCCAGATCAGAATATTATATAAAATCAAAGGTAAAA
AAAAAAAGAGACTATAAAGTCTGTGTCATAACGATGTTTACCACATGAAAGTTGTCTGTA
ATTTTATTTACGTAAGAGTTTTCTTCTGCAGAAAAACACCACGGATGACAAAGTCTCAGT
GGGACCATGGCTCCTGGCGCTTTTTATCTTTGTCGTGTGTGGGTCAGGTGAGTGCGTGCT
TTCCCACGTCAAAATCAGACCTCTCAGTTTTTGTCCTTGTATTCGAGTTAAAACCATGAT
AAGCAAGGTTGGCCTGATGGAAAGGTGTATTTGGATGCAAAACAAAGAAAAAACCCTAGC
AGGTGGAGCTGCTCTCATAACACTATTTAGAAGGAGAAATGGTCCAGCTGTCCGTGTGTT
TGTCCAGTTTGTGTTCCAGACTGTATTTGCATGAAATGTTTGACATTTTCTCACATGCTT
TTGTTCCCCTGCTTTTTTTCCTCTTGTTTATCTGCTCTAGGTTTTATCGCCCTTGAGCTC
TGGCAGACTTTTATCTGATCTCAGCAGATCTGTCAAACAAACAAACAAAATGACACTGTC
TTTCTCTCAGTTCCTCTCTGGAGCAAAAAAGTAGTTTGAGAATCCAGGCTTGCTCTTTAT
TAGAACTAATTATTGAATTAGTTCAAGTAATAAAAAATACATTTAAAAAATTTTAAACAC
AAATTTTAGAAAATAAAGTGCAATTGCAAAACCTCTGAAATGAGGACAGATTTTCTTACT
TCGAATGTGAAAAAGTAAATGTACAGCCCCAGTTCCAAAAAAGTTGGGACACTGTGTAAA
ATGTAAATAATAACAGAATACAATGATTGTAAAATCTAAGATTCTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATACCCAATCATCTTACTGACCTGTTGCCAATGA
ACCTAATTAGTTGAAAAATGTTCCTCCAGCTGTTTCTTTTTACAAACACTTACTTTTCCA
GCTTTTTGTTGTGCCTGCCCCAACTTTCTGACTCGTGTTGCGGCCATCAAATTCAAAATT
ACCTTATTTTTTCCTTAAAATGGTACATTTCCTCATTTTAGACATTTGATATCTTTTCTG
TGTTCTATTGTGAATAAAACATGGGTTTATGAGATTTGCAAATCATTACATTCTATTTTT
ATTTACATCTTACACAGCATCCCAACTTTTTTGGAATTGGGGTTGTATTATTAGAAGTAT
AGTGTCCTTGTGGCACCATGCCATGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTAAATGT
ATTTATGTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTAATGTTTTGGGGGGGGGGGGTAAAAGG
GACATTTGGTCATAGCCCTAGTTAAAGCCCCCCTTTTCAAGTTATACATGGTACTTTTGT
ATTATTGTCTATCAAAAATTTGGAGATAAATTAATTTTTGCCATATGCCAACACTATGCA
GAAAAGGGTTATTAGCTCAAGTGAGCTACATTGGATAAGCCCTTGAAGGTCGAACGTTTT
ATTTAGCTGGTAAACTGTTTGGGGTATACGAGGAATACTTCAGGTCATGCTGCTCTAGGA
AAATATCGCACACTCAGTTTGGTAGTTTGCAGTAATAAAAGTTTAATCTTGGCCCCTTAT
TTAATGGGACTCTGTTGTTGTTTTTTTGTCTCCGCAGCCATATTTCAGATCATCCAGAGC
ATCCGAATGGGAATGTAACAGGAAGTACAGATGCACCGCCCAGCGACGACTCGCCATTCC
TACGTACTACTTCCTGCTCCTTCGCAATAAAGGAATTTCTGTCCGCACCTTCAGTTTAAT
TTGAGCGATTTCTTCTGTCTGAGGTCGATCGGCGTGCGATTCCTCTTCCTGTGCCTTATT
ACCATGAGAAGATTTCATCAAGCAATTAACTGCTGTCCACTACGCTTTGTTGTTTCAATG
CAGGCTAAGATGTGACTTGTCTTAATTTCTTACATTCCTCTGGAGCATGTGGTAATTTTT
ATTCCTAGATGAAGGCACTTGATGTATCCTTTCTTTTAATATTTAACTGACCAAATAGTG
GGAAATTTGCACGAGGTGAA
Chart Advanced