SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Promoter Report for SPR00003342_2.0
Identity
PromoterN/A (N/A)
SpeciesMus spretus (Western wild mouse)
Promoter IDSPR00003342
Promoter release2.0
External IDNone
Transcript SPT00003275_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Promoter prediction (5000bp upstream, N/A) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

Toolbox
Sequence
>SPR00003342_2.0 # Promoter # N/A (N/A) # Western wild mouse (Mus spretus) Full length # Forward
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TACAGTGTTCTGGGAAAAGATTTACTATGTATACAGTGTTCTGCCTGCATGTAGCAGGCC
AGAAGAGGGCACAGATCTCATTACAGTGGTTGTGAGCCACCATGTGTTTGCTGAGAATTG
AACCCAGGACCTCTGGAAGGACAGTCAGTGAGCCATCTCTCTAGCCTCTGATTCTCCTTT
TTCTACCATCTGAGTCCTGAGAGCTTATGCCACGATACCCTGTTTTGTTGTTTTTATCTA
TAGCACTGGCTGTCCTGGAACTTGCTTTGTAAACCAGGGTGGCCTTGAACTCAGACAATC
CTCCATCTTCTGCCTCCCAAGTGCTGAGATTAAAGGTGTGTCAGTACCACTCGGCTAAAG
CCGTTTATTAAGGTAGTGCTCAGGATGGAACACAGGCTCTCATGCTAGTCTAGAATGTTT
CAAACTGAGCTCTCTAGTGAGGCTCTCTCTGGTACCCAAGCTGGCCTTCAACTCAAAGTG
ATCTCATATCCCCCTCTCAAGTGCTGGATTTACGAGTGTATACCACCGTGCTCAGCAAAC
CCAAACTTCTGAGCATCAGTGTGCCCACAAAAAGGCATATTGTTAAATGAGATGACACAG
GAAAGATACTTAGTATTCAGTTGAGATGTTACTGCCCCCTGAGGAGTGACCCAGTGGGAA
GGTATTGTCCCTGCACCCTGGGGTCTGCACATAGGGCTCCCTCCCACTACTGCCTCCTAA
CTTGGCTGCCCTGTTCCTGGCTTGGTGTGGTCTGTCTCCCTGTAGGGTGGCTTCCCCCAC
TACGGGGAAGTGAACAATGACTTCATCATGTTAAAGGGCTGCATTGCAGGTACCAAGAAG
CGAGTGATCACTCTGAGAAAGGTCAGTGCTGCTTGGCAAGCTGGGGAGTGGACTCCAGTG
GCCCGTTCTGTCCTTTAGCGTGCGCTGCGGTGGGTTGTGTGGTGGGAGAGTAAAGGAAAG
GGTTCTAGCAAGAGCGAGGGATTGACTGAGTCCTCCTTGGTGTGAACTGGAGGTCACAGG
AGGAGTTGAGGCCCTCTGTCCTTGACATCTCTTCTCTCTTGGATACCCAGTCCCTTCTGG
TGCACCACAGCCGCAGGGCCCTGGAGAATATTGAGCTCAAGTTCATTGACACCACTTCTA
AGTTTGGCCACGGATGTTTTCAGACAGCGCAGGAGAAGAGGGCCTTCATGGTGAGCTAGT
CCCACTTGTTCCAGAGAGGAACTAGAAGAAGGGGTATTTTAGCAAACCAGTAGAGCAAGC
CCTAGGTGGCCCTGGCACTGGCCGTAGGTAGTATTTCTTGACTGACTCTCCTAACTAACT
CTCATCCTGTCTCCTCACCTTAACCAGGGTCCCCAAAAGAAACATCTGGAGAAAGAGAAG
CCAGAGACCTTGGGAAACATATAAGATGTCTGGAATGGAGCACACCTGGGATGTAGCGCT
CTTGCTATCTGTCCGATCCTTTTTGTTCAATAAAGTCCTGAGGCAACTCTCTCTGTCTGT
CTCTGTGTGTCTGTCTCTCTTCCACATTCCCTGGGAGGCTTGATGTAGATCTTAAGCCTG
GGTCGGAGGTTGGGTGATCCCAGACGCAGGCGCAAGGTTTAGCGCCAGATAAGAGGGCTA
TAGATACAGCTGGGTAGATGCGCCTCCACGCCAGTTGCACAATGGTATTAGTAGTAGCTA
CCATTGGCTAGTACCATTGCTATGTTTATAGCCTAGCCGCTGTACTGGAGCTTCGCATAG
GTTTGGCCTTCATCGTAACAGCTAAGCTTCCTGGGAGCGGCTCCCTGGGCGGGGCCTTCT
AGAGGCGGAAGTAAGGACGTGGTCTCTGGGTAAACTTGGCTGGATGGGTGGGGTTTAGGG
CCTATGGGAGGAGAGACTCCTTGAGGGCGGGGCTGCTAGGAGGCGGCTGTGGGGAATCCA
AGAGTGGCTGGTCCTCTCTAGGGGCGGGGCTTATGGCGAATCGGAAAGTGATTGGTTATT
GGGACTGGGTCGGGTTTGAGTCCAGATCTTAGGGTTTTACCCGGACCTGTCCGGGAGCTT
TTTCCTGTCCCGTCACGACC
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