SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000138_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesHomo sapiens (Human)
Transcript IDSPT00000138
Transcript release2.0
External ID ENST00000373830.3 (Ensembl)
Gene SPG00000041_2.0
Annotation
Prediction method(s)
Curated external database annotation (GENCODE, 15) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR   SNP    
Sequence
>SPT00000138_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Human (Homo sapiens) # Full length # Forward
GCAAAGCCCCACCCCGGTGCGCGGGTATGGCGGCCAGCCTGTGGATGGGCGACGTGAGTG
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TCTGAGTGGGAGGGGACTTGGGATCCCAGAAAGGGGAGACGTGTGACGGGGGTTCTTTTT
GGTGACACAGAAGCGGGTTCCAGCATCTAAGTGAAGAGGCTGAGTCCGTGAGGCTAGGGG
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GAGCAATCCAAGGACTGAGGCGCGCTGTTCTGGGACCGGAGGAGTGGGGTTTCTAGGTCC
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TCAGTGGAGGCGAACCTCGCCCCTCGCTCCCCCAGCGGCGCGTAGCCAGCCCTGGGCTGA
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TGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGTAC
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AGTTACTTAACTGCTCTGTCTCATTCACTTTGAGTATAAAAATGGAAATAACAGCACCTA
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GTTTACATCCATTATCTCCTTAAAACCTCAGAAACTTCTGAGGTAGGTAAATACTATTAT
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TCTAAGCAGAAAACCCCAGATAATCAGCTACTGGTATGAAAATTCATTCTGTAACCTTTC
TCATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTGGCCCAGGCTGGT
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TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGATGGTCTCAATCTCATGAC
CTCGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCG
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GTGGTGAGACACACCTGTAATTCCAACTACTTGAGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGTTTGA
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TAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGGCATAGTCTCCCTCTGTTGCCCAGGCTGAAGT
GCAATGGCACCATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTTAAGCCCTTCTCCTC
TCTCAGACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAAGCACCTGCCACCACGCCCAGCTCATTTTTT
TTGTTTGTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCAGGAGTGCAGTGGT
GCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCT
TCCTGAGTAGGTGGGACTACAGCCGTGTGCCACCACATCCAGCTAATTTTCTGTATTTTT
AGTAGAGATGGGATTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTTCTGACCTCTGCCTG
CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAATTTTT
TCTATTTTTAGTATAGATGGGATTTCACTGTGTTGGCCAGGCTAGCCTCGAACTCCTGAC
CTCAGGTGATCTGTCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGATTACAGGCATGAGCCACTGG
GACCAACCTTACTGTTTATTGAAATAAGATATGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTGTA
ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATC
CTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAGAAAATTAGCCAGGCATGG
TGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCC
GGGAGGTGGAGCTTGCAGCGAGCGGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAA
GTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAGAAAAGAAATAAGATATGGAACTCTTGTTTCTTACAT
GTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGAC
TATATTACATATTATTTTTCCTTGGGTCTTATCTTTTCTCCTTTTCTATAATCTTGGTGT
TTTGTTTTGTTTTGTTTTCTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAAGCAGGAGTGCA
GTGGCGCAATCTTAGCTCACTGCAATCTGCACCTCTCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCCT
CAGCCTCCCGAGTAGCTAGGACTACTGGCACATACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTAT
TCTTATTACAGACAGGTTTTCACCATGTTGGCCAGGATAGTCTCGATCTCTTGACCTCGT
GATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCTCCCGG
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GAGTGCAGTGGAATGATCTCGACTCACTGCAACCTCCACCTCCCAAATTCAAGCAGTTCT
CCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGTCATGTGCCACTATGCCTGGCTAATT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGAACTC
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CTGTGCCCAGCCCGCCCTGCTAATTTTTGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGT
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CCGCGTTCAGGCAATTTTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACAC
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TCAGTCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC
GTGAGCCACCGCGCCTGGCGAAACTGGACGTTTTCTTACATAACCACAATGCTTATATCA
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TTTATAATTGTCCCCACAATATTGATAGTTTTTCATTTATTAGTGAATTATAATTCAATC
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TTTTTGAGACAGAGTCTTGTTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCT
CACTGCAGCCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCGAGTAGCT
GGAACTACAGGCGCCTACCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGAGTCTCTTTTAATGTATAA
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TTTATAAGAGCCTATATTCTGAGGCTGGGTGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCTAGCACT
TTGAGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAAT
ATGGAGAAACCCCATCTCTACTGAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCT
GTAATTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGTGGAGG
CAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGTCATTGC
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TCTGCATTCATTTGTTTACTTGTGGTGTTTTGCATAGTCTATCTCTAAAATTTCCTGGAA
CTGGTTATTAGATCTAAAGTCTTGATGGGATTGCATAATACAATTTTGACAAGAGTATTC
ACACATGATAAAATGCATAAATGAATGTTTACTAAATGAGTCTGGGGCCAGGTGCCTTGG
CTCATGCCTGTAATCCCGGAACTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCTCCTGAGGTCAGG
AGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATT
AGCCAGGCATGGTGGTGGGTACCTGTAATTCCAAGTGTTCATGAGGCTGAGGCAGGATAA
TTGCTTGAACCTGAGAGGCAGAGGTTATAGTGAGCTGAGATCGAGATGATATCCGTCTCA
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TATTCAGGCTTGTAAATTAGGTCTGAGCTGGGGTATGGCAGGGAACAAAAACAGTGTTGG
CTCAGATTAGAAAAACATTTCTTTCTCCCTTCAAGGCCAAGACCCATCTTGAGCCTTTTT
TTTTTTTTTTTTAAAACAGTCTCAAACCAGCCTGTTGCTCAGGCTGGAGCAGTGTGGCAT
GATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTACAGCAATTCTCCCCCTCAGTCTCC
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ATAACCGAAGACTTGAAACTCTAGACCTCTTGCCTGATTGGGAAACTAGAATAGGCTGGC
AGCAGCAAGGACACATTTCAAGAGAGTTGCATTCTGCTCTTCCCACAGTTACTTAGCTTA
CAGCTGCACCAGCTGGCACACCTGGGCTCATAGAACCATGGAGCTGGCAGTGCCCTTAGC
GGTCATCCGTGCAACCCCCTCATTTTATACAGGAGAAAAAGCTGAGGCTTAGAGAGGGGG
AGATGTTTTGGCCAAGGTAATTTATTTCAGTTTTCTTCAAATATTGTTCAACTCTTGAAA
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GCACTTGGTTCCCTCCTGAAGGACGACGCTCTTCTCCCTTCCTTGCTGGTGGACCTTCCT
GGTGTGCTTCATGCAAGACCCTGGCTTTTCTGTATTTGGTCCCTGCCCCTGGCTTCCTAC
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GGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC
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GTGAGCCATGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTTAA
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TTCATTGAAGTATTGTGTATAATAGCTAAAGTTGGGGAAAACCCAAATAACCTAATAGTA
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CAGTATACTGACATGTCAAGATATTGGCAATATGTTGAAAATGAAAAAAAATACTAGAAA
CAAAATACGATGGATCGTATTTATGAACATTTAGAAGAAAAGCCACAAGAAAAGACAAAA
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GGCTGGCGTGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCC
GTTCTCCTGCCTCACCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGC
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TCACTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAATCTTTGCC
GCCTGGGTCCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCT
GCCAATGCGCCCAGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGTC
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ATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCTGGCCTTGTGTATTCTTATTATACAAGGAATATGTA
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TGAGGCCAGCCTGACCAACATAGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTGGCT
GGGCGTGGTGGCTTACACCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCCGAGGAGGGTGGATCAC
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GAGGCAAGAGAATCGCTTGAACCTGAGAAGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCA
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CTTAGATGCACTTCTGACCCCATCCACACATCTGCACTCATGTAATACTTGAAGTCAGAC
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GGACTGCTCTGATGAAACAAAGTAGGGGCTGGTTAAGTAGACCCATCAAATGTTTTCCTT
AAGGGGCCTGGGAGAGGTTTACCTGGAATATGCAAAAGAGCTTTTCAGAGCAGAGGTTTT
GGTCTTTGCCTCTGAATCTTCTTGTTCTCTCTCCTCAGCCCTGAGTATTCCCTCTTTGTG
GGGGACCTGACCCCGGACGTGGATGATGGCATGCTGTATGAATTCTTCGTCAAAGTCTAC
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TAGAAAGGCCCTGCAGCATGGCGATTAAGACCACAAGCTCTGGAGCCAAACTGCCTGGTT
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GACCCTTACAGCCCCATCTGTAAAATGGAGCTGATTAATAATAGCTGCTTGTAGGGTTGA
TGTAAGGATTAAAGGATATAATATAAGTAAGTCACATTTGAAATGCTTTATAGGTGTTTG
CTGTTTTGCTTGTTATTGTTACTGAGCCTTTCAGTGTAGTTAGAAGTGTTCCACTTCAGG
CTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCTAACACTTTGAGAGGCCCAGGTGGGTGGATT
GCGTGAGCTTAGGAGTTGGAGACCAGCCCGGGCAACACGGTGAAATGCCGTCTCTATTAA
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TGAGGTAGGATAATTGCTTTAACCTGGAAGGCGGAGGTTGCAATGAGCCAAGATTGTGCC
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AAAATGGAAATCGAAGAACCTCAAGAAAGGCTCATTCTTGGTCAGTATGGTAGTTATATG
CTCAGGCTTTGAGAGTGCAACAGGTGTGGCTTTGAATCATGCTTCTGCCATGACTTTGGG
CAAGTTGTTAAATCTCACTGAACTGGTTACCTCTTCAGTAAATGTGGATACCACTTTCAT
GGAATTATTAGACAGTTTGATTAGATCACCCTGAGAAAATGCTCAGCACAGGCTGGGTGC
GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCGCTTCGGGAGACAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTC
AGGAGTTCAAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAA
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TGGTGGCTGACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGATGGATCACCTGAG
GTCAGGAGTTCGAGACCAGTCTGGCCAACATAGCGAAACCCAGGTCTCCACTTTAAAAAA
AATACAGGCCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG
GGTGGATCATGAGGTCAGAAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTC
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GCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGAAGAATGGCGTGAACATGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGA
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ATGTTAGCTTGCATTAATTTATTCCTCTGCTAGAATTTGAGCTCAGGAGAGCAGGAACGT
TGTCTTTCTGTGACTGCTGCATCCTGTGCGTAGCACAGTGCCTGGCATACAGGGCAGACT
GTAAATATTTGCTGAATTTTCTTCTATGAGTTACTTTCCAGCAGGGTGTCGGGGAAGCTC
CTATTTGGGAATGTTCCCTAGGGGTGAAGGTGTCGAGGAGGATGGTGAACTGAATGTGGG
AATTCCTGCAGATATTAGAATTGTTTGTACTTGGATCTTGACACTATGTGGACACCTGTT
GATGGGACTCTCCTTTCTTCCTCTAGTTTAATGGACTCTCTCTTTCTCTTCTCAGCCTCT
TTTCCTTTCTACATTCCTGCCCACCTTCTTATCCTTACTTCTTTTTCATGTGTCCATTCT
TAGACTTTAATCACATTTGTGATCTAAATTGTATATTTTTTTCATGCAGGGGTTATGGTT
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TGGGACTGGGGTCTAAGCCTGTGCGGCTGAGCGTGGCAATCCCTAAAGCGTGAGTCCTGC
AGGGAAGGTAGAGAGACTCTAGACTCCCCTCCAGACACTCCTCTTTTGTTTGCTGAGAAT
CAGGGCATCCATACGCTGGATGGGAGGCTGAAGGGGATCCAATTCAAGTCACAAGTACTG
AATGCCTGCTGTTTGCCAGGCTGTGGGTGCTGGGGTTGAACTAGCCCCACTCCTGCAGAA
ACTTAGAGTTGGGGATAGAGTATGATTTGGAAAGGCTGATGTATTCAGACATTACTGGTG
ACAGCATTGGAAAAGCTGTTTGGCTGTCCATACCTGATGTCCCTGTTCTTTGCCCAGTAG
TCCCATTGTTGGGAACTTATTCATAGAATTAATAAGATTTGAATAAAGGGGAAAAAATTA
CTTCCATTTTTAGCCTTATTTATATTAATGAAACTACAGCCCTCCTATGAGTGTTCCATG
CTGTGGGAATGGATAAGAATTAGTATTCCAGACACTTGGCCGGGCGCAGTGGCTCACACC
TGTAACCCCAGGACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTCAGTAGTTCGAG
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ATGGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAACAACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA
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CGGAGCAAGACTCCGTCTCAAATAAAAAAGAAAAATTTTCCAGACACTCTACAGAACATT
ATATACTTCACTATCACACCTGTCATGCTAGGTAGAAAATCTTCTTCCCTTACAACTCCA
AACTTTTCTCTGAATGGGATTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCCCTGAGTCAGGATCTCAAA
GTCACCCAGGCTGGAGATCATGTCTCACTGCAGCCTCGACCTCCCCAGGCTCGGGATCCT
CCCATCTCAGCCTCCTGATTAGCTGGTACTACAGGTGCACACCACCATGCTAGGCAAATT
TTGTGTTTTTTGTAGAGATAGGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGTTTCGAATTCCTGG
GCTCAAGCAATCTGCCCACCTTGGCCTACAAAAGTGTTGGGATTACAGGCATAAGCCATT
GTGCCTGGCCAGATCTTTTATCCTTTAGCCAAATTAATGATTTTCAACTGGAGTGATTTT
GCCTCCCAGAGGACATTGACAACATCTGGAGACATTTTTGGTTATCACAACCAAGGATGT
ACTAATGGCACCTAGTGGGTATCGGCCAAGGATACTGTTAAACATCATGCAATTCATCGG
ACAGCCACCCACCCCTCCACGTCAATAGATCCAGGGCTGAGAAACTCTACCCTAAGAGTA
GTTGAACTATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGTGTCTTGCTCTTTTGCCCATGCTGGAAT
GCAGTGGCGTGATCTTGACTCACTTCAGCTTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTG
CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCAAGCCCAGCTAATTTTTG
TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACATGTTGATCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTC
AGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGC
CCAGCCAAATAGCCATGTTTTTGAAAGCAATGATTTAGGGGTTCTTTATGGTTTAACTGT
GTTTAATACATTGAAGATCAGGCTTAGTGACTTCTCCCAAAAATGTTATTTGTTGTAAAT
AAATTATTATATAAAAACATTAAATTAGCTGGGCTTGGTGTACTCCTCTAGTCCCAGCTG
CTCTGGTGGCTGAAGTGGGAGAATTGATTGAGCCTAGGAGTTCAAGGTTACAATGAGCTA
TGATAACTCCACTGCACTCTAGCCCAGGCAACAGAGTGAGACCGTGTCTCTTAAAAAACA
AAATAGGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGG
GTGGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTTGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCT
ACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCA
GAGAGGCTGAGACCGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCAAGA
TTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA
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TCACAAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAA
AAATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGCTGGTGGGCGCCTATAGTCC
CAGCTACTCGGGAGACTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGT
GAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTCTCAAAACA
ACAACAAAAAAAACGAAAACAAAAGGCGGGGTGCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACA
CTTTGGGAGGCTGAGTTGGGTGGATCACTTGAAGCCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCA
ACATGGTGAAACCTCATCTCTGCTAAAAGTACAAAAATTAGCTGGGCCTCCCAGGATCAA
GCGATTCTCCTTCCTTAGCCTCCCAAGTGGCTGGGATTATAGGCGTGAGCTACCACGTCT
GTCTCTTTTCTTTTTTTTTTGAAACAGAGTTTCACTTTTATTGCCCAGACTGGAGTCCAG
TGGCACAATCTAGGCCCATTGCAACCTCTGTCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC
AGCTTCACAAGCAGCTGGGATTGCGGGCGCGCCATCCCACCCAGCTAATTTTTTGTATTT
TTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTAGTCTTGGAACTCCTGACCTCAGG
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CTGCCTCCCGGGTTCAGGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG
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TGCCCAGGATGGTCTCAATCCCTTGACCTTGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG
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GCCATGATGTAGCCAGGCCAAAGGACAAGCCAGGTTGCATGATGTGAGGGAGATGAGAGA
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CTTGGGATAATTCACACACTAAAGCCTGAGTTCAAGGTTTCTCAGTTGACAGGTAGGTAT
GTAAATCAGGGTTCTCTGGAGTATTTGTAGGACCTGCCATATTTGAGTCCTAACTTGGTG
CAAGTCTGGCAGCTAGGTAGAAAAGGCACTCTAGCAGGTGTGGTAGGAGCACGCCCCAGA
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